ヒトのタンパク質コード遺伝子
クリップ1 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2CP5、2CP6、2E3H、2E3I、2E4H、2HQH、2QK0、3E2U、3RDV
識別子 エイリアス CLIP1 、CLIP、CLIP-170、CLIP170、CYLN1、RSN、CAP-Glyドメイン含有リンカータンパク質1 外部ID オミム : 179838; MGI : 1928401; ホモロジーン : 74455; ジーンカード ：CLIP1; OMA :CLIP1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 5番染色体（マウス） [2] バンド 5|5 女性 始める 123,577,795 bp [2] 終わり 123,684,618 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 上腕二頭筋 頬粘膜細胞 腹直筋の骨格筋組織 上腕二頭筋の骨格筋組織 腓腹筋 太ももの筋肉 上腕二頭筋の腱 精巣上体の尾 歯肉上皮 羊水
トップの表現 外側広筋 太ももの筋肉 上腕三頭筋 側頭筋 腓腹筋の内側頭 胸鎖乳突筋 二腹筋 前脛骨筋 ヒラメ筋 小脳葉
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質ホモ二量体化活性 微小管結合 微小管プラス端結合 金属イオン結合 チューブリン結合 タンパク質結合 亜鉛イオン結合 同一のタンパク質結合 細胞成分
細胞質 エンドソーム 中心体 細胞投影 膜 微小管細胞骨格 フリル 微小管プラス端 マクロピノソーム 細胞質微小管 微小管 細胞骨格 中間径フィラメント 細胞質小胞膜 細胞質小胞 動原体 核膜 細胞質 生物学的プロセス
微小管束の形成 微小管重合の正の制御 タンパク質の細胞膜ラフトへの輸送 有糸分裂細胞周期 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001247997 NM_002956 NM_198240 NM_001389291
NM_001291229 NM_019765 NM_001347468 NM_001359220 NM_001359221 NM_001359222 NM_001359223 NM_001359224
RefSeq (タンパク質) NP_001234926 NP_002947 NP_937883
NP_001278158 NP_001334397 NP_062739 NP_001346149 NP_001346150 NP_001346151 NP_001346152 NP_001346153
場所 (UCSC) 12 章: 122.27 – 122.42 Mb 5 章: 123.58 – 123.68 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
CAP-Glyドメイン含有リンカータンパク質1は CLIP1 としても知られ 、ヒトでは CLIP1 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である。 [5]
インタラクション CLIP1はIQGAP1 [6] 、 哺乳類ラパマイシン標的 [7] 、 PAFAH1B1 [8] と 相互作用する ことが示されている 。
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000130779 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000049550 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「Entrez Gene: リンカータンパク質1を含むCLIP1 CAP-GLYドメイン」。 ^ Fukata M, Watanabe T, Noritake J, Nakagawa M, Yamaga M, Kuroda S, Matsuura Y, Iwamatsu A, Perez F, Kaibuchi K (2002年6月). 「Rac1とCdc42はIQGAP1とCLIP-170を介して微小管を捕捉する」. Cell . 109 (7): 873–85. doi : 10.1016/S0092-8674(02)00800-0 . PMID 12110184. S2CID 15158637. ^ Choi JH、Bertram PG、Drenan R、Carvalho J、Zhou HH、Zheng XF (2002 年 10 月)。「FKBP12-ラパマイシン関連タンパク質 (FRAP) は CLIP-170 キナーゼである」。EMBO レポート 。3 ( 10 ) : 988–94。doi :10.1093/ embo -reports/kvf197。PMC 1307618。PMID 12231510 。 ^ コケル FM、カスピ M、コルデリエール FP、ドンピエール JP、デュジャルダン DL、コイフマン C、マーティン P、 ホーゲンラード CC 、アフマノバ A、ガルジャルト N、デ メイ JR、ライナー O (2002 年 5 月)。 「LIS1、CLIP-170のダイニン/ダイナクチン経路の鍵」。 分子および細胞生物学 。 22 (9): 3089–102。 土井 ：10.1128/MCB.22.9.3089-3102.2002。 PMC 133759 。 PMID 11940666。
外部リンク
さらに読む
Galjart N (2005 年6 月)。「CLIP と CLASP および 細胞ダイナミクス」。Nature Reviews Molecular Cell Biology。6 ( 6): 487–98。doi :10.1038/nrm1664。PMID 15928712。S2CID 23216754 。 Pierre P、Scheel J、Rickard JE、Kreis TE (1992 年 9 月)。「CLIP-170 はエンドサイトーシス小胞を微小管にリンクします」。Cell . 70 ( 6): 887–900. doi :10.1016/0092-8674(92)90240-D. PMID 1356075. S2CID 41119165. ビルベ G、デラビー J、ブリュッヘン J、リヒナー H、アッセルベルグ FA、チェルレッティ N、ゾルグ C、オディンク K、タルクサイ L、ヴィーゼンダンガー W (1992 年 6 月)。 「レスティン：ホジキン病のリード・スタンバーグ細胞で高度に発現される新規な中間径フィラメント関連タンパク質」。 EMBO ジャーナル 。 11 (6): 2103–13。 土井 ：10.1002/j.1460-2075.1992.tb05269.x。 PMC 556677 。 PMID 1600942。 Pierre P、Pepperkok R、Kreis TE (1994年 7 月)。「CLIP-170 の 2 つの機能ドメインの in vivo での分子特性」。Journal of Cell Science。107 ( 7): 1909–20。doi : 10.1242/jcs.107.7.1909。PMID 7983157 。 