ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ATP5PB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ATP5PB、PIG47、ATP合成酵素、H+輸送、ミトコンドリアFo複合体サブユニットB1、ATP合成酵素末梢茎膜サブユニットb、ATP5F1 |
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| 外部ID | オミム:603270; MGI : 1100495;ホモロジーン: 1275;ジーンカード:ATP5PB; OMA :ATP5PB - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体3(マウス)[2] |
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| | バンド | 3 F2.2|3 46.46 cM | 始める | 105,850,014 bp [2] |
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| 終わり | 105,867,415 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 右心室
- S状結腸粘膜
- 眼瞼結膜
- 脈絡叢上皮
- 上腕二頭筋
- 小腸粘膜
- 上腕二頭筋の骨格筋組織
- 胚上皮
- 口腔
- 腎臓尿細管
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| | トップの表現 | - 小腸上皮
- 心室の心筋
- 肋間筋
- ヒラメ筋
- 房室弁
- 内側神経節隆起
- 精管
- アトリウム
- 二腹筋
- 心内膜クッション
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質結合
- ATPase活性
- プロトン膜輸送活性
- プロトン輸送ATP合成酵素活性、回転機構
- 膜貫通輸送体の活性
| | 細胞成分 |
- 核質
- ミトコンドリア
- ミトコンドリアプロトン輸送ATP合成酵素複合体、結合因子F(o)
- ミトコンドリアマトリックス
- プロトン輸送ATP合成酵素複合体、結合因子F(o)
- 核
- 膜
- 髄鞘
- ミトコンドリアプロトン輸送ATP合成酵素複合体
- ミトコンドリア内膜
- 細胞外エクソソーム
| | 生物学的プロセス |
- 黒質の発達
- イオン輸送
- ATP合成とプロトン輸送の連動
- ミトコンドリアATP合成とプロトン輸送の結合
- ATP生合成プロセス
- クリステ形成
- 輸送
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001688 NM_001002014 NM_001002015 |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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| 場所 (UCSC) | 1 章: 111.45 – 111.46 Mb | 3 章: 105.85 – 105.87 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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タンパク質ファミリー
| ATP-シントB |
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 ATP 合成酵素 B サブユニット二量体化ドメイン |
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| シンボル | ATP-シントB |
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| パム | PF00430 |
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| ファム一族 | CL0255 |
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| インタープロ | 著作権 |
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| SCOP2 | 1b9u / スコープ / SUPFAM |
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ミトコンドリアATP合成酵素サブユニットbは、ヒトではATP5PB遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6]
この遺伝子は、ミトコンドリア ATP 合成酵素のサブユニットをコードします。ミトコンドリア ATP 合成酵素は、酸化リン酸化中に内膜を横切るプロトンの電気化学的勾配を利用して、ATP 合成を触媒します。ATP 合成酵素は、2 つの連結したマルチサブユニット複合体で構成されています。可溶性触媒コア F1 と、プロトン チャネルを構成する膜貫通コンポーネント Fo です。ミトコンドリア ATP 合成酵素の触媒部分は、3 つのアルファ、3 つのベータ、および他の 3 つの代表 1 つの化学量論で組み立てられた 5 つの異なるサブユニット (アルファ、ベータ、ガンマ、デルタ、イプシロン) で構成されています。プロトン チャネルには、9 つのサブユニット (a、b、c、d、e、f、g、F6、8) があるようです。この遺伝子は、プロトン チャネルの b サブユニットをコードします。[6]
bサブユニットは、F1複合体とFO複合体を結び付ける周辺柄の一部であり、特定のサブユニットが中央の回転要素とともに回転するのを防ぐ固定子として機能します。周辺柄は、ミトコンドリア、葉緑体、細菌のF-ATPase間でサブユニットの構成が異なります。細菌と葉緑体のF-ATPaseでは、周辺柄はデルタサブユニット(ミトコンドリアのOSCPに相同)の1つのコピーと、細菌ではサブユニットbの2つのコピー、または葉緑体と光合成 細菌ではサブユニットbとb'の各1つのコピーで構成されています。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000116459 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000000563 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Higuti T、鶴見C、大阪F、川村Y、辻田H、吉原Y、他(1991 年 9 月)。 「ミトコンドリアにおける H(+)-ATP シンターゼのヒト サブユニット B のインポート前駆体の cDNA の分子クローニング」。Biochem Biophys Res Commun。178 (3): 1014–20 .土井:10.1016/0006-291X(91)90993-H。PMID 1831354。
- ^ ab "Entrez Gene: ATP5PB ATP合成酵素末梢茎膜サブユニットb".
