ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ATP2B4 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ATP2B4、ATP2B2、MXRA1、PMCA4、PMCA4b、PMCA4x、ATPase 細胞膜 Ca2+ 輸送 4 |
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| 外部ID | オミム: 108732; MGI : 88111;ホモロジーン: 48034;ジーンカード:ATP2B4; OMA :ATP2B4 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体1(マウス)[2] |
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| | バンド | 1 E4|1 57.95 cM | 始める | 133,627,195 bp [2] |
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| 終わり | 133,728,779 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 伏在静脈
- 精巣上体の尾
- 子宮体部
- 子宮筋層
- 結腸上皮
- 平滑筋組織
- 左子宮管
- S状結腸の筋層
- 浅側頭動脈
- 腕の皮膚
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| | トップの表現 | - 精母細胞
- 上前頭回
- 一次視覚野
- 海馬歯状回顆粒細胞
- リップ
- 精子細胞
- 吻側回遊流
- 食道
- 性器結節
- 上行大動脈
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ヌクレオチド結合
- PDZドメインバインディング
- ナトリウムチャネル調節活性
- 一酸化窒素合成酵素結合
- 足場タンパク質結合
- 金属イオン結合
- カルモジュリン結合
- 一酸化窒素合成酵素阻害活性
- タンパク質結合
- タンパク質ホスファターゼ2B結合
- ATP結合
- 加水分解酵素活性
- P型カルシウムトランスポーター活性
- タンパク質キナーゼ結合
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- 細胞投影
- 膜
- 細胞内膜で囲まれた細胞小器官
- T管
- 細胞膜
- 細胞膜の不可欠な構成要素
- 精子鞭毛
- 精子主要部分
- 基底外側細胞膜
- Z ディスクドカック
- カベオラ
- ニューロン投影
- 筋膜
- 繊毛
- 運動繊毛
- タンパク質含有複合体
- グルタミン酸シナプス
- シナプス前活性領域膜の不可欠な構成要素
| | 生物学的プロセス |
- 一酸化窒素を介したシグナル伝達の負の調節
- 鞭毛精子の運動性
- 心臓伝導の調節
- 一酸化窒素合成酵素活性の負の調節
- カルシニューリン-NFATシグナル伝達カスケードの負の制御
- シトルリン生合成過程の負の調節
- ペプチジルシステインS-ニトロシル化の負の制御
- RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
- 細胞膜を介したカルシウムイオンの輸入
- 静水圧に対する反応
- 細胞カルシウムイオン恒常性
- イオン輸送
- ペプチジルセリンリン酸化の正の制御
- エピネフリン刺激に対する細胞反応
- イオン膜輸送
- 一酸化窒素生合成過程の負の調節
- カルシウムイオン膜輸送
- カルシウムイオンの膜透過による細胞質への輸入
- 精子形成
- cAMP依存性タンパク質キナーゼ活性の正の調節
- 細胞周期のG1/S期遷移の調節
- ナトリウムイオン膜輸送の調節
- カルシウムイオンの輸出
- 海馬の発達
- アルギニン分解過程の負の調節
- 神経網膜の発達
- 心臓の収縮力の負の調節
- カルシウムイオン輸送
- ストレスに対する心筋肥大の抑制
- 輸送
- 細胞質カルシウムイオン濃度の調節
- 心臓プロセスに関与するアデニル酸シクラーゼ活性化アドレナリン受容体シグナル伝達経路の負の調節
- 膀胱平滑筋の収縮
- アセチルコリンに対する細胞反応
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001684 NM_001001396 NM_001365783 NM_001365784 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001001396 NP_001675 NP_001352712 NP_001352713 |
