ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| CLIC4 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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2AHE、2D2Z、3OQS |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CLIC4、CLIC4L、H1、MTCLIC、huH1、p64H1、塩化物細胞内チャネル4 |
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| 外部ID | オミム:606536; MGI : 1352754;ホモロジーン: 8490;ジーンカード:CLIC4; OMA :CLIC4 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体4(マウス)[2] |
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| | バンド | 4|4 D3 | 始める | 134,941,280 bp [2] |
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| 終わり | 135,000,125 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 伏在静脈
- 精巣上体の尾
- 膝窩動脈
- 脛骨動脈
- 大静脈
- 胸部大動脈下行
- 平滑筋組織
- 上行大動脈
- 右冠動脈
- 尿道
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| | トップの表現 | - 原腸胚
- 右肺
- 右肺葉
- 脱落膜
- 上行大動脈
- 左心室の心筋組織
- 坐骨神経
- 半月弁
- 左肺
- 房室弁
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 電位依存性イオンチャネル活性
- タンパク質結合
- グルタチオントランスフェラーゼ活性
- 塩素イオンチャネル活性
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- 膜の不可欠な構成要素
- 細胞質
- 中心体
- 膜
- 細胞間結合
- 核マトリックス
- 微小管細胞骨格
- 細胞膜
- 細胞の頂端部分
- 細胞内解剖構造
- 塩化物チャネル複合体
- 微小管形成中心
- 微絨毛
- 細胞表面
- 細胞接合
- 胴体
- ミトコンドリア
- アクチン細胞骨格
- 細胞質の核周囲領域
- 細胞外エクソソーム
- 細胞骨格
- 細胞質小胞膜
- 細胞質小胞
- 核
| | 生物学的プロセス |
- カルシウムイオンに対する細胞反応
- 細胞分化
- 多細胞生物の成長
- イオン膜輸送の調節
- 内皮細胞の形態形成
- イオン輸送
- ケラチノサイトの分化
- 液胞の酸性化
- 細胞移動の負の調節
- 受精
- 頂端/基底細胞極性の確立または維持
- 塩化物輸送
- 上皮管の分岐形態形成
- カメラ型眼における網膜血管の形態形成
- 細胞骨格組織の調節
- 血管新生
- グルタチオンの代謝プロセス
- 塩化物膜輸送
- 輸送
- イオン膜輸送
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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塩素イオン細胞内チャネル4はCLIC4、p644H1、HuH1としても知られ、真核生物の遺伝子です。[5]
塩素チャネルは、細胞膜電位の安定化、経上皮輸送、細胞内 pHの維持、細胞容積の調節など、基本的な細胞プロセスを制御する多様なタンパク質群です。clic4遺伝子によってコードされる塩素細胞内チャネル 4 (CLIC4) タンパク質は p64 ファミリーのメンバーであり、この遺伝子は多くの組織で発現しています。これらのチャネルは、血管新生、肺高血圧、癌、虚血再灌流障害からの心臓保護に関係しています。PANC -1細胞 (膵臓癌細胞)では、細胞内小胞パターンを示します。 [5]
拘束力のあるパートナー
CLIC4はダイナミンI、α-チューブリン、β-アクチン、クレアチンキナーゼおよび2つの14-3-3アイソフォームに結合します。 [6]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000169504 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000037242 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab 「Entrez Gene: CLIC4 塩化物細胞内チャネル 4」。
- ^ Suginta W、Karoulias N、Aitken A、Ashley RH (2001 年 10 月)。「塩化物細胞内チャネルタンパク質 CLIC4 (p64H1) は、アクチン、チューブリン、14-3-3 アイソフォームを含む複合体で脳ダイナミン I に直接結合します」。Biochem . J. 359 ( Pt1): 55–64. doi :10.1042/0264-6021:3590055. PMC 1222121. PMID 11563969 。
さらに読む
- Berryman M、Bretscher A (2000)。「胎盤微絨毛のアクチン細胞骨格と関連する塩化物細胞内チャネル遺伝子ファミリー (CLIC5) の新規メンバーの同定」。Mol . Biol. Cell . 11 (5): 1509–21. doi :10.1091/mbc.11.5.1509. PMC 14863. PMID 10793131 。
- Ponnalagu D、Hamilton S、Sanghvi S、Antelo D、Schwieterman N、Hansra I、Xu X、Gao E、Edwards JC、Bansal SS、Wold LE、Terentyev、D、Janssen PM、Hund TJ、Khan M、Kohut AR、Koch WJ、Singh H (2022)。「CLIC4はミトコンドリア関連膜に局在し、心臓保護を媒介する」。Science Advances。8 ( 42 ) : eabo1244。Bibcode : 2022SciA ....8O1244P。doi :10.1126/sciadv.abo1244。PMC 9586484。PMID 36269835。
- Berryman MA、Goldenring JR (2004)。「CLIC4 は細胞間接合部に豊富に存在し、培養された哺乳類細胞の中心体と中体で AKAP350 と共存する」。Cell Motil 。細胞骨格。56 (3): 159–72。doi :10.1002/cm.10141。PMID 14569596 。
