ヒトのタンパク質コード遺伝子
| CSTF2 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CSTF2、CstF-64、切断刺激因子サブユニット2 |
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| 外部ID | オミム:300907; MGI : 1343054;ホモロジーン: 80171;ジーンカード:CSTF2; OMA :CSTF2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | X染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | X|X E3 | 始める | 132,959,936 bp [2] |
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| 終わり | 132,987,568 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 卵母細胞
- 二次卵母細胞
- 口腔
- 生殖腺
- 眼瞼結膜
- 咽頭粘膜
- 睾丸
- 神経節隆起
- 頬粘膜細胞
- 鼻咽頭上皮
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| | トップの表現 | - 腹内側核
- 視床下部背内側核
- 視床下部室傍核
- 外側視床下部
- 外側中隔核
- 背側被蓋核
- 前扁桃体領域
- 腹側被蓋野
- 弓状核
- 鉤状部
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 核酸結合
- タンパク質結合
- mRNA結合
- RNA結合
| | 細胞成分 |
- mRNA切断およびポリアデニル化特異性因子複合体
- 胸の谷間
- 核質
- 核
- 核体
| | 生物学的プロセス |
- スプライソソームを介したmRNAスプライシング
- RNAポリメラーゼII転写の終結
- mRNA処理
- mRNA 3'末端処理
- ポリアデニル化に必要なpre-mRNAの切断
- エンドヌクレアーゼによる切断と連結を介したtRNAスプライシング
- mRNAポリアデニル化
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001306206 NM_001306209 NM_001325 |
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NM_001290398 NM_001290399 NM_133196 NM_001359053 NM_001359054 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001293135 NP_001293138 NP_001316 NP_001293135.1 |
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NP_001277327 NP_001277328 NP_573459 NP_001345982 NP_001345983 |
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| 場所 (UCSC) | 染色体X: 100.82 – 100.84 Mb | 染色体X: 132.96 – 132.99 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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切断刺激因子64kDaサブユニットは、ヒトではCSTF2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子は、RRM(RNA認識モチーフ)ドメインを持つ核タンパク質をコードしています。このタンパク質は、 pre-mRNAの3'末端切断とポリアデニル化に関与する切断刺激因子(CSTF)複合体のメンバーです。具体的には、このタンパク質はmRNAの3'非翻訳領域内のGUに富む要素に結合します。[6]
インタラクション
CSTF2はCSTF3、[7] SUB1、[8] SYMPK、[7] BARD1 [9] [10] BRCA1と相互作用することが示されている。[9] [10]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000101811 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031256 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Takagaki Y, MacDonald CC, Shenk T, Manley JL (1992年3月). 「ヒト64kDaポリアデニル化因子にはリボ核タンパク質型RNA結合ドメインと珍しい補助モチーフが含まれている」Proc Natl Acad Sci USA . 89 (4): 1403–7. Bibcode :1992PNAS...89.1403T. doi : 10.1073/pnas.89.4.1403 . PMC 48459 . PMID 1741396.
- ^ ab 「Entrez Gene: CSTF2 切断刺激因子、3' pre-RNA、サブユニット 2、64kDa」。
- ^ ab Takagaki, Y; Manley JL (2000 年 3 月). 「ヒトポリアデニル化機構内の複雑なタンパク質相互作用により、新しい構成要素が特定される」. Mol. Cell. Biol . 20 (5): 1515–25. doi :10.1128/MCB.20.5.1515-1525.2000. ISSN 0270-7306. PMC 85326. PMID 10669729 .
- ^ Calvo, O; Manley JL (2001年5月). 「CstF-64とPC4の進化的に保存された相互作用が転写、ポリアデニル化、終結を結びつける」. Mol. Cell . 7 (5): 1013–23. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00236-2 . ISSN 1097-2765. PMID 11389848.
- ^ ab Kleiman, FE; Manley JL (2001年3月). 「BARD1-CstF-50相互作用はmRNA 3'末端形成とDNA損傷および腫瘍抑制を結びつける」. Cell . 104 (5): 743–53. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00270-7 . ISSN 0092-8674. PMID 11257228.
- ^ ab Kleiman, FE; Manley JL (1999 年 9 月). 「BRCA1 関連 BARD1 とポリアデニル化因子 CstF-50 の機能的相互作用」. Science . 285 (5433): 1576–9. doi :10.1126/science.285.5433.1576. ISSN 0036-8075. PMID 10477523.
外部リンク
さらに読む
- Takagaki Y, Manley JL (1992). 「ヒトポリアデニル化因子はGタンパク質βサブユニット相同体である」J. Biol. Chem . 267 (33): 23471–4. doi : 10.1016/S0021-9258(18)35861-7 . PMID 1358884.
