ヒトのタンパク質コード遺伝子
| CLEC1A |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CLEC1A、CLEC-1、CLEC1、C 型レクチンドメインファミリー 1 メンバー A |
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| 外部ID | オミム：606782; MGI : 2444151;ホモロジーン: 9549;ジーンカード：CLEC1A; OMA :CLEC1A - オルソログ |
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| 遺伝子の位置（マウス） |
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 | | クロ。 | 染色体6（マウス）[2] |
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| | バンド | 6|6 F3 | 始める | 129,401,735 bp [2] |
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| 終わり | 129,428,963 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス（相同遺伝子） |
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| トップの表現 | - 胎盤
- 左肺の上葉
- 右肺
- 皮下脂肪組織
- 睾丸
- 脛骨神経
- 子宮体部
- 子宮頸管
- 子宮頸管
- 左子宮管
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| | トップの表現 | - 左肺葉
- 右肺
- 腰椎神経節
- 右肺葉
- 腎小体
- 頸動脈小体
- 腸間膜リンパ節
- 坐骨神経
- 房室弁
- 積雲細胞
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- 細胞膜の不可欠な構成要素
- 細胞内解剖構造
- 膜
| | 生物学的プロセス | | | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001297748
NM_001297749
NM_001297750
NM_001297751
NM_016511 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001284677
NP_001284678
NP_001284679
NP_001284680
NP_057595
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NP_001284677.1 |
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| 場所 (UCSC) | 12章: 10.07 – 10.11 Mb | 6 章: 129.4 – 129.43 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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C型レクチンドメインファミリー1メンバーAは、ヒトではCLEC1A遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
この遺伝子は、C 型レクチン/C 型レクチン様ドメイン(CTL/CTLD) スーパーファミリーのメンバーをコードします。このファミリーのメンバーは共通のタンパク質フォールドを共有し、細胞接着、細胞間シグナル伝達、糖タンパク質のターンオーバー、炎症や免疫応答における役割など、多様な機能を持っています。コードされているタンパク質は、樹状細胞の機能を制御する役割を果たす可能性があります。選択的スプライスバリアントが記述されていますが、その生物学的性質は決定されていません。この遺伝子は、ナチュラルキラー遺伝子複合体領域の染色体 12p13 にある他の CTL/CTLD スーパーファミリーのメンバーと密接に関連しています。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000150048 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000033082 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Colonna M、Samaridis J、Angman L (2000 年 3 月)。「2 つ の新規 C 型レクチン様受容体の分子特性、そのうちの 1 つはヒト樹状細胞で選択的に発現している」。Eur J Immunol。30 ( 2): 697–704。doi : 10.1002/1521-4141(200002)30:2<697::AID-IMMU697>3.0.CO;2- M。PMID 10671229 。
- ^ Sobanov Y, Bernreiter A, Derdak S, Mechtcheriakova D, Schweighofer B, Duchler M, Kalthoff F, Hofer E (2001 年 12 月). 「単球、樹状細胞、内皮細胞で発現するレクチン様受容体遺伝子の新規クラスターは、ヒト NK 遺伝子複合体の NK 受容体遺伝子の近くに位置している」Eur J Immunol . 31 (12): 3493–503. doi :10.1002/1521-4141(200112)31:12<3493::AID-IMMU3493>3.0.CO;2-9. PMID 11745369. S2CID 42415487.
- ^ ab "Entrez Gene: CLEC1A C 型レクチンドメインファミリー 1、メンバー A"。
外部リンク
さらに読む
- Drickamer K (1999). 「C型レクチン様ドメイン」. Curr. Opin. Struct. Biol . 9 (5): 585–90. doi :10.1016/S0959-440X(99)00009-3. PMID 10508765.
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Ebner S、Sharon N、Ben - Tal N (2003)。「進化解析により、C 型レクチンおよびレクチン様ドメインスーパーファミリーの集合的特性と特異性が明らかになった」。タンパク質。53 ( 1 ): 44–55。doi : 10.1002 /prot.10440。PMID 12945048。S2CID 30955198。
- Clark HF、Gurney AL、Abaya E、他 (2003)。「分泌タンパク質発見イニシアチブ (SPDI)、新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質を同定するための大規模な取り組み: バイオインフォマティクス評価」。Genome Res . 13 (10): 2265–70. doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309 。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, et al. (2007). 「オリゴキャップ cDNA ライブラリーから分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする全長ヒト cDNA を選択するためのシリコでのシグナル配列とキーワードトラップ」。DNA Res . 12 (2): 117–26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743。