ヒリカー C、デラビー J、スペレマン F、ビルベ G、ブリュッヘン J、ヴァン ルーベン F、ヴァン デン ベルゲ H (1993)。 「ホジキン病におけるリード・スタンバーグ細胞のマーカーであるレスチンをコードする遺伝子（RSN）のヒト染色体バンド12q24.3への局在化とその遺伝子座のYACクローニング」。 細胞遺伝学と細胞遺伝学 。 65 (3): 172-6。 土井 ：10.1159/000133625。 PMID 8222754。 Griparic L、Keller TC (1998年 10 月)。「筋肉で主に発現する 2 つの新規 CLIP-170/Restin アイソフォームの同定と発現」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research。1405 ( 1–3): 35–46。doi : 10.1016 / S0167-4889 (98)00096-2。PMID 9784600 。 Perez F、Diamantopoulos GS、Stalder R、Kreis TE (1999 年 2 月)。「CLIP-170 は生体内で成長する微小管末端を強調表示します」。Cell . 96 (4): 517–27. doi : 10.1016/S0092-8674 ( 00)80656-X . PMID 10052454. S2CID 18082011. アフマノバ A、ホーゲンラード CC、ドラベック K、ステパノバ T、ドルトランド B、フェルケルク T、フェルミューレン W、バーゲリング BM、デ ゼーウ CI、グロスヴェルド F、ガルジャルト N (2001 年 3 月)。 「クラスプは、運動性線維芽細胞における微小管動態の局所的調節に関与するCLIP-115および-170関連タンパク質です。」 セル 。 104 (6): 923–35。 土井 ： 10.1016/S0092-8674(01)00288-4 。 PMID 11290329。S2CID 14443149 。 コケル FM、カスピ M、コルデリエール FP、ドンピエール JP、デュジャルダン DL、コイフマン C、マーティン P、ホーゲンラード CC、アクマノバ A、ガルジャルト N、デ メイ JR、ライナー O (2002 年 5 月)。 「LIS1、CLIP-170のダイニン/ダイナクチン経路の鍵」。 分子および細胞生物学 。 22 (9): 3089–102。 土井 ：10.1128/MCB.22.9.3089-3102.2002。 PMC 133759 。 PMID 11940666。 Griffith KJ、Ryan JP、Senécal JL、 Fritzler MJ (2002 年 3 月)。「細胞質リンカータンパク質 CLIP-170 は ヒト自己抗原である」。 臨床および実験免疫学 。127 ( 3 ): 533–8。doi :10.1046/j.1365-2249.2002.01756.x。PMC 1906301。PMID 11966772 。 Fukata M, Watanabe T, Noritake J, Nakagawa M, Yamaga M, Kuroda S, Matsuura Y, Iwamatsu A, Perez F, Kaibuchi K (2002 年 6 月). 「Rac1 と Cdc42 は IQGAP1 と CLIP-170 を介して微小管を捕捉する」. Cell . 109 (7): 873–85. doi : 10.1016/S0092-8674(02)00800-0 . PMID 12110184. S2CID 15158637. Choi JH、Bertram PG、Drenan R、Carvalho J、Zhou HH、Zheng XF (2002 年 10 月)。「FKBP12 ラパマイシン関連タンパク質 (FRAP) は CLIP-170 キナーゼです」。EMBO レポート 。3 ( 10 ) : 988–94。doi :10.1093/embo-reports/kvf197。PMC 1307618。PMID 12231510 。 Sahin U、Neumann F、Tureci O、Schmits R、Perez F、Pfreundschuh M (2002 年 12 月)。「ホジキン細胞およびリード・シュテルンベルグ細胞関連自己抗原 CLIP-170/restin は樹状細胞のマーカーであり、マクロピノソームの細胞骨格への輸送に関与しており、ホジキン細胞およびリード・シュテルンベルグ細胞の機能ベースの概念を裏付けています」。Blood . 100 ( 12): 4139–45. doi : 10.1182/blood.V100.12.4139 . PMID 12433698。 Goodson HV、Skube SB、Stalder R、Valetti C、Kreis TE、Morrison EE、Schroer TA (2003 年 7 月)。「CLIP-170 は、ダイナクチン複合体および APC 結合タンパク質 EB1 と異なるメカニズムで相互作用します」。 細胞 運動 性と細胞骨格 。55 (3): 156–73。doi :10.1002/cm.10114。PMID 12789661 。 Ho SM、Lau KM、Mok SC、 Syed V (2003 年 7 月)。「正常および悪性ヒト卵巣表面上皮細胞における 卵胞刺激ホルモン 誘発 性遺伝子発現変化のプロファイリング」。Oncogene。22 ( 27 ): 4243–56。doi : 10.1038/sj.onc.1206437。PMID 12833147 。 Beausoleil SA、Jedrychowski M、Schwartz D、Elias JE、Villén J、Li J、Cohn MA、Cantley LC、Gygi SP (2004 年 8 月)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。101 (33): 12130–5。Bibcode : 2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073 / pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935 。 Ballif BA、Villén J、Beausoleil SA、Schwartz D 、 Gygi SP (2004 年 11 月)。「発達中のマウス脳のホスホプロテオミクス解析」。 分子および細胞プロテオミクス 。3 (11): 1093–101。doi : 10.1074/mcp.M400085- MCP200。PMID 15345747 。 Watanabe T, Wang S, Noritake J, Sato K, Fukata M, Takefuji M, Nakagawa M, Izumi N, Akiyama T, Kaibuchi K (2004 年 12 月)。「IQGAP1 との相互作用により、細胞分極および移動中に APC が Rac1、Cdc42、およびアクチンフィラメントにリンクされる」。Developmental Cell。7 ( 6 ) : 871–83。doi : 10.1016/ j.devcel.2004.10.017。PMID 15572129 。
