ヒトのタンパク質コード遺伝子
| COPS7A |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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4D10、4D18、4WSN |
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| 識別子 |
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| エイリアス | COPS7A、CSN7A、SGN7a、CSN7、COP9 シグナロソーム サブユニット 7A |
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| 外部ID | オミム:616009; MGI : 1349400;ホモロジーン: 22685;ジーンカード:COPS7A; OMA :COPS7A - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体6(マウス)[2] |
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| | バンド | 6 F2|6 59.17 cM | 始める | 124,935,376 bp [2] |
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| 終わり | 124,942,501 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 前頭前皮質
- 子宮内膜間質細胞
- 右前頭葉
- 帯状回
- 前帯状皮質
- ブロードマン領域9
- 心の頂点
- 右副腎
- 右副腎皮質
- 腓腹筋
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| | トップの表現 | - 精母細胞
- 精子細胞
- 太ももの筋肉
- 胎児の尾
- 性器結節
- 卵黄嚢
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 上前頭回
- リップ
- 胚盤胞
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 転写連動ヌクレオチド除去修復
- ヌクレオチド除去修復、DNA損傷認識
- タンパク質の脱エデジレーション
- 翻訳後タンパク質修飾
- ウイルスプロセス
- COP9シグナロソームアセンブリ
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001164093 NM_001164094 NM_001164095 NM_016319 |
| NM_001164089 NM_012003 NM_001355541 NM_001355542 NM_001379119
|
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NM_001379120 NM_001379122 NM_001379123 NM_001379124 NM_001379125 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001157565 NP_001157566 NP_001157567 NP_057403 |
| NP_001157561 NP_036133 NP_001342470 NP_001342471 NP_001366048
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NP_001366049 NP_001366051 NP_001366052 NP_001366053 NP_001366054 |
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| 場所 (UCSC) | 12 章: 6.72 – 6.73 Mb | 6 章: 124.94 – 124.94 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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COP9シグナロソーム複合体サブユニット7aは、ヒトではCOPS7A遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000111652 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000030127 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: COPS7A COP9 構成的光形態形成ホモログサブユニット 7A (Arabidopsis)」.
外部リンク
さらに読む
- Wolf DA、Zhou C、Wee S (2004)。「COP9 シグナロソーム: Cullin ユビキチンリガーゼの組み立てと維持のプラットフォーム?」Nat. Cell Biol . 5 (12): 1029–33. doi :10.1038/ncb1203-1029. PMID 14647295. S2CID 37458780.
- Seeger M、Kraft R、Ferrell K、Bech-Otschir D、Dumdey R、Schade R、et al. (1998)。「26Sプロテアソームサブユニットとの類似性を持つシグナル伝達に関与する新規タンパク質複合体」。FASEB J. 12 ( 6): 469–78. doi : 10.1096/fasebj.12.6.469 . PMID 9535219. S2CID 25424324.
- Wei N, Tsuge T, Serino G, Dohmae N, Takio K, Matsui M, et al. (1998). 「COP9 複合体は植物と哺乳類の間で保存されており、26S プロテアソーム調節複合体と関連している」。Curr . Biol . 8 (16): 919–22. Bibcode :1998CBio....8..919W. doi : 10.1016/S0960-9822(07)00372-7 . PMID 9707402. S2CID 13873982.
- Bech-Otschir D, Kraft R, Huang X, Henklein P, Kapelari B, Pollmann C, et al. (2001). 「COP9 シグナルソーム特異的リン酸化は、ユビキチンシステムによる p53 の分解を標的とする」。EMBO J. 20 ( 7): 1630–9. doi : 10.1093 /emboj/20.7.1630. PMC 145508. PMID 11285227.
- Lyapina S, Cope G, Shevchenko A, Serino G, Tsuge T, Zhou C, et al. (2001). 「COP9 シグナロソームによる NEDD-CUL1 結合体切断の促進」. Science . 292 (5520): 1382–5. Bibcode :2001Sci...292.1382L. doi :10.1126/science.1059780. PMID 11337588. S2CID 14224920.
- Wang Y、Devereux W、Stewart TM、Casero RA (2002)。「ポリアミン調節因子 1 は、シロイヌナズナ COP9 シグナロソームの 7a サブユニットのヒトホモログに結合する: 遺伝子発現への影響」。Biochem . J. 366 ( Pt 1): 79–86. doi :10.1042/BJ20020211. PMC 1222765. PMID 12020345 。
- Hoareau Alves K、Bochard V、Réty S、Jalinot P (2002)。「哺乳類のプロトオンコプロテイン Int-6 と 3 つのタンパク質複合体 eIF3、COP9 シグナロソーム、26S プロテアソームとの関連」。FEBS Lett . 527 (1–3): 15–21. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03147-2 . PMID 12220626. S2CID 39308598.
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、Derge JG、Klausner RD、Collins FS、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ...9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Serino G、Su H、Peng Z、Tsuge T、Wei N、Gu H、et al. (2003)。「アラビドプシス COP9 シグナロソームの最後のサブユニットの特性: 複合体の全体構造と起源への影響」。 植物細胞。15 ( 3 ): 719–31。doi :10.1105 / tpc.009092。PMC 150025。PMID 12615944。
- Uhle S, Medalia O, Waldron R, Dumdey R, Henklein P, Bech-Otschir D, et al. (2003). 「タンパク質キナーゼ CK2 とタンパク質キナーゼ D は COP9 シグナロソームと関連している」. EMBO J. 22 ( 6): 1302–12. doi :10.1093/emboj/cdg127. PMC 151059. PMID 12628923.
- Groisman R, Polanowska J, Kuraoka I, Sawada JI, Saijo M, Drapkin R, et al. (2003). 「DDB2 および CSA 複合体のユビキチンリガーゼ活性は、DNA 損傷に応答して COP9 シグナロソームによって異なる制御を受ける」. Cell . 113 (3): 357–67. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00316-7 . PMID 12732143. S2CID 11639677.
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、大月 孝文、杉山 孝文、入江 亮、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、Shenmen CM、Grouse LH、Schuler G、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Obuse C, Iwasaki O, Kiyomitsu T, Goshima G, Toyoda Y, Yanagida M (2004). 「保存された Mis12 セントロメア複合体はヘテロクロマチン HP1 および外側キネトコアタンパク質 Zwint-1 にリンクされています」。Nat . Cell Biol . 6 (11): 1135–41. doi :10.1038/ncb1187. PMID 15502821. S2CID 39408000.
- Stelzl U、Worm U、Lalowski M、Haenig C、Brembeck FH、Goehler H、et al. (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワーク:プロテオーム注釈リソース」。Cell . 122 ( 6): 957–68. doi :10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070. S2CID 8235923.