ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
AT7 ...8 8 9 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 30 39 30 40 50 60 85 96 108 118 12 識別子 エイリアス ATG7 、APG7-LIKE、APG7L、GSA7、オートファジー関連7、SCAR31 外部ID オミム :608760; MGI : 1921494; ホモロジーン : 4662; ジーンカード :ATG7; OMA :ATG7 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 染色体6(マウス) [2] バンド 6|6 E3 始める 114,620,058 bp [2] 終わり 114,837,575 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 単球 アキレス腱 卵母細胞 ランゲルハンス島 結腸上皮 睾丸 顆粒球 血 頬粘膜細胞 直腸
トップの表現 腰椎神経節 顆粒球 精母細胞 桑実胚 桑実胚 精子細胞 性器結節 胎児の尾 受精卵 肝臓の左葉
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質ホモ二量体化活性
転写因子結合
ユビキチン活性化酵素活性
タンパク質結合
酵素活性を活性化するユビキチン様修飾因子
Atg12活性化酵素活性
Atg8活性化酵素活性
細胞成分
細胞質
軸糸
細胞外領域
軸索
分泌顆粒腔
フィコリン-1を多く含む顆粒腔
細胞質
ファゴフォア組み立て部位
生物学的プロセス
タンパク質分解過程の正の調節
高酸素に対する細胞反応
飢餓に対する細胞反応
膜融合
ウイルスに対する防御反応
タンパク質修飾プロセスの正の調節
アポトーシス過程の正の調節
タンパク質輸送
タンパク質脂質化
ウイルスによる宿主のオートファジーの抑制
タンパク質のユビキチン化
オートファジー
エージング
グルコースに対する反応
マクロオートファジー
栄養レベルへの反応
好中球脱顆粒
細胞死の負の調節
モルヒネに対する細胞反応
ミトコンドリアDNA複製の負の調節
ニューロン死の調節
フッ化物に対する反応
酸化ストレスによるニューロン死の抑制
ミトコンドリアのオートファジー
オートファゴソームの組み立て
C末端タンパク質の脂質化
窒素欠乏に対する細胞反応
核の部分的なミクロオートファジー
後期核食作用
オートファジーの正の制御
概日リズムの調節
シャペロン介在オートファジー
小さなタンパク質結合によるタンパク質修飾
リズミカルなプロセス
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001136031 NM_001144912 NM_006395 NM_001349232 NM_001349233 NM_001349234 NM_001349235 NM_001349236 NM_001349237 NM_001349238
NM_001253717 NM_001253718 NM_028835 NM_001379130
RefSeq (タンパク質) NP_001129503 NP_001138384 NP_006386 NP_001336161 NP_001336162 NP_001336163 NP_001336164 NP_001336165 NP_001336166 NP_001336167
NP_001240646 NP_001240647 NP_083111 NP_001366059
場所 (UCSC) 3 章: 11.27 – 11.56 Mb 6 章: 114.62 – 114.84 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
オートファジー関連7は、ヒトでは ATG7 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] GSA7、APG7L、APG7-LIKEと関連している。 [6]
ATG 7は植物と動物の両方の ゲノム に存在し、細胞の分解とリサイクルに必須のタンパク質として機能します。 [7] [8] この配列は、細胞内でのオートファゴソーム膜と融合の独特な発達に必要なユビキチン-プロテアソームシステム (UPS) と関連しています。 [9]
ATG7は酵母細胞ピキア・パストリス GSA7および サッカロミセス・セレビシエ APG7との相同性に基づいて同定された 。このタンパク質はペルオキシソーム膜と液胞膜の融合に必要であると思われる。 [10]
オートファジーは恒常性維持に役立つ重要な細胞プロセスです。細胞質小器官と高分子を破壊してリサイクルします。オートファジーの開始中、ATG7 はATG12 や ATG8 などの ユビキチン様タンパク質 (UBL) に対して E-1 酵素のように機能します。ATG7 はこれらの UBL タンパク質に結合し、E-2 酵素への転移を活性化することで、これらの分子を標的にするのを助けます。ATG7 はこれらのオートファジー特有の UBL システムの両方で役割を果たしているため、オートファゴソームの組み立てに不可欠な調節因子となっています。 [11]
