ヒトのタンパク質コード遺伝子
ABCB9 識別子 エイリアス ABCB9 、EST122234、TAPL、ATP結合カセットサブファミリーBメンバー9 外部ID オミム ：605453; MGI : 1861729; ホモロジーン : 10491; ジーンカード ：ABCB9; OMA :ABCB9 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 5番染色体（マウス） [2] バンド 5|5 女性 始める 124,199,593 bp [2] 終わり 124,233,861 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 頬粘膜細胞 浅側頭動脈 迷走神経背側運動核 右前頭葉 男性生殖細胞 小脳の右半球 精子 卵母細胞 前頭前皮質 腹側被蓋野
トップの表現 第四脳室脈絡叢 嗅周囲皮質 上前頭回 嗅内皮質 一次視覚野 小脳皮質 嗅結節 一次運動野 CA3フィールド 延髄
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
ヌクレオチド結合 ATPase活性 タンパク質ホモ二量体化活性 膜貫通輸送体の活性 ABC型オリゴペプチドトランスポーター活性 ATP結合 ABC型ペプチドトランスポーター活性 ATPase結合膜輸送体の活性 タンパク質結合 ペプチド膜輸送活性 細胞成分
膜の不可欠な構成要素 初期エンドソーム 膜 小胞体膜の不可欠な構成要素 小胞体 リソソーム リソソーム膜 細胞内膜で囲まれた細胞小器官 生物学的プロセス
膜輸送 ペプチド輸送 MHCクラスIを介した抗原処理とペプチド抗原の提示 タンパク質輸送 オリゴペプチド膜輸送 輸送 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001243013 NM_001243014 NM_019624 NM_019625 NM_203444 NM_203445
RefSeq (タンパク質) NP_001229942 NP_001229943 NP_062570 NP_062571 NP_982269
場所 (UCSC) 12 章: 122.92 – 122.98 Mb 5 章: 124.2 – 124.23 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
ATP結合カセットサブファミリーBメンバー9は、 ヒトでは ABCB9 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
この遺伝子によってコードされる膜関連タンパク質は、ATP結合カセット（ABC）トランスポーターのスーパーファミリーのメンバーです。ABCタンパク質は、細胞外膜と細胞内膜を介してさまざまな分子を輸送します。ABC遺伝子は、7つの異なるサブファミリー（ABC1、MDR/TAP、MRP、ALD、OABP、GCN20、White）に分けられます。このタンパク質は、MDR/TAPサブファミリーのメンバーです。MDR/TAPサブファミリーのメンバーは、多剤耐性と抗原提示に関与しています。このハーフトランスポーターの機能はまだ決定されていませんが、このタンパク質はリソソームで役割を果たしている可能性があります。この遺伝子の 選択的スプライシング により、異なる基質仕様を持つ可能性のある 異なる アイソフォームが生成されます。 [6]
参照
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000150967 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000029408 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Allikmets R、Gerrard B、 Hutchinson A、Dean M (1997 年 2 月)。「ヒト ABC スーパーファミリーの特性評価: 発現配列タグ データベースを使用した 21 個の新しい遺伝子の分離とマッピング」。Hum Mol Genet。5 ( 10 ): 1649–55。doi : 10.1093/hmg/5.10.1649。PMID 8894702 。 ^ ab "Entrez Gene: ABCB9 ATP結合カセット、サブファミリーB (MDR/TAP)、メンバー9"。
さらに読む
Bonaldo MF、Lennon G、Soares MB (1997)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする 2 つのアプローチ」。Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548。 Zhang F, Zhang W, Liu L, et al. (2000). 「リソソームに関連する ATP 結合カセットタンパク質 ABCB9 の特性」 J. Biol. Chem . 275 (30): 23287–94. doi : 10.1074/jbc.M001819200 . PMID 10748049. 永瀬 剛、菊野 亮、石川 健、他 (2000)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XVII。in vitro で巨大タンパク質をコードする脳由来の 100 個の新しい cDNA クローンの完全配列」。DNA Res . 7 (2): 143–50. doi : 10.1093/dnares/7.2.143 . PMID 10819331。 Kobayashi A, Kasano M, Maeda T, et al. (2000). 「半分型の ABC トランスポーター TAPL はげっ歯類とヒトの間で高度に保存されており、ヒト遺伝子は TAP1 および TAP2 とは対照的にインターフェロン-γ に反応しない」 J. Biochem . 128 (4): 711–8. doi :10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022805. PMID 11011155. Saito S, Iida A, Sekine A, et al. (2002). 「日本人集団における ATP 結合カセットサブファミリー B (ABCB/MDR/TAP) の 9 つのメンバーをコードする遺伝子の 326 の遺伝的変異」 J. Hum. Genet . 47 (1): 38–50. doi : 10.1007/s10038-002-8653-6 . PMID 11829140. Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 Kobayashi A, Hori S, Suita N, Maeda M (2003). 「抗原処理様タンパク質（TAPL、ABCB9）に関連するヒトトランスポーターの遺伝子構成：選択的スプライシング変異体とプロモーター活性の分析」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 309 (4): 815–22. doi :10.1016/j.bbrc.2003.08.081. PMID 13679046。 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。 Beausoleil SA、Jedrychowski M、 Schwartz D、他 (2004)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 101 ( 33 ) : 12130–5。Bibcode :2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073/ pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935 。 Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。 Homma K, Kikuno RF, Nagase T, et al. (2004). 「不安定なタンパク質ドメインをコードする選択的スプライスバリアントがヒトの脳に存在する」 J. Mol. Biol . 343 (5): 1207–20. doi :10.1016/j.jmb.2004.09.028. PMID 15491607. Wolters JC、Abele R、Tampé R (2005)。「ホモ二量体ATP結合カセットトランスポーターTAP-like (ABCB9)によるペプチドの選択的かつATP依存性転座」。J . Biol. Chem . 280 (25): 23631–6. doi : 10.1074/jbc.M503231200 . PMID 15863492。 Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). 「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」 Genome Res . 16 (1): 55–65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 . Ohashi-Kobayashi A, Ohashi K, Du WB, et al. (2006). 「酵母で発現したヒトTAP様（ABCB9）の薬剤耐性活性の検討」 Biochem. Biophys. Res. Commun . 343 (2): 597–601. doi :10.1016/j.bbrc.2006.03.002. PMID 16554024.
外部リンク この記事には、 パブリックドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
