ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ヤフ2 |
|---|
 |
| 利用可能な構造 |
|---|
| 電子データ | オルソログ検索: PDBe RCSB |
|---|
|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | YAF2、YY1関連因子2 |
|---|
| 外部ID | オミム:607534; MGI : 1914307;ホモロジーン:136401;ジーンカード:YAF2; OMA :YAF2 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | クロ。 | 15番染色体(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 15|15 E3 | 始める | 93,182,159 bp [2] |
|---|
| 終わり | 93,234,816 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| トップの表現 | - 右耳介
- アキレス腱
- 腓腹筋
- 結腸上皮
- 左心室
- 太ももの筋肉
- 心室帯
- 腓骨神経
- 神経節隆