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| 場所 (UCSC) | 1 章: 203.63 – 203.74 Mb | 1 章: 133.63 – 133.73 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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細胞膜カルシウム輸送ATPase 4は、ヒトではATP2B4遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、反応サイクル中にアスパラギン酸リン酸中間体が形成されることを特徴とするP型一次イオン輸送ATPaseファミリーに属します。これらの酵素は、非常に大きな濃度勾配に逆らって真核細胞から二価カルシウムイオンを除去し、細胞内カルシウム恒常性に重要な役割を果たします。哺乳類の細胞膜カルシウムATPaseアイソフォームは、少なくとも4つの別々の遺伝子によってコードされており、これらの酵素の多様性は転写の選択的スプライシングによってさらに増加します。異なるアイソフォームとスプライスバリアントの発現は、発達、組織および細胞タイプ特異的な方法で制御されており、これらのポンプが特定の細胞および組織の生理学的ニーズに機能的に適応していることを示唆しています。この遺伝子は、細胞膜カルシウムATPaseアイソフォーム4をコードします。異なるアイソフォームをコードする選択的スプライシング転写バリアントが特定されています。[6]
インタラクション
ATP2B4はCASKと相互作用することが示されている。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000058668 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026463 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Olson S、Wang MG、Carafoli E 、 Strehler EE 、McBride OW (1991 年 4 月)。「細胞膜 Ca2(+) 輸送 ATPase をコードする 2 つの遺伝子のヒト染色体 1q25-32 および 12q21-23 への局在」。Genomics。9 ( 4 ): 629– 41。doi :10.1016/0888-7543(91)90356-J。PMID 1674727 。
- ^ ab "Entrez Gene: ATP2B4 ATPase、Ca++ 輸送、細胞膜 4"。
- ^ Schuh K, Uldrijan S, Gambaryan S, Roethlein N, Neyses L (2003 年 3 月). 「細胞膜 Ca2+ ポンプ 4b/CI と Ca2+/カルモジュリン依存性膜関連キナーゼ CASK との相互作用」. The Journal of Biological Chemistry . 278 (11): 9778– 83. doi : 10.1074/jbc.M212507200 . PMID 12511555.
さらに読む
- Møller JV、Juul B、le Maire M (1996 年 5 月)。「P 型 ATPase の構造的構成、イオン輸送、およびエネルギー変換」。Biochimica et Biophysica Acta ( BBA ) - 生体膜に関するレビュー。1286 (1): 1– 51。doi :10.1016/0304-4157(95)00017-8。PMID 8634322 。
- Strehler EE、Zacharias DA (2001 年 1 月)。「選択的スプライシングが細胞膜カルシウムポンプのアイソフォーム多様性を生み出す役割」。生理学レビュー。81 (1): 21– 50。doi : 10.1152 / physrev.2001.81.1.21。PMID 11152753。S2CID 9062253。
- Strehler EE、 Treiman M (2004 年 5 月)。「細胞膜と細胞内部のカルシウムポンプ」。Current Molecular Medicine。4 ( 3): 323– 35。doi :10.2174/1566524043360735。PMID 15101689 。
- Heim R、Hug M、Iwata T、Strehler EE、Carafoli E (1992 年 4 月)。「N 末端コーディング領域の選択的 RNA スプライシングによって生成されたヒト細胞膜カルシウムポンプアイソフォーム 2 の微小多様性」。European Journal of Biochemistry。205 ( 1): 333– 40。doi : 10.1111 /j.1432-1033.1992.tb16784.x。PMID 1313367。
- Brandt P、Neve RL、Kammesheidt A、Rhoads RE、Vanaman TC (1992 年 3 月)。「細胞膜カルシウムポンプ ATPase をコードする mRNA の組織特異的分布の分析と、cDNA およびゲノムレベルでの PMCA4 の交互スプライシング形態の特徴付け」。The Journal of Biological Chemistry。267 ( 7): 4376– 85。doi : 10.1016/ S0021-9258 (18)42846-3。PMID 1531651。
- Strehler EE、James P、Fischer R、Heim R、Vorherr T、Filoteo AG、Penniston JT、Carafoli E (1990 年 2 月)。「ペプチド配列分析と分子クローニングにより、ヒト赤血球膜に 2 つのカルシウムポンプアイソフォームが存在することが判明」。The Journal of Biological Chemistry。265 ( 5): 2835– 42。doi : 10.1016/S0021-9258(19) 39877-1。PMID 2137451 。
