CPSF6

CPSF6
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	3P5T、3P6Y、3Q2S、3Q2T、4B4N、4U0A、4U0B、4WYM
識別子
エイリアス	CPSF6、CFIM、CFIM68、HPBRII-4、HPBRII-7、切断およびポリアデニル化特異因子6、CFIM72
外部ID	オミム: 604979; MGI : 1913948;ホモロジーン: 134126;ジーンカード：CPSF6; OMA :CPSF6 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体12（ヒト）
終わり	69,274,358 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体10（マウス）
終わり	117,215,920 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	神経節隆起; ; 骨髄細胞; ; アキレス腱; ; 心室帯; ; 扁桃腺; ; 左卵巣; ; 右卵巣; ; 付録; ; 腓骨神経; ; 子宮内膜;
	トップの表現
	上頸部神経節; ; 手; ; 耳石器官; ; 卵形嚢; ; 下顎突出; ; 積雲細胞; ; 三叉神経節; ; 上顎突出; ; 腹壁; ; 神経節隆起;
	参照表現データの詳細
	; ;
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質結合; mRNA結合; RNA結合; 核酸結合; リボソーム大サブユニット結合; エクソン-エクソン接合複合体結合;
細胞成分	パラスペックル; 膜; 核; 核質; 核の粒; mRNA切断因子複合体; ペリクロマチン線維; 細胞質; mRNA切断およびポリアデニル化特異性因子複合体; インタークロマチン顆粒; リボ核タンパク質複合体;
生物学的プロセス	mRNAポリアデニル化; mRNA処理; タンパク質四量体化; 核からのRNA輸出の正の調節; タンパク質ヘテロ四量体化; ポリアデニル化に必要なpre-mRNAの切断; mRNA代替ポリアデニル化; メッセンジャーリボ核タンパク質複合体の組み立て;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	11052
	432508
	ENSG00000111605
	ENSMUSG00000055531
	Q16630
	翻訳:
	NM_001300947 ; NM_007007
	NM_001013391 ; NM_001310609
	NP_001287876 ; NP_008938
	NP_001013409 ; NP_001297538
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

切断およびポリアデニル化特異性因子サブユニット6は、ヒトではCPSF6遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]^[7]

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、3' RNA 切断およびポリアデニル化処理に必要な切断因子のサブユニットの 1 つです。タンパク質と RNA の相互作用は、3' 末端処理複合体の組み立てにおける最も初期のステップの 1 つであり、他の処理因子のリクルートメントを促進します。切断因子複合体は 4 つのポリペプチドで構成されています。この遺伝子は 68kD サブユニットをコードします。スプライソソームタンパク質を彷彿とさせるドメイン構成を持っています。^[7]

インタラクション

CPSF6はWWP1 ^[8]およびPLSCR1 ^[8]と相互作用することが示されている。

CPSF6はHIV-1カプシドの核内輸送と統合に重要な役割を果たしている。 ^[9]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000111605 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000055531 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Rüegsegger U、Blank D、Keller W (1998年1月)。「ヒトのプレmRNA切断因子ImはスプライソソームSRタンパク質に関連し、組み換えサブユニットからin vitroで再構成できる」。分子細胞。1 (2): 243– 53。doi : 10.1016/ S1097-2765 (00)80025-8。PMID 9659921。
^ Cardinale S, Cisterna B, Bonetti P, Aringhieri C, Biggiogera M, Barabino SM (2007 年 4 月). 「Pre-mRNA 3' 末端処理因子である哺乳類切断因子 I 68-kDa サブユニットの核内局在と動態」.細胞の分子生物学. 18 (4): 1282– 92. doi :10.1091/mbc.E06-09-0846. PMC 1838998. PMID 17267687 .
^ ab 「Entrez Gene: CPSF6 切断およびポリアデニル化特異因子 6、68kDa」。
^ ab Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, et al. (2005年10月). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」. Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Müller TG、Zila V、Müller B、 Kräusslich HG （2022年9月29日）。「HIV-1の核カプシド脱殻と逆転写」。Annual Review of Virology。9（1）：261–284。doi：10.1146 /annurev-virology-020922-110929。PMID 35704745。

