CDH4

CDH4
識別子
エイリアス	CDH4、CAD4、R-CAD、RCAD、カドヘリン4
外部ID	オミム：603006; MGI : 99218;ホモロジーン：48044;ジーンカード：CDH4; OMA :CDH4 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体20（ヒト）
終わり	61,940,617 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体2（マウス）
終わり	179,541,166 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	心室帯; ; 神経節隆起; ; 側坐核; ; 側頭葉; ; 扁桃体; ; 尾状核; ; 前帯状皮質; ; 被殻; ; 睾丸; ; 前頭前皮質;
	トップの表現
	ボーマン嚢; ; 球形嚢; ; 前扁桃体領域; ; 体腔上皮; ; 水晶体上皮; ; 糸球体; ; 原腸胚; ; 嗅球; ; 神経節隆起; ; 耳小胞;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	カルシウムイオン結合; 金属イオン結合; 細胞骨格タンパク質結合; タンパク質ホモ二量体化活性; カドヘリン結合;
細胞成分	膜の不可欠な構成要素; 細胞膜; 細胞膜の不可欠な構成要素; 膜; 細胞表面; カテニン複合体;
生物学的プロセス	細胞膜細胞接着分子を介した異好性細胞間接着; 細胞接着; 軸索伸展の正の制御; 接着結合組織; 細胞膜接着分子を介した同種親和性細胞接着; 軸索誘導; 細胞間接合部の組み立て; 細胞膜細胞接着分子を介したカルシウム依存性細胞間接着; カドヘリンを介した細胞間接着; 細胞間接着; 細胞形態形成;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	1002
	12561
	ENSG00000280641 ; ENSG00000179242
	ENSMUSG00000000305
	P55283
	P39038
	NM_001794 ; NM_001252338 ; NM_001252339
	NM_009867 ; NM_001316723
	NP_001239267 ; NP_001239268 ; NP_001785
	NP_001303652 ; NP_033997
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

カドヘリン4は、ヒトではCDH4遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]^[7]

この遺伝子は、カドヘリンスーパーファミリーに属する古典的なカドヘリンです。コードされているタンパク質は、5 つの細胞外カドヘリン繰り返し、膜貫通領域、高度に保存された細胞質尾部からなるカルシウム依存性細胞間接着糖タンパク質です。ニワトリとマウスの研究に基づくと、このカドヘリンは脳の分節化と神経細胞の伸長に重要な役割を果たすと考えられています。さらに、腎臓と筋肉の発達における役割も示唆されています。特に興味深いのは、共トランスフェクトされた細胞株でカドヘリン 2 と 4 の安定したシスヘテロ二量体を示す研究です。これまでは、完全に同種親和的な方法で相互作用すると考えられていましたが、これはカドヘリンのヘテロ二量体化の最初の証拠です。^[7]

インタラクション

カドヘリン 4 は以下と相互作用することが示されています。

PTPmu ^[8]

参考文献

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さらに読む

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外部リンク

UCSC ゲノムブラウザにおける CDH4 ヒト遺伝子の位置。
UCSC ゲノムブラウザにおける CDH4 ヒト遺伝子の詳細。

[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000179242 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000280641, ENSG00000179242 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000000305 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid10191097-5] Chalmers IJ、Hofler H、Atkinson MJ (1999 年 6 月)。「癌で頻繁に対立遺伝子消失が起こる染色体 5 の領域へのカドヘリン遺伝子クラスターのマッピング」。Genomics . 57 ( 1): 160–3. doi :10.1006/geno.1998.5717. PMID 10191097。

[pmid10516427-6] クールズ P、ヴァンハルスト K、ヴァンロイ F (1999 年 10 月)。「ヒト染色体バンド 20q13.3 へのカドヘリン 4 (R-カドヘリン、CDH4) の割り当て」。Cytogenet セルジェネット。86 (1): 26-7。土井：10.1159/000015423。PMID 10516427。S2CID 27578498 。

[entrez-7] 「Entrez Gene: CDH4 カドヘリン 4、タイプ 1、R-カドヘリン (網膜)」。

[pmid9531566-8] Brady-Kalnay SM、Mourton T、Nixon JP、Pietz GE、Kinch M、Chen H、et al. (1998). 「PTPmuと複数のカドヘリンの生体内動的相互作用」J Cell Biol . 141 (1): 287–96. doi :10.1083/jcb.141.1.287. PMC 2132733. PMID 9531566 .