ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| BSCL2 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | BSCL2、GNG3LG、HMN5、PELD、SPG17、ベラルディネリ・セイプ先天性脂肪異栄養症 2 (セイピン)、セイピン脂肪滴生合成関連、BSCL2 脂肪滴生合成関連、セイピン、HMN5C |
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| 外部ID | オミム:606158; MGI : 1298392;ホモロジーン:32032;ジーンカード:BSCL2; OMA :BSCL2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 19番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 19 A|19 5.76 cM | 始める | 8,814,831 bp [2] |
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| 終わり | 8,826,047 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 上前頭回
- 一次視覚野
- 下垂体
- 下垂体前葉
- 右精巣
- ブロードマン領域9
- 左精巣
- 側坐核
- 尾状核
- 視床下部
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| | トップの表現 | - 大動脈外膜
- 精細管
- 白色脂肪組織
- 褐色脂肪組織
- 皮下脂肪組織
- 顔面運動核
- 運動ニューロン
- 窩
- 視床下部室傍核
- 顆頭
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- 小胞体膜の不可欠な構成要素
- 小胞体
- 小胞体膜
- 膜
| | 生物学的プロセス |
- 脂質分解プロセス
- 脂質貯蔵
- 脂質分解過程の負の調節
- 脂肪細胞の分化
- 脂肪滴組織
- 脂質代謝
- 寒冷誘発熱産生の正の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001122955 NM_001130702 NM_032667 NM_001386027 NM_001386028 |
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NM_001136064 NM_001290823 NM_008144 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001116427 NP_001124174 NP_116056 |
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NP_001129536 NP_001277752 NP_032170 |
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| 場所 (UCSC) | 11 章: 62.69 – 62.71 Mb | 19章: 8.81 – 8.83 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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セイピンはヒトではBSCL2遺伝子によってコードされるタンパク質である。 [5] [6] [7]
臨床的意義
BSCL2の変異は以下のような症状を引き起こすことが知られている:[8]
- 先天性全身性リポジストロフィー2型;
- 痙性対麻痺17、常染色体優性(SPG17)
- 遠位遺伝性運動神経障害 5C (HMN5C)
- 進行性脳症(脂肪異栄養症を伴うまたは伴わない)(PELD)。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000168000 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000071657 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ マグレ J、デレピン M、カルーフ E、ゲデ=ダール T Jr、ヴァン マルダーゲム L、ソーベル E、パップ J、マイヤー M、メガーベイン A、バッシー A、ヴェルローズ A、ダブロンゾ FH、シーマノバ E、アッサン R、ボーディックN、ブルット C、チェルニハウ P、フエ F、グリゴレスク F、デ ケルダネット M、ラコム D、ラブルーン P、ランツァ M、ロレット H、松田 F、ナバロ J、ニヴェロン シュヴァリエ A、ポラック M、ロバート JJ、トリック P、トゥビアナ ルフィ N、ヴィグルー C、ヴァイセンバッハ J、サバスタ S、マーセン JA、トリグスタッド O、ボガリョP、フレイタス P、メディナ JL、ボニッチ F、ジョッフェ BI、ロイソン G、パンズ VR、ラールFJ、 O'Rahilly S、Stephenson T、Kahn CR、Lathrop M、Capeau J (2001 年 7 月)。「Berardinelli-Seip 先天性脂肪異栄養症で染色体 11q13 に変化した遺伝子の同定」Nat Genet 28 ( 4): 365–70。doi :10.1038/ng585. PMID 11479539. S2CID 7718256.
- ^ ウィンドパシンガー C、アウアー=グルムバッハ M、イロビ J、パテル H、ペテック E、ホール G、マリ R、リード JA、ディリック I、フェルポルテン N、ワーナー TT、プロウカキス C、ヴァン デン バーグ P、ベレレン C、ヴァン マルダーゲム L 、メルリーニ L、デ ジョンヘ P、ティマーマン V、クロスビー AH、ワーグナー K (2 月) 2004年)。 「BSCL2 のヘテロ接合性ミスセンス変異は、遠位遺伝性運動神経障害およびシルバー症候群と関連しています。」ナット・ジュネ。36 (3): 271-6。土井:10.1038/ng1313。PMID 14981520。
- ^ 「Entrez Gene: BSCL2 Bernardinelli-Seip 先天性リポジストロフィー 2 (seipin)」.
- ^ 「UniProt」www.uniprot.org . 2023年10月31日閲覧。
外部リンク
- BSCL2関連神経疾患/脊髄障害に関するGeneReviews/NCBI/NIH/UWのエントリ
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト BSCL2 ゲノムの位置と BSCL2 遺伝子の詳細ページ。
さらに読む
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Andersson B、Wentland MA、Ricafrente JY、他 (1996)。「改良されたショットガンライブラリ構築のための「ダブルアダプター」法」。Anal . Biochem . 236 (1): 107–13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474。
- Yu W, Andersson B, Worley KC, et al. (1997). 「大規模連結cDNAシークエンシング」Genome Res . 7 (4): 353–8. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). 「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Patel H、Hart PE、Warner TT、他 (2001)。「遺伝性痙性対麻痺のシルバー症候群変異体は染色体 11q12-q14 にマッピングされ、このサブタイプ内で遺伝的異質性の証拠がある」。Am . J. Hum. Genet . 69 (1): 209–15. doi :10.1086/321267. PMC 1226036. PMID 11389484 。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Simha V、Garg A (2003)。「AGPAT2 または seipin 遺伝子の変異によって引き起こされる先天性全身性脂肪異栄養症患者の体脂肪分布における表現型の異質性」。J . Clin. Endocrinol. Metab . 88 (11): 5433–7. doi : 10.1210/jc.2003-030835 . PMID 14602785。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- 海老原 功、日下部 剛、増崎 秀、他 (2004)。「日本人の先天性全身性リポジストロフィーの遺伝子と表現型の解析:セイピン遺伝子の新規ホモ接合ナンセンス変異」。J . Clin. Endocrinol. Metab . 89 (5): 2360–4. doi : 10.1210/jc.2003-031211 . PMID 15126564。
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- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- アウアー・グルムバッハ M、シュロッター・ヴァイゲル B、ロッホミュラー H 他(2005)。 「N88S Berardinelli-Seip 先天性リポジストロフィー 2 変異の表現型」。アン。ニューロール。57 (3): 415-24。土井:10.1002/ana.20410。PMID 15732094。S2CID 10908812 。
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
- van de Warrenburg BP、Scheffer H、van Eijk JJ、et al. (2006)。「シルバー症候群と遠位遺伝性運動ニューロパチーが重複する 2 つのオランダ人家族における BSCL2 変異」。Neuromuscul . Disord . 16 (2): 122–5. doi :10.1016/j.nmd.2005.11.003. PMID 16427281. S2CID 42079115。
- Gomes KB、Pardini VC、Ferreira AC、Fernandes AP (2006)。「生化学的パラメータの表現型の異質性は、Berardinelli-Seip 先天性リポジストロフィー患者における AGPAT2 または Seipin 遺伝子の変異と相関している」。J . Inherit. Metab. Dis . 28 (6): 1123–31. doi : 10.1007/s10545-005-0038-5 . PMID 16435205. S2CID 2333336.
- Cho HJ、Sung DH、 Ki CS (2007)。「シルバー症候群および遠位遺伝性運動ニューロパチーを有する韓国人家族における BSCL2 Ser90Leuの新生変異の同定」。Muscle Nerve。36 (3): 384–6。doi :10.1002/mus.20792。PMID 17486577。S2CID 26522445 。