外部リンク

UCSC ゲノムブラウザのヒト CPSF6 ゲノムの位置と CPSF6 遺伝子の詳細ページ。

さらに読む

Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」. Gene . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Rüegsegger U、Beyer K 、 Keller W (1996 年 3 月)。「メッセンジャー RNA 前駆体の 3' 末端処理に関与するヒト切断因子 Im の精製と特性評価」。The Journal of Biological Chemistry。271 ( 11): 6107–13。doi : 10.1074/ jbc.271.11.6107。PMID 8626397。
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
de Vries H、Rüegsegger U、Hübner W、Friedlein A、Langen H、Keller W (2000 年 11 月)。「ヒトの pre-mRNA 切断因子 II(m) には酵母タンパク質の相同体が含まれており、他の 2 つの切断因子を橋渡しする」。EMBO Journal。19 ( 21 ) : 5895– 904。doi : 10.1093 /emboj/19.21.5895。PMC 305781。PMID 11060040。
Awasthi S、Alwine JC (2003 年 11 月)。「ポリアデニル化切断因子 I と U1 snRNP の関連」。RNA . 9 ( 11): 1400–9 . doi :10.1261/rna.5104603. PMC 1287061. PMID 14561889 。
Brown KM、 Gilmartin GM (2003 年 12 月)。「ヒト切断因子 Im による pre - mRNA 3 ' プロセシングの制御メカニズム」。分子細胞。12 (6): 1467–76。doi : 10.1016/S1097-2765(03) 00453-2。PMID 14690600。
Dettwiler S、Aringhieri C、Cardinale S、Keller W、Barabino SM (2004 年 8 月)。「切断因子 Im の 68 kDa サブユニット内の異なる配列モチーフが RNA 結合、タンパク質間相互作用、および細胞内局在を仲介する」 ( PDF )。The Journal of Biological Chemistry。279 ( 34): 35788– 97。doi : 10.1074 / jbc.M403927200。PMID 15169763。S2CID 39752996 。
Venkataraman K、Brown KM、 Gilmartin GM (2005 年 6 月)。「非標準的なポリ (A) 部位の分析により、脊椎動物のポリ (A) 部位認識の 3 者間メカニズムが明らかになりました」。遺伝子と発達。19 ( 11): 1315– 27。doi :10.1101/gad.1298605。PMC 1142555。PMID 15937220。
ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實＝岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセットスタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005 年 10 月）。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Millevoi S、Loulergue C、Dettwiler S、Karaa SZ、Keller W、Antoniou M、Vagner S (2006 年 10 月)。「U2AF 65 と CF I(m) の相互作用がスプライシングと 3' 末端処理機構を結び付ける」。EMBOジャーナル。25 ( 20 ): 4854– 64。doi :10.1038 / sj.emboj.7601331。PMC 1618107。PMID 17024186。
Ewing RM、Chu P、Elisma F、Li H、Taylor P、Climie S、McBroom-Cerajewski L、Robinson MD、O'Connor L、Li M、Taylor R、Dharsee M、Ho Y、Heilbut A、Moore L、Zhang S、Ornatsky O、Bukhman YV、Ethier M、Sheng Y、Vasilescu J、Abu-Farha M、Lambert JP、Duewel HS、Stewart II、Kuehl B、Hogue K、Colwill K、Gladwish K、Muskat B、Kinach R、Adams SL、Moran MF、Morin GB、Topaloglou T、Figeys D (2007)。「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」。分子システム生物学。3 (1): 89。doi : 10.1038/msb4100134。PMC 1847948。PMID 17353931 。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000111605 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000055531 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid9659921-5] ^ Rüegsegger U、Blank D、Keller W (1998年1月)。「ヒトのプレmRNA切断因子ImはスプライソソームSRタンパク質に関連し、組み換えサブユニットからin vitroで再構成できる」。分子細胞。1 (2): 243– 53。doi : 10.1016/ S1097-2765 (00)80025-8。PMID 9659921。

[pmid17267687-6] Cardinale S, Cisterna B, Bonetti P, Aringhieri C, Biggiogera M, Barabino SM (2007 年 4 月). 「Pre-mRNA 3' 末端処理因子である哺乳類切断因子 I 68-kDa サブユニットの核内局在と動態」.細胞の分子生物学. 18 (4): 1282– 92. doi :10.1091/mbc.E06-09-0846. PMC 1838998. PMID 17267687 .

[entrez-7] 「Entrez Gene: CPSF6 切断およびポリアデニル化特異因子 6、68kDa」。

[pmid16189514-8] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, et al. (2005年10月). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」. Nature . 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[9] ^ Müller TG、Zila V、Müller B、 Kräusslich HG （2022年9月29日）。「HIV-1の核カプシド脱殻と逆転写」。Annual Review of Virology。9（1）：261–284。doi：10.1146 /annurev-virology-020922-110929。PMID 35704745。