ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| CLK3 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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2EU9、2EXE、2WU6、2WU7、3RAW |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CLK3、PHPHCLK3/152、CDC 様キナーゼ 3 |
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| 外部ID | オミム:602990; MGI : 1098670;ホモロジーン: 101534;ジーンカード:CLK3; OMA :CLK3 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 9番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 9|9 B | 始める | 57,657,907 bp [2] |
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| 終わり | 57,673,143 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 顆粒球
- 左精巣
- 右精巣
- 単球
- 下垂体前葉
- 甲状腺の左葉
- 横行結腸粘膜
- 脚の皮膚
- 小唾液腺
- 腹部の皮膚
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| | トップの表現 | - 胸腺
- 顆粒球
- リップ
- 太ももの筋肉
- 大動脈弁
- 上行大動脈
- 網膜の神経層
- 胎児肝臓造血前駆細胞
- 舌の上側
- 精子細胞
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- トランスフェラーゼ活性
- ヌクレオチド結合
- タンパク質キナーゼ活性
- キナーゼ活性
- タンパク質セリン/スレオニンキナーゼ活性
- タンパク質結合
- タンパク質セリン/スレオニン/チロシンキナーゼ活性
- タンパク質チロシンキナーゼ活性
- ATP結合
- 同一のタンパク質結合
- RNA結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- 核の粒
- 膜
- 核質
- 先体小胞
- 中間径フィラメント細胞骨格
- 細胞質小胞
- 核
| | 生物学的プロセス |
- リン酸化
- タンパク質リン酸化
- RNAスプライシングの調節
- タンパク質の自己リン酸化
- ペプチジルチロシンリン酸化
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001130028 NM_001292 NM_003992 |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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| 場所 (UCSC) | 15 章: 74.6 – 74.65 Mb | 9 章: 57.66 – 57.67 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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二重特異性タンパク質キナーゼCLK3は、ヒトではCLK3遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6]
CLK3遺伝子は、非保存的N末端ドメインを持つセリン/スレオニン型タンパク質キナーゼをコードしている。長いアイソフォームと短いアイソフォーム(phclk3とpclk3/152)は選択的スプライシングの結果であり、異なる組織に共存する。アイソフォームphclk3/152にはキナーゼドメインがない。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000179335 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000032316 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Hanes J、von der Kammer H、Klaudiny J、Scheit KH (1995 年 1 月)。「2 つの新しいヒトタンパク質キナーゼの cDNA クローニングによる特性評価。新しい哺乳類タンパク質キナーゼ ファミリーの配列比較による証拠」。J Mol Biol . 244 (5): 665–72. doi :10.1006/jmbi.1994.1763. PMID 7990150。
- ^ Talmadge CB、Finkernagel S、 Sumegi J、 Sciorra L 、 Rabinow L (1998 年 12 月)。「3 つのヒト LAMMER タンパク質キナーゼをコードする遺伝子の染色体マッピング」。Hum Genet。103 (4) : 523–4。doi :10.1007/s004390050861。PMID 9856501。S2CID 40593571 。
- ^ 「Entrez Gene: CLK3 CDC 様キナーゼ 3」。
さらに読む
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). 「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Duncan PI、Stojdl DF、Marius RM、et al. (1998)。「Clk2 および Clk3 二重特異性タンパク質キナーゼは SR タンパク質の核内分布を制御し、pre-mRNA スプライシングに影響を与える」。Exp . Cell Res . 241 (2): 300–8. doi :10.1006/excr.1998.4083. PMID 9637771。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Hillman RT、Green RE、 Brenner SE (2005)。「RNA 監視の過小評価さ れた役割」。Genome Biol . 5 (2): R8。doi : 10.1186 /gb-2004-5-2- r8。PMC 395752。PMID 14759258。
- Jin J、Smith FD、Stark C、他 (2004)。「細胞骨格調節と細胞組織化に関与する生体内 14-3-3 結合タンパク質のプロテオーム、機能、およびドメインベースの分析」。Curr . Biol . 14 ( 16 ): 1436–50。Bibcode : 2004CBio ...14.1436J。doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051。PMID 15324660。S2CID 2371325 。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、et al. (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983。
- Wissing J、Jänsch L、Nimtz M、他 (2007)。「標的クラス選択的前分画およびタンデム質量分析によるタンパク質キナーゼのプロテオミクス分析」。Mol . Cell. Proteomics . 6 (3): 537–47. doi : 10.1074/mcp.T600062-MCP200 . hdl : 10033/19756 . PMID 17192257.
外部リンク