- ^ Carbajo RJ、Kellas FA、Runswick MJ、Montgomery MG、Walker JE、Neuhaus D (2005 年 8 月)。「ウシ F1Fo-ATPase の固定子の F1 結合ドメインの構造とアルファサブユニットへの結合方法」。J. Mol. Biol . 351 (4): 824– 38. doi :10.1016/j.jmb.2005.06.012. PMID 16045926。
外部リンク
さらに読む
- Gay NJ、Walker JE (1986)。「ウシミトコンドリアATP合成酵素プロテオリピドをコードする2つの遺伝子は、異なる輸入配列を持つ前駆体を特定し、組織特異的に発現する」。EMBO J. 4 ( 13A): 3519– 24. doi :10.1002/j.1460-2075.1985.tb04111.x. PMC 554691. PMID 2868890 。
- Farrell LB、Nagley P (1987)。「ミトコンドリアATPase複合体のプロテオリピドサブユニット9をコードするヒト肝臓cDNAクローン」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 144 (3): 1257– 64. doi :10.1016/0006-291X(87)91446-X. PMID 2883974。
- Houstĕk J、Andersson U、Tvrdík P、Nedergaard J、Cannon B (1995)。「サブユニット c の発現は褐色脂肪組織におけるミトコンドリア F0F1-ATPase の生合成と相関し、そのためその生合成を制限する可能性がある」。J . Biol. Chem . 270 (13): 7689– 94. doi : 10.1074/jbc.270.13.7689 . PMID 7706317。
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」.遺伝子. 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Elston T、Wang H、Oster G (1998)。「ATP合成酵素におけるエネルギー変換」。Nature . 391 ( 6666 ) : 510– 3。Bibcode :1998Natur.391..510E。doi :10.1038/35185。PMID 9461222。S2CID 4406161 。
- Wang H, Oster G (1998). 「ATP合成酵素のF1モーターにおけるエネルギー変換」. Nature . 396 (6708): 279– 82. Bibcode :1998Natur.396..279W. doi :10.1038/24409. PMID 9834036. S2CID 4424498.
- Jia L、Young MF、Powell J、Yang L、Ho NC、Hotchkiss R、et al. (2002)。「ヒト骨髄間質細胞の遺伝子発現プロファイル:ハイスループット発現配列タグシーケンス解析」。Genomics . 79 ( 1): 7– 17. doi :10.1006/geno.2001.6683. PMID 11827452。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、Derge JG、Klausner RD、Collins FS、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Cross RL (2004). 「分子モーター: ATP モーターの転換」. Nature . 427 (6973): 407–8 . Bibcode :2004Natur.427..407C. doi : 10.1038/427407b . PMID 14749816. S2CID 52819856.
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、Shenmen CM、Grouse LH、Schuler G、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928 . PMID 15489334。
- Gregory SG、Barlow KF、 McLay KE、Kaul R、Swarbreck D、Dunham A、et al. (2006)。「ヒト染色体1のDNA配列と生物学的注釈」。Nature。441 ( 7091 ) : 315– 21。Bibcode :2006Natur.441..315G。doi : 10.1038 /nature04727。PMID 16710414。
- Ewing RM、Chu P、Elisma F、Li H、Taylor P、Climie S、他 (2007)。「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」。Mol . Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 。
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