CLEC4A

CLEC4A
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	5B1W、5B1X
識別子
エイリアス	CLEC4A、CLECSF6、DCIR、DDB27、LLIR、CD367、HDCGC13P、C型レクチンドメインファミリー4メンバーA、hDCIR
外部ID	オミム：605306; MGI : 1349412;ホモロジーン: 49291;ジーンカード：CLEC4A; OMA :CLEC4A - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体12（ヒト）
終わり	8,138,607 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体6（マウス）
終わり	123,120,958 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	単球; ; 顆粒球; ; 血; ; 付録; ; 睾丸; ; 脾臓; ; 骨髄; ; 骨髄細胞; ; 左肺の上葉; ; 右肺;
	トップの表現
	顆粒球; ; 骨髄間質; ; 脛骨大腿関節; ; 精子細胞; ; 胚; ; 脾臓; ; パネートセル; ; 顎下腺; ; 精細管; ; 血;
	参照表現データの詳細
	; ;
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	膜貫通シグナル受容体活性; 炭水化物結合; カルシウムイオン結合; マンノース結合; 金属イオン結合;
細胞成分	膜の不可欠な構成要素; 細胞膜; 細胞膜の不可欠な構成要素; 膜;
生物学的プロセス	細胞表面受容体シグナル伝達経路; 細胞接着; 刺激性C型レクチン受容体シグナル伝達経路; 適応免疫反応; 免疫システムのプロセス; 先天性免疫反応; サイトカイン産生の抑制; 形質細胞様樹状細胞抗原の処理と提示; 腫瘍壊死因子産生の抑制; CD8陽性α-βT細胞活性化; MHCクラスIを介した抗原処理と外因性ペプチド抗原の提示;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	50856
	26888
	ENSG00000111729
	ENSMUSG00000030148
	言語
	翻訳:
	NM_016184 ; NM_194447 ; NM_194448 ; NM_194450
	NM_001170332 ; NM_001170333 ; NM_011999
	NP_057268 ; NP_919429 ; NP_919430 ; NP_919432
	NP_001163803 ; NP_001163804 ; NP_036129
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

C型レクチンドメインファミリー4メンバーAは、ヒトではCLEC4A遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]

この遺伝子は、C 型レクチン/C 型レクチン様ドメイン (CTL/CTLD) スーパーファミリーのメンバーをコードします。このファミリーのメンバーは共通のタンパク質フォールドを共有し、細胞接着、細胞間シグナル伝達、糖タンパク質のターンオーバー、炎症や免疫応答における役割など、多様な機能を持っています。コードされているタイプ 2 膜貫通タンパク質は、炎症および免疫応答において役割を果たす可能性があります。

この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする複数の転写変異体が同定されている。この遺伝子は、ナチュラルキラー遺伝子複合体領域の染色体12p13にある他のCTL/CTLDスーパーファミリーのメンバーと密接に関連している。^[6]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000111729 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000030148 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Bates EE、Fournier N、Garcia E、Valladeau J、Durand I、Pin JJ、Zurawski SM、Patel S、Abrams JS、Lebecque S、Garrone P、Saeland S (1999 年 9 月)。「APC は、免疫受容体チロシンベースの阻害モチーフを含む新しい C 型レクチン表面受容体 DCIR を発現します」。J Immunol . 163 (4): 1973–83. doi :10.4049/jimmunol.163.4.1973. PMID 10438934。
^ ab "Entrez Gene: CLEC4A C 型レクチンドメインファミリー 4、メンバー A"。

さらに読む

Drickamer K (1999). 「C型レクチン様ドメイン」. Curr. Opin. Struct. Biol . 9 (5): 585–90. doi :10.1016/S0959-440X(99)00009-3. PMID 10508765.
Huang X、Yuan Z、Chen G、他 (2001)。「レクチン様免疫受容体 LLIR およびその 2 つの膜貫通領域欠失変異体を含む新規 ITIM のクローニングと特性評価」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 281 (1): 131–40. doi :10.1006/bbrc.2001.4322. PMID 11178971。
Richard M、Veilleux P、Rouleau M、他 (2002)。「好中球における ITIM 含有レクチン CLECSF6 の発現パターンは、炎症の制御における重要な役割を示唆している」。J . Leukoc. Biol . 71 (5): 871–80. doi : 10.1189/jlb.71.5.871 . PMID 11994513. S2CID 36809172。
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
Ebner S、Sharon N、Ben - Tal N (2003)。「進化解析により、C 型レクチンおよびレクチン様ドメインスーパーファミリーの集合的特性と特異性が明らかになった」。タンパク質。53 ( 1 ): 44–55。doi : 10.1002 /prot.10440。PMID 12945048。S2CID 30955198。
Richard M、Thibault N、Veilleux P、他 (2003)。「ITIM を保有する CLECSF6 (DCIR) は、好中球活性化剤によって好中球内でダウンモジュレーションされる」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 310 (3): 767–73. doi :10.1016/j.bbrc.2003.09.077. PMID 14550269。
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Richard M、Thibault N、Veilleux P、他 (2006)。「顆粒球マクロファージコロニー刺激因子は好中球のCLECSF6のITIMに対するSHP-2の親和性を低下させる：SHP-2の新たな作用機序」。Mol . Immunol . 43 (10): 1716–21. doi :10.1016/j.molimm.2005.10.006. PMID 16360206。
Lorentzen JC、Flornes L、Eklöw C、et al. (2007)。「関節炎とC型レクチン様受容体をコードする遺伝子複合体との関連」。Arthritis Rheum . 56 (8): 2620–32. doi :10.1002/art.22813. PMID 17665455。

外部リンク

UCSC ゲノムブラウザのヒト CLEC4A ゲノムの位置と CLEC4A 遺伝子の詳細ページ。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000111729 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000030148 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid10438934-5] Bates EE、Fournier N、Garcia E、Valladeau J、Durand I、Pin JJ、Zurawski SM、Patel S、Abrams JS、Lebecque S、Garrone P、Saeland S (1999 年 9 月)。「APC は、免疫受容体チロシンベースの阻害モチーフを含む新しい C 型レクチン表面受容体 DCIR を発現します」。J Immunol . 163 (4): 1973–83. doi :10.4049/jimmunol.163.4.1973. PMID 10438934。

[entrez-6] "Entrez Gene: CLEC4A C 型レクチンドメインファミリー 4、メンバー A"。

参考文献

さらに読む

外部リンク

関連するトピック

ＰＤＢ

エイリアス

オミム

MGI