- Bohman S、Matsumoto T、Suh K、他 (2006)。「血管内皮増殖因子誘導性内皮細胞分化のプロテオーム解析により、尿細管形態形成における塩化物細胞内チャネル 4 (CLIC4) の役割が明らかに」。J . Biol. Chem . 280 (51): 42397–404. doi : 10.1074/jbc.M506724200 . PMID 16239224。
- Chuang JZ、Milner TA、Zhu M、Sung CH (1999)。「29 kDa 細胞内塩化物チャネル p64H1 はラット海馬ニューロンの大型高密度コア小胞と関連している」。J . Neurosci . 19 (8): 2919–28. doi : 10.1523/JNEUROSCI.19-08-02919.1999 . PMC 6782274 . PMID 10191309。
- Duncan RR、Westwood PK、Boyd A、Ashley RH (1997)。「ラット脳 p64H1、小胞体における p64 塩素イオンチャネルタンパク質ファミリーの新しいメンバーの発現」。J . Biol. Chem . 272 (38): 23880–6. doi : 10.1074/jbc.272.38.23880 . PMID 9295337。
- Edwards JC (1999)。「新しいp64関連Cl −チャネル:細胞内分布とネフロンセグメント特異的発現」。Am . J. Physiol . 276 (3 Pt 2): F398–408。doi :10.1152/ ajprenal.1999.276.3.F398。PMID 10070163。S2CID 19105320 。
- Qian Z, Okuhara D, Abe MK, Rosner MR (1999). 「ミトゲン活性化プロテインキナーゼ関連細胞内塩素イオンチャネルの分子クローニングと特性解析」J. Biol. Chem . 274 (3): 1621–7. doi : 10.1074/jbc.274.3.1621 . PMID 9880541.
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- Hartley JL、Temple GF、Brasch MA (2001)。「In Vitro 部位特異的組換えを用いた DNA クローニング」。Genome Res . 10 (11): 1788–95. doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948 . PMID 11076863。
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- Rønnov-Jessen L、Villadsen R、Edwards JC、Petersen OW (2002)。「形質転換成長因子β1を介した線維芽細胞の筋線維芽細胞への転換における塩化物細胞内チャネル遺伝子 CLIC4 の差次的発現」。Am . J. Pathol . 161 (2): 471–80. doi :10.1016/S0002-9440(10)64203-4. PMC 1850723. PMID 12163372 .
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- Shiio Y, Suh KS, Lee H, et al. (2006). 「myc 誘導アポトーシスの定量的プロテオーム解析: ミトコンドリア塩化物イオンチャネル mtCLIC/CLIC4 の Myc 誘導の直接的な役割」J. Biol. Chem . 281 (5): 2750–6. doi : 10.1074/jbc.M509349200 . PMID 16316993.
- Simpson JC、Wellenreuther R、Poustka A、et al. (2001)。「大規模cDNAシーケンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」。EMBO Rep . 1 (3): 287–92. doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614 。
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- Singh H (2010). 「二形性塩化物細胞内チャネル (CLIC) の 20 年間」. FEBS Letters . 584 (10): 2112–21. Bibcode :2010FEBSL.584.2112S. doi : 10.1016/j.febslet.2010.03.013 . PMID 20226783.
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
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- Valenzuela SM、Martin DK、Por SB、et al. (1997)。「細胞核の塩化物イオンチャネルの分子クローニングと発現」。J . Biol. Chem . 272 (19): 12575–82. doi : 10.1074/jbc.272.19.12575 . PMID 9139710。
- Wick M、Bürger C、Brüsselbach S、et al. (1994)。「血清誘導性遺伝子の同定:G0-->S および G1-->S 進行中の遺伝子調節の異なるパターン」。J . Cell Sci . 107 (1): 227–39. doi :10.1242/jcs.107.1.227. PMID 8175911。
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeome から生物学へ: 機能ゲノミクスパイプライン」Genome Res . 14 (10B): 2136–44. doi :10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336 .
- Wiemann S、Weil B、Wellenreuther R、他 (2001)。「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログに向けて:ヒトcDNAをコードする新規完全タンパク質500種の配列決定および分析」。Genome Res . 11 (3): 422–35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166 。
外部リンク
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。