クロノバクター・サカザキ

クロノバクター・サカザキ
トリプチケース大豆ブロス寒天 培地上のコロニー
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	シュードモナドタ
クラス：	ガンマプロテオバクテリア
注文：	腸内細菌
家族：	腸内細菌科
属:	クロノバクター
種：	C.サカザキ
二名法名
クロノバクター・サカザキ （ファーマーら1980）[1]

クロノバクター・サカザキは、バクター・サカザキと呼ばれていました^{[2] [3]} 、非常に乾燥した場所でも生息できる日和見性グラム陰性桿菌で、乾燥耐性と呼ばれる現象が見られます。クロノバクター・サカザキは乾燥に耐えるために多くの遺伝子を利用しており^[4]、この乾燥耐性は菌株に特有のものである可能性があります。 ^[5]クロノバクター・サカザキの症例の大半は成人ですが、低出生体重の早産新生児や年長児が最もリスクが高いです。この病原体は乳児の侵襲性感染症のまれな原因であり、歴史的に見ても致死率は高い（40～80%）。 ^{[6] [7] [8] [9]}

乳児では、菌血症、髄膜炎、壊死性腸炎を引き起こす可能性があります。新生児のC. sakazakii感染症のほとんどは、粉ミルクの使用に関連しており^{[7] [9]}、一部の菌株は乾燥状態で 2 年以上生存することができます。^[10]しかし、すべての症例が汚染された乳児用調製粉乳に関連しているわけではありません。2011 年 11 月、Kotex タンポンの出荷数件がCronobacter ( E. sakazakii ) 汚染のために回収されました。ある研究では、畑で栽培された野菜の 12% と水耕栽培の野菜の 13% で病原体が見つかりました。^{[11] [12]}

クロノバクター属細菌（C. condimentiを除く）はすべて、成人または乳児の感染の臨床例と遡及的に関連付けられている。しかし、多座配列タイピング^{[13]では、過去30年間に6か国で発生した新生児髄}膜炎症例の大部分が、クロノバクター・サカザキイ種の「配列タイプ4」または「ST4」と呼ばれる1つの遺伝子系統のみに関連付けられていることが示されており、 ^[14]このクローンが乳児感染において最も懸念されるものと思われる。

この細菌はあらゆる環境や食品から分離されており、どこにでも存在する。クロノバクター感染症のほとんどは成人に発生する。しかし、主な注目を集めているのは、内因的または外因的に汚染された粉ミルクとの関連性である。多座配列解析（MLSA）によると、この属は約4000万年前に誕生し、臨床的に最も重要な種であるC. sakazakiiは約1500万～2300万年前に識別可能であった。^[15]

E. sakazakii は、1980年にJJ Farmer IIIらによって種として定義されました。^[1] DNA-DNAハイブリダイゼーションにより、E. sakazakii は、 Enterobacter属とCitrobacter属という2つの異なる属の種と53～54%関連していることが示されました。しかし、 E. sakazakii内には多様なバイオグループが記載されており、Farmerらは、これらは異なる種を表している可能性があり、解明にはさらなる研究が必要であると示唆しました。^[1]

E. sakazakii株間の分類上の関係は、全長16S rRNA遺伝子配列、DNA-DNA ハイブリダイゼーション、 多座配列タイピング(MLST)、f- AFLP、自動リボタイピングを使用して研究されてきました。この結果、E. sakazakiiは、2007 年に最初に 4 つの命名された種を含む、腸内細菌科内の新しい属Cronobacterとして分類されました。分類は 2008 年に 5 つの命名された種に拡大され、さらに最近 (2011 年) には 7 つの命名された種に拡大されました。^{[2] [3] [16]}

2007年に最初に命名された4種は、Cronobacter sakazakii（2つの亜種を含む）、C. turicensis、C. muytjensii、C. dublinensis（3つの亜種を含む）と、Cronobacter genomospecies Iと呼ばれる無名の種でした^。[16] この分類は2008年に改訂され、5番目の命名種であるC. malonaticusが追加されました。これは2007年にはC. sakazakiiの亜種とされていました。^[2] 2012年に、Cronobacter genomospecies Iは正式にCronobacter universalisに改名され、7番目の種はCronobacter condimentiと呼ばれて記載されました。^[3]

クロノバクター・サカザキとして知られる菌が初めて記録されたのは、1950年に缶入りの粉ミルクから分離したものだったが、この菌はおそらく何百万年も前から存在していた。1980年、ジョン・J・ファーマー3世は、日本の細菌学者坂崎利一に敬意を表して、それまで「黄色色素のE. cloacae」として知られていた菌にエンテロバクター・サカザキという名前を提案した。その後数十年にわたり、 E. sakazakiiは乳児の髄膜炎や敗血症の症例に多数関与しており、その多くは粉乳に関連していた。2007年、E. sakazakiiのバイオグループを収容するためにクロノバクター属が創設され、C. sakazakiiが基準種となった。この属は、生まれたばかりの子供をむさぼり食ったギリシャ神話の巨人クロノスにちなんで名付けられた。 ^[17]

• クロノバクターに関する国際会議
• BacDive - 細菌多様性メタデータベースにおける Cronobacter sakazakii の標準株