ヒトのタンパク質コード遺伝子
| CLEC2D |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | ヒト UniProt 検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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4QKG、4QKH、4QKI、4QKJ、4WCO |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CLEC2D、CLAX、LLT1、OCIL、C型レクチンドメインファミリー2メンバーD |
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| 外部ID | オミム:605659;ホモロジーン: 137257;ジーンカード:CLEC2D; OMA :CLEC2D - オルソログ |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 顆粒球
- アキレス腱
- 脾臓
- リンパ節
- 血
- 付録
- 右子宮管
- 結腸上皮
- 単球
- 骨髄細胞
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| | | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 膜貫通シグナル受容体活性
- 炭水化物結合
- タンパク質結合
| | 細胞成分 |
- 細胞膜
- 膜
- 膜の不可欠な構成要素
- 小胞体
- 細胞膜の不可欠な構成要素
- 細胞表面
| | 生物学的プロセス | | | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001004419 NM_001004420 NM_001197317 NM_001197318 NM_001197319
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NM_013269 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001004419 NP_001184246 NP_001184247 NP_001184248 NP_037401 |
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| 場所 (UCSC) | 12 章: 9.66 – 9.7 Mb | 該当なし |
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| PubMed検索 | [2] | 該当なし |
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| ウィキデータ |
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C型レクチンドメインファミリー2のメンバーDは、ヒトではCLEC2D遺伝子によってコードされるタンパク質である。[3]
この遺伝子は、ナチュラルキラー細胞受容体C型レクチンファミリーのメンバーをコードしています。コードされているタンパク質は破骨細胞の形成を阻害し、N末端近くの膜貫通ドメインとC型レクチン様細胞外ドメインを含んでいます。いくつかの選択的スプライシング転写バリアントが同定されていますが、すべての転写の完全長の性質は定義されていません。[3] CLEC2Dは、 KLRB1遺伝子によってコードされるヒトNKR-P1A受容体の機能的リガンドであるレクチン様転写産物-1(LLT1)タンパク質の遺伝子をコードしています。マウスでは、CLEC2D遺伝子の多くの相同遺伝子があり、推定される相同遺伝子はClr-b/Ocil(Clec2d)です。Clr-bは、NKR-P1B受容体の関与を介してナチュラルキラー細胞によるミッシングセルフ認識に関与しています。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000069493 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab "Entrez Gene: CLEC2D C 型レクチンドメインファミリー 2、メンバー D"。
さらに読む
- Boles KS、Barten R、Kumaresan PR、et al. (1999)。「ヒト NK 細胞上に発現する新しいレクチン様受容体のクローニング」。免疫遺伝学。50 (1–2): 1–7。doi : 10.1007 /s002510050679。PMID 10541800。S2CID 30994521 。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Iizuka K, Naidenko OV, Plougastel BF, et al. (2003). 「ナチュラルキラー細胞受容体のNKRP1ファミリーの遺伝的にリンクされたC型レクチン関連リガンド」Nat. Immunol . 4 (8): 801–7. doi :10.1038/ni954. PMID 12858173. S2CID 23775959.
- Hu YS、Zhou H、Myers D、et al. (2004)。「破骨細胞の形成と機能を阻害する破骨細胞阻害レクチンのヒトホモログの単離」。J . Bone Miner. Res . 19 (1): 89–99. doi : 10.1359/JBMR.0301215 . PMID 14753741. S2CID 28328386。
- Carlyle JR、Jamieson AM、Gasser S、他 (2004)。「阻害性 NKR-P1 ナチュラル キラー細胞受容体による Ocil/Clr-b の自己認識の欠如」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 101 ( 10): 3527–32。Bibcode :2004PNAS..101.3527C。doi : 10.1073/ pnas.0308304101。PMC 373496。PMID 14990792。
- Mathew PA、Chuang SS、Vaidya SV、他 (2004)。「LLT1 受容体はヒトナチュラルキラー細胞による IFN-γ 産生を誘導する」。Mol . Immunol . 40 (16): 1157–63. doi :10.1016/j.molimm.2003.11.024. PMID 15104121。
- Gange CT、Quinn JM、Zhou H、et al. (2004)。「破骨細胞阻害レクチンによる糖結合の特性」。J . Biol. Chem . 279 (28): 29043–9. doi : 10.1074/jbc.M312518200 . PMID 15123656。
- Aldemir H、Prod'homme V、Dumaurier MJ、et al. (2006)。「最先端:レクチン様転写産物 1 は CD161 受容体のリガンドである」。J . Immunol . 175 (12): 7791–5. doi : 10.4049/jimmunol.175.12.7791 . PMID 16339512。
- Rosen DB、Bettadapura J、Alsharifi M、他 (2006)。「最先端:レクチン様転写産物-1は阻害性ヒトNKR-P1A受容体のリガンドである」。J . Immunol . 175 (12): 7796–9. doi : 10.4049/jimmunol.175.12.7796 . PMID 16339513。
- Rosen DB、Cao W、et al. (2008)。「活性化樹状細胞およびB細胞上で発現するヒトNKR-P1AとそのリガンドLLT1との相互作用の機能的結果」。J . Immunol . 180 (10): 6508–6517. doi :10.4049/jimmunol.180.10.6508. PMC 2577150. PMID 18453569 。
外部リンク