ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| CSTF3 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CSTF3、CSTF-77、切断刺激因子サブユニット3 |
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| 外部ID | オミム:600367; MGI : 1351825;ホモロジーン: 1014;ジーンカード:CSTF3; OMA :CSTF3 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体2(マウス)[2] |
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| | バンド | 2 E2|2 54.84 cM | 始める | 104,420,868 bp [2] |
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| 終わり | 104,495,774 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 下垂体前葉
- 上腕二頭筋の腱
- 神経節隆起
- 精巣上体
- 心室帯
- 小脳の右半球
- 右子宮管
- 頬粘膜細胞
- 右精巣
- 精子
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| | トップの表現 | - 原始的な線
- 網膜の神経層
- 上頸部神経節
- 耳板
- 腹壁
- 房室接合部
- 神経節隆起
- 胚葉上層
- 心内膜クッション
- 心室帯
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- スプライソソームを介したmRNAスプライシング
- RNAポリメラーゼII転写の終結
- mRNAポリアデニル化
- mRNAの切断
- RNA処理
- mRNA処理
- mRNA 3'末端処理
- RNA 3'末端処理
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001033505 NM_001033506 NM_001326 |
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NM_001037326 NM_145529 NM_177253 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001028677 NP_001028678 NP_001317 |
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NP_001032403 NP_663504 NP_796227 |
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| 場所 (UCSC) | 11 章: 33.08 – 33.16 Mb | 2 章: 104.42 – 104.5 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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切断刺激因子77kDaサブユニットは、ヒトではCSTF3遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、切断刺激因子複合体 (CSTF)を形成するために結合する 3 つの切断刺激因子 (CSTF1 および CSTF2 を含む)のうちの1 つです。この複合体は、 pre-mRNAのポリアデニル化と 3' 末端切断に関与しています。コードされるタンパク質はホモ二量体として機能し、CSTF 複合体内の CSTF1 および CSTF2 の両方と直接相互作用します。選択的スプライシングにより、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが生成されます。[6]
インタラクション
CSTF3はCSTF2と相互作用することが示されている。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000176102 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027176 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Takagaki Y, Manley JL (1994年12月). 「ポリアデニル化因子サブユニットは、ショウジョウバエのフォークタンパク質抑制因子のヒト相同体である」. Nature . 372 (6505): 471–4. Bibcode :1994Natur.372..471T. doi :10.1038/372471a0. PMID 7984242. S2CID 4329672.
- ^ ab 「Entrez Gene: CSTF3 切断刺激因子、3' pre-RNA、サブユニット 3、77kDa」。
- ^ Takagaki, Y; Manley JL (2000 年 3 月). 「ヒトポリアデニル化機構内の複雑なタンパク質相互作用により、新しい構成要素が特定される」. Mol. Cell. Biol . 20 (5): 1515–25. doi :10.1128/MCB.20.5.1515-1525.2000. ISSN 0270-7306. PMC 85326. PMID 10669729 .
外部リンク
さらに読む
- Takagaki Y, Manley JL (1992). 「ヒトポリアデニル化因子はGタンパク質βサブユニット相同体である」J. Biol. Chem . 267 (33): 23471–4. doi : 10.1016/S0021-9258(18)35861-7 . PMID 1358884.
- Takagaki Y, MacDonald CC, Shenk T, Manley JL (1992). 「ヒト 64 kDa ポリアデニル化因子には、リボ核タンパク質型 RNA 結合ドメインと珍しい補助モチーフが含まれている」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 89 (4): 1403–7. Bibcode :1992PNAS...89.1403T. doi : 10.1073 /pnas.89.4.1403 . PMC 48459. PMID 1741396.
- Murthy KG、 Manley JL (1995)。「ヒト切断ポリアデニル化特異性因子の160kDサブユニットはpre-mRNA 3'末端形成を調整する」。Genes Dev . 9 ( 21): 2672–83。doi : 10.1101/gad.9.21.2672。PMID 7590244。
- Takagaki Y, Manley JL (2000). 「ヒトポリアデニル化機構内の複雑なタンパク質相互作用により、新しい成分が特定される」. Mol. Cell. Biol . 20 (5): 1515–25. doi :10.1128/MCB.20.5.1515-1525.2000. PMC 85326. PMID 10669729 .
- Emili A、Schieltz DM、Yates JR、Hartwell LH (2001)。「DNA損傷チェックポイントタンパク質Rad53とクロマチンアセンブリ因子Asf1の動的相互作用」。Mol . Cell . 7 (1): 13–20. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00150-2 . PMID 11172707。
- Benoit B、Juge F、Iral F、他 (2002)。「キメラヒト CstF-77/Drosophila フォークタンパク質抑制因子は、Drosophila におけるフォーク変異体致死率および mRNA 3' 末端処理の抑制因子を救済する」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 99 (16): 10593–8。Bibcode : 2002PNAS ...9910593B。doi : 10.1073/ pnas.162191899。PMC 124984。PMID 12149458。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Kaufmann I、Martin G、Friedlein A 、et al. (2005)。「ヒト Fip1 は U リッチ RNA エレメントに結合し、ポリ (A) ポリメラーゼを刺激する CPSF のサブユニットです」。EMBO J. 23 (3): 616–26. doi :10.1038/sj.emboj.7600070. PMC 1271804. PMID 14749727 。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Kim J、Bhinge AA、Morgan XC、Iyer VR (2005)。「ゲノムエンリッチメントのシーケンスタグ解析による大規模ゲノムにおける DNA-タンパク質相互作用のマッピング」。Nat . Methods . 2 (1): 47–53. doi :10.1038/nmeth726. PMID 15782160. S2CID 6135437.
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
- Taylor TD、 Noguchi H、Totoki Y、et al. (2006)。「ヒト染色体11のDNA配列と新規遺伝子同定を含む解析」。Nature。440 ( 7083 ) : 497–500。Bibcode : 2006Natur.440..497T。doi : 10.1038/nature04632。PMID 16554811。
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、et al. (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。
- Ewing RM、Chu P、Elisma F、他 (2007)。「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」。Mol . Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 。