- James P、Maeda M、Fischer R、Verma AK、Krebs J、Penniston JT、Carafoli E (1988 年 2 月)。「ヒト赤血球の Ca2+ ポンプのカルモジュリン結合ドメインの同定と一次構造」。The Journal of Biological Chemistry。263 ( 6): 2905–10。doi : 10.1016/S0021-9258 ( 18)69154-9。PMID 2963820。
- Brandt P、Zurini M、Neve RL、Rhoads RE、Vanaman TC (1988 年 5 月)。「細胞膜 Ca2+ ポンプ ATPase の C 末端カルモジュリン様調節ドメイン」。米国科学アカデミー紀要。85 (9): 2914–8。Bibcode : 1988PNAS ... 85.2914B。doi : 10.1073 / pnas.85.9.2914。PMC 280113。PMID 2966397 。
- Howard A、Barley NF、 Legon S、Walters JR (1994 年 10 月)。「ヒトおよびラットの肝臓における細胞膜カルシウムポンプアイソフォーム」。The Biochemical Journal。303 (Pt 1) (Pt 1): 275– 9。doi : 10.1042/bj3030275。PMC 1137587。PMID 7945253 。
- Stauffer TP、Hilfiker H、Carafoli E 、Strehler EE (1994 年 12 月)。「ヒト細胞膜カルシウムポンプ遺伝子の選択的スプライシングオプションの定量分析」。The Journal of Biological Chemistry。269 ( 50 ): 32022。doi : 10.1016/S0021-9258(18)31797-6。PMID 7989379 。
- Stauffer TP、Hilfiker H、Carafoli E 、Strehler EE (1993 年 12 月)。「ヒト細胞膜カルシウムポンプ遺伝子の選択的スプライシングオプションの定量分析」。The Journal of Biological Chemistry。268 ( 34): 25993– 6003。doi : 10.1016/S0021-9258(19)74484-6。PMID 8245032。
- Váradi A、Molnár E、Ashcroft SJ (1996 年 3 月)。「ランゲルハンス島および膵臓ベータ細胞株では、細胞膜 Ca2+-ATPase アイソフォームのユニークな組み合わせが発現している」。The Biochemical Journal。314 ( Pt 2) (Pt 2): 663– 9。doi : 10.1042/bj3140663。PMC 1217098。PMID 8670083 。
- サンティアゴ=ガルシア J、マス=オリバ J、サーベドラ D、ザライン=ヘルツベルグ A (1996 年 2 月)。 「ヒト心臓における mRNA 発現の分析と新規細胞膜 Ca(2+)-ATPase スプライス変異体のクローニング」。分子および細胞生化学。155 (2): 173–82。土井:10.1007/BF00229314。PMID 8700162。S2CID 33539531 。
- Zacharias DA、DeMarco SJ、 Strehler EE (1997 年 4 月)。「ヒト海馬におけるヒト細胞膜 Ca(2+)-ATPase の 4 つのアイソフォームの mRNA 発現」。脳研究。分子脳研究。45 (1): 173– 6。doi :10.1016/S0169-328X(97)00009-0。PMID 9105688 。
- Dean WL、Chen D、Brandt PC、 Vanaman TC (1997 年 6 月)。「cAMP 依存性およびチロシンリン酸化 による血小板細胞膜 Ca2+-ATPase の調節」。The Journal of Biological Chemistry。272 ( 24): 15113– 9。doi : 10.1074/jbc.272.24.15113。PMID 9182531。
- Kim E、DeMarco SJ、Marfatia SM、Chishti AH、Sheng M、Strehler EE (1998 年 1 月)。「細胞膜 Ca2+ ATPase アイソフォーム 4b は、PDZ (PSD-95/Dlg/ZO-1) ドメインを介して膜関連グアニル酸キナーゼ (MAGUK) タンパク質に結合する」。The Journal of Biological Chemistry。273 ( 3): 1591– 5。doi : 10.1074/ jbc.273.3.1591。PMID 9430700。
- Guerini D、García-Martin E、Gerber A、Volbracht C、Leist M、Merino CG、Carafoli E (1999 年 1 月)。「小脳顆粒ニューロンにおける細胞膜 Ca2+ ポンプアイソフォームの発現は Ca2+ によって調節される」。The Journal of Biological Chemistry。274 (3): 1667– 76。doi : 10.1074/jbc.274.3.1667。PMID 9880546。
- Rosado JA、Sage SO (2000 年 6 月)。「ヒト血小板における低分子GTPase およびホスホイノシチドによる細胞膜 Ca2+-ATPase の調節」。The Journal of Biological Chemistry。275 ( 26): 19529– 35。doi : 10.1074/ jbc.M001319200。PMID 10748016。
外部リンク