ブルクハルト・ロスト

ブルクハルト・ロスト
ISMBで講演するブルクハルト・ロスト氏
生まれる	( 1961-07-11 )1961年7月11日（63歳） ドイツ
母校	ハイデルベルク大学[7]
知られている	ISCB会長 ISMB、CASPの組織 タンパク質予測[6] 進化情報と機械学習の組み合わせ
配偶者	カリマ・ジャバリ[9]
受賞歴	アレクサンダー・フォン・フンボルト教授、ISCBフェロー賞[1]
科学者としてのキャリア
フィールド	機械学習 進化 タンパク質構造予測[2] タンパク質機能予測 配列分析 バイオインフォマティクス[3] [4] [5] [6]
機関	ミュンヘン工科大学 (TUM) ルートヴィヒ・マクシミリアン大学ミュンヘン（LMU） コロンビア大学 ハイデルベルク大学 欧州分子生物学研究所
論文	ニューラル ネットワークと進化 - タンパク質二次構造の高度な予測 (1994)
博士課程の指導教員	クリス・サンダー[7] [8]
Webサイト	詳しくはこちら

ブルクハルト・ロストは、ミュンヘン工科大学（TUM）情報学部の計算生物学およびバイオインフォマティクス学科を率いる科学者です。^[10]ロストは、ミュンヘンのTUMとルートヴィヒ・マクシミリアン大学（LMU）が参加するミュンヘンバイオインフォマティクス研究部門の議長を務めています。2007年から2014年まで、ロストは国際計算生物学会（ISCB）の会長を務めました。^{[3] [11] [12] [13] [14] [15] [16]}

ロストはもともと理論物理学者として科学者としてのキャリアをスタートさせました。ギーセン大学で物理学を、ハイデルベルク大学で物理学、歴史、哲学、心理学を学んだ後、 1​​994年にハイデルベルク大学で欧州分子生物学研究所（EMBL）での仕事により博士号を取得しました。 ^{[7]ケンブリッジ（英国）のEMBLと}欧州バイオインフォマティクス研究所で研究インターンシップを行った後、1998年にニューヨーク市のコロンビア大学CUメディカルセンター外科医大学生化学・分子生物物理学科の助教授になりました。2000年にコロンビア大学で准教授になり、2009年にミュンヘン工科大学のバイオインフォマティクス学科長に任命されました。彼はニューヨーク科学アカデミーの会員であり、 2007年から2014年まで国際計算生物学会（ISCB）の会長を務めた。2021年現在、ロストはGoogle Scholarのh指数が100の300以上の科学論文を執筆または共著している。^{[3] [11] [12] [13][アップデート]}

ロスト氏の研究は、機械学習と進化情報を組み合わせて、進化、タンパク質構造、タンパク質機能の理解を深めるために極めて重要な側面を予測することに重点を置いています。彼の研究室で行われている研究の例には、酵素活性の予測 (ECGO)、相互作用パートナー (ISIS、DISIS、PiNAT)、細胞内局在 (LOCtree、LOCnet、PredictNLS)、点突然変異/SNPの機能的影響 (SNAP)、無秩序領域 (MD、NORSnet、Ucon)、膜貫通セグメント (PROF/PHDhtm)、二次構造 (PROF/PHD、RePROF、DSSPcont)、^[17]溶媒アクセシビリティ (PROF/PHD、RePROF)、内部残基間接触 (PROFcon)、タンパク質のファミリーへのクラスタリング (CHOP) ^{[18]などがあります。}

彼は現在、主にコーディング領域における非同義的変化、つまりアミノ酸配列を変える 一塩基変化（または一塩基多型）のレベルでの個々の変異の影響を予測することに重点を置いています。

彼のグループは、タンパク質構造予測と配列解析のための最初のインターネットサーバーであるPredictprotein ^[6]が1992年に立ち上げられ、それ以来継続的にサービスを提供していることからもわかるように、ツールをオンラインで利用できるようにすることに専念してきました。ロストの研究は、 Nature、^{[8] [19] [20] [21]} Science、^[22] PLOS Genetics ^[23]などの主要な査読付き科学雑誌に掲載されています 。

2007年、ロスト氏はマイケル・グリブスコフ氏の後任として国際計算生物学会（ISCB）の会長に選出された。ロスト氏は2014年まで会長を務め、後任はアルフォンソ・バレンシア氏である。

ロスト氏は、計算生物学における最大の年次会議である分子生物学のためのインテリジェントシステム（ISMB）の共同議長を2007年（ウィーン）、2008年（トロント）、2011年（ウィーン）、2012年（ロングビーチ）に務めました。^[24]彼は、通常の北半球以外で開催される一連の国際会議を発起し、組織に関わってきた。具体的には、アフリカ生物情報科学および計算生物学会と協力したISCBアフリカ（2010年：マリ共和国バマコ、2011年：南アフリカ共和国ケープタウン、 2013年：チュニジア共和国チュニス） 、ISCBラテンアメリカ（2010年：ウルグアイ共和国モンテビデオ、2012年：チリ共和国サンティアゴ、2014年：ブラジル共和国リオデジャネイロ）、そして最近ではISCBアジア（2011年：マレーシア共和国クアラルンプール、2012年：中国深圳）である。^[25]

ロスト氏は、2002 年から 2008 年 (CASP4 ～ CASP8) にかけて、 タンパク質構造予測の重要な評価 (CASP)会議の共同主催者も務めました。

ロストは2009年にアレクサンダー・フォン・フンボルト財団の教授に任命された。2015年にはISCBのフェローに任命された。 ^[26] 2016年にはISCBへの顕著な貢献を表彰された。^[25]

• ロストラボのウェブサイト
• Burkhard Rost 氏、 TEDxにて講演:パーソナライズされた健康: 多様性の力を活用する(TEDx)
• アレクサンダー・フォン・フンボルト賞