- Murthy KG、 Manley JL (1995)。「ヒト切断ポリアデニル化特異性因子の160kDサブユニットはpre-mRNA 3'末端形成を調整する」。Genes Dev . 9 ( 21): 2672–83。doi : 10.1101/gad.9.21.2672。PMID 7590244。
- Takagaki Y, Manley JL (1994). 「ポリアデニル化因子サブユニットは、ショウジョウバエのフォークタンパク質抑制因子のヒト相同体である」。Nature . 372 ( 6505): 471–4. Bibcode :1994Natur.372..471T. doi :10.1038/372471a0. PMID 7984242. S2CID 4329672.
- Rüegsegger U、Beyer K、Keller W (1996)。「メッセンジャーRNA前駆体の3'末端処理に関与するヒト切断因子Imの精製と特性解析」。J . Biol. Chem . 271 (11): 6107–13. doi : 10.1074/jbc.271.11.6107 . PMID 8626397。
- Schul W、Groenhout B、Koberna K、他 (1996)。「RNA 3' 切断因子 CstF 64 kDa および CPSF 100 kDa は、コイル体および新しく合成された RNA と密接に関連する核ドメインに集中している」。EMBO J. 15 ( 11): 2883–92. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00649.x. PMC 450226. PMID 8654386 。
- Takagaki Y, Seipelt RL, Peterson ML, Manley JL (1997). 「ポリアデニル化因子 CstF-64 は B 細胞分化中の IgM 重鎖プレ mRNA の代替処理を制御する」. Cell . 87 (5): 941–52. doi : 10.1016/S0092-8674(00)82000-0 . PMID 8945520.
- Takagaki Y, Manley JL (1997). 「ヒトポリアデニル化因子CstFによるRNA認識」Mol. Cell. Biol . 17 (7): 3907–14. doi :10.1128/MCB.17.7.3907. PMC 232243. PMID 9199325 .
- Martincic K、Campbell R、Edwalds-Gilbert G、他 (1998)。「G0 期から S 期への移行中のポリアデニル化/切断刺激因子の 64 kDa サブユニットの増加」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 95 ( 19): 11095–100。Bibcode : 1998PNAS ...9511095M。doi : 10.1073/ pnas.95.19.11095。PMC 21601。PMID 9736695。
- Takagaki Y, Manley JL (1999). 「ポリアデニル化因子 CstF-64 のレベルは IgM 重鎖 mRNA の蓄積と B 細胞分化に関連するその他のイベントを制御する」Mol. Cell . 2 (6): 761–71. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80291-9 . PMID 9885564.
- Kleiman FE、Manley JL (1999)。「BRCA1関連BARD1とポリアデニル化因子CstF -50の機能的相互作用」。Science。285 ( 5433): 1576–9。doi : 10.1126 /science.285.5433.1576。PMID 10477523 。
- Takagaki Y, Manley JL (2000). 「ヒトポリアデニル化機構内の複雑なタンパク質相互作用により、新しい成分が特定される」. Mol. Cell. Biol . 20 (5): 1515–25. doi :10.1128/MCB.20.5.1515-1525.2000. PMC 85326. PMID 10669729 .
- Dass B、McMahon KW、Jenkins NA、他 (2001)。「ポリアデニル化タンパク質 CstF-64 の変異体の遺伝子は 19 番染色体上にあり、マウスのパキテン期精母細胞で発現している」。J . Biol. Chem . 276 (11): 8044–50. doi : 10.1074/jbc.M009091200 . PMID 11113135。
- Kleiman FE、Manley JL (2001)。「BARD1-CstF-50相互作用はmRNA 3'末端形成とDNA損傷および腫瘍抑制を結び付ける」。Cell . 104 (5): 743–53. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00270-7 . PMID 11257228。
- Calvo O、Manley JL (2001)。「CstF-64とPC4の進化的に保存された相互作用は転写、ポリアデニル化、終結を結びつける」。Mol . Cell . 7 (5): 1013–23. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00236-2 . PMID 11389848。
- Bléoo S、Sun X、Hendzel MJ、et al. (2002)。「ヒトDEADボックスタンパク質DDX1とpre-mRNAの3'末端処理に関与する切断刺激因子との関連」。Mol . Biol. Cell . 12 (10): 3046–59. doi :10.1091/mbc.12.10.3046. PMC 60154. PMID 11598190 。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Pérez Cañadillas JM、Varani G (2003)。「ヒトCstF-64タンパク質によるGUリッチポリアデニル化調節要素の認識」。EMBO J. 22 (11): 2821–30. doi :10.1093/emboj/cdg259. PMC 156756. PMID 12773396 。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Xing H、Mayhew CN、Cullen KE、et al. (2004)。「シンプレキンとの相互作用による HSF1 による Hsp70 mRNA ポリアデニル化の調節」。J . Biol. Chem . 279 (11): 10551–5. doi : 10.1074/jbc.M311719200 . PMID 14707147。