ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
CHD1L 識別子 エイリアス CHD1L 、ALC1、CHDL、クロモドメインヘリカーゼDNA結合タンパク質1様、クロモドメインヘリカーゼDNA結合タンパク質1様 外部ID オミム :613039; MGI : 1915308; ホモロジーン : 11590; ジーンカード :CHD1L; OMA :CHD1L - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 染色体3(マウス) [2] バンド 3|3 F2.2 始める 97,468,058 bp [2] 終わり 97,517,519 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 生殖腺 C1セグメント 小脳の右半球 肝臓の右葉 下垂体前葉 上行大動脈 横行結腸粘膜 顆粒球 脾臓 胸部大動脈下行
トップの表現 球形嚢 耳板 膀胱移行上皮 精細管 耳小胞 精母細胞 精子細胞 原始的な線 パネートセル 生殖腺隆起
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
ヌクレオチド結合
ATPase活性
タンパク質結合
加水分解酵素活性
ATP結合
ヘリカーゼ活性
DNAヘリカーゼ活性
細胞成分 生物学的プロセス
ゲノム全体のヌクレオチド除去修復
ヌクレオチド除去修復、DNA切断
DNA修復
DNA損傷刺激に対する細胞反応
ヌクレオチド除去修復、切断前複合体の安定化
ヌクレオチド除去修復、切断前複合体の組み立て
ヌクレオチド除去修復、DNA切断、5'-to損傷
クロマチンリモデリング
DNA二重鎖の解離
ヌクレオチド除去修復、DNA二重鎖の巻き戻し
ヌクレオチド除去修復、DNA切断、3'-損傷
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001256336 NM_001256337 NM_001256338 NM_001348451 NM_001348452 NM_001348453 NM_001348454 NM_001348455 NM_001348456 NM_001348457 NM_001348458 NM_001348459 NM_001348460 NM_001348461 NM_001348462 NM_001348463 NM_001348464 NM_001348465 NM_001348466 NM_004284 NM_024568
RefSeq (タンパク質) NP_001243265 NP_001243266 NP_001243267 NP_004275 NP_078844 NP_001335380 NP_001335381 NP_001335382 NP_001335383 NP_001335384 NP_001335385 NP_001335386 NP_001335387 NP_001335388 NP_001335389 NP_001335390 NP_001335391 NP_001335392 NP_001335393 NP_001335394 NP_001335395
場所 (UCSC) 1 章: 147.24 – 147.3 Mb 3 章: 97.47 – 97.52 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
クロモドメインヘリカーゼDNA結合タンパク質1様 ( ALC1 )は 、ヒトでは CHD1L 遺伝子によってコードされる 酵素 である。 [5] [6] DNAの複製、修復、転写に必要なクロマチンリモデリングとDNA緩和プロセスに関与していると考えられている。ALC1はATPaseドメインとマクロドメインで構成される。ATPaseドメイン内の相同性に基づき、ALC1はSnf2ファミリーに属する。 [7]
897個のアミノ酸から成り、その大きさは約101kDaである。 [8]
関数
開発中
DNA ヘリカーゼであるCHD1Lは、 クロマチンリモデリング 活性 を有し、 PARP1 /PARylationと相互作用して 発生 リプログラミング中の多能性を調節する。CHD1Lマクロドメインは、PARylated-PARP1のPAR部分と相互作用して、 幹細胞の初期段階のリプログラミングと 多能性を促進する。 [9] CHD1L発現は 胚発生 の初期段階に不可欠であると思われる 。 [10] 胚発生におけるCHD1Lの役割は、EMT(上皮間葉転換)につながるいくつかの遺伝子(Akt、METP2、TCF4)の転写活性化因子としての役割に関連している。 [11] 注目すべきことに、EMTは腫瘍転移にも関係しており、 [12] 健康な細胞と病気の細胞の両方におけるCHD1Lの役割をさらに複雑にしている。
DNA修復において
DNA修復という重要な細胞プロセスを可能にするには、損傷部位でクロマチンをリモデリングする必要があります。 クロマチンリモデリング タンパク質であるCHD1L(ALC1)は、DNA修復の非常に初期に作用します。DNA損傷部位では、クロマチンの緩和が急速に起こります。 [13]このプロセスは PARP1 タンパク質 によって開始され 、DNA損傷時に1秒未満で現れ始め、損傷発生後1.6秒以内に半分の最大値が蓄積されます。 [14] 次にPARP1はPAR化され、これらのPAR鎖がCHD1Lのマクロドメインを引き付けて自己阻害を軽減し、N末端ドメインがクロマチンと相互作用できるようにします。 [15] マクロドメインとN末端ドメイン間のリンカーはヒストンに巻き付き、R611アンカーを介して酸性ヌクレオソームパッチと相互作用します。 [16] 次に、クロマチンリモデラーCHD1L(ALC1)がPARP1の産物に素早く付着し、損傷から10秒以内にDNA損傷部に到達します。 [13] CHD1L(ALC1)の作用による最大クロマチン緩和の約半分は、10秒までに発生します。 [13] これにより、DNA修復酵素 MRE11 がリクルートされ、13秒以内にDNA修復が開始されます。 [14] MRE11は 相同組み換え 修復に関与しています。CHD1L(ALC1)は、 ヌクレオチド除去修復 を介した 紫外線 損傷 クロマチン の修復にも必要です 。 [17]
1q21.1欠失症候群 では 障害が発生し、DNA切断の増加につながる。CHD1Lの役割は、 ウェルナー症候群 における ヘリカーゼの役割と似ている [18]
参考文献
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外部リンク
さらに読む
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