E1活性化タンパク質のATP結合部位および触媒部位と相同性を持つATG7は、システイン残基を使用して遊離ユビキチン分子とチオールエステル結合を形成します。 [9] [12] UPSを介して、ユビキチンは他のオートファジー関連タンパク質、E2結合タンパク質、E3タンパク質リガーゼに結合し続け、ユビキチンを標的基質に結合させてオートファジーを誘導します。 [13]
ATG 7は、 ATG12 / ATG5 配列ユビキチン化カスケードと関連することが多い。また、ストレスや栄養不足の環境では、 p53 細胞周期経路の存在にも関連する。 [14] [15]
参考文献
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^ オンラインメンデル遺伝学 (OMIM):オートファジー7、S.セレビシエ、ホモログ、ATG7 - 608760
^ 「オートファジーのメカニズム:2016年ノーベル生理学・医学賞」 ScienceDaily . 2017年10月20日 閲覧 。
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さらに読む
Tanida I, Tanida-Miyake E, Komatsu M, Ueno T, Kominami E (2002 年 4 月)。「ヒト Apg3p/Aut1p ホモログは、複数の基質、GATE-16、GABARAP、および MAP-LC3 に対する本物の E2 酵素であり、hApg12p から hApg5p への結合を促進する」。The Journal of Biological Chemistry . 277 (16): 13739–44. doi : 10.1074/jbc.M200385200 . PMID 11825910。
Tanida I, Tanida-Miyake E, Nishitani T, Komatsu M, Yamazaki H, Ueno T, Kominami E (2002 年 3 月)。「マウス Apg12p は、3 つの Apg8p ホモログよりもマウス Apg7p に対して基質選択性がある」。 生化学 および 生物物理学的研究通信 。292 (1): 256–62。doi :10.1006/bbrc.2002.6645。PMID 11890701 。
水島 暢、吉森 孝、大隅 勇 ( 2002年 12 月) 。 「マウス Apg10 は Apg12 結合酵素として機能 : 結合媒介酵母ツーハイブリッド法による解析」。FEBS Letters。532 ( 3 ): 450–4。doi :10.1016/S0014-5793(02)03739-0。PMID 12482611。S2CID 37247321。
Nemoto T, Tanida I, Tanida-Miyake E, Minematsu-Ikeguchi N, Yokota M, Ohsumi M, Ueno T, Kominami E (2003 年 10 月)。「マウス APG10 ホモログは、Apg12p 結合のための E2 様酵素であり、MAP-LC3 修飾を促進する」。The Journal of Biological Chemistry . 278 (41): 39517–26. doi : 10.1074/jbc.m300550200 . PMID 12890687。
大月 哲、太田 哲、西川 哲、林 和、鈴木 裕、山本 丈、若松 亜、木村 和、坂本 和、波多野 直、河合 裕、石井 俊、斉藤 和、小島 俊、杉山 達、小野 達也、岡野 和、吉川 裕、青塚 S、佐々木 N、服部 A、奥村 K、永井 K、菅野 S、磯貝 T (2007)。 「オリゴキャップされたcDNAライブラリーからの分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする完全長ヒトcDNAの選択のためのシグナル配列およびキーワードトラップのインシリコ」。 DNA 研究 。 12 (2): 117-26。 土井 : 10.1093/dnares/12.2.117 。 PMID 16303743。
Tanida I, Sou YS, Minematsu-Ikeguchi N, Ueno T, Kominami E (2006 年 6 月). 「Atg8L/Apg8L は、ヒト Atg4B、Atg7、および Atg3 によって媒介される哺乳類 Atg8 結合の 4 番目の哺乳類修飾因子です」。The FEBS Journal . 273 (11): 2553–62. doi : 10.1111/j.1742-4658.2006.05260.x . PMID 16704426. S2CID 11899126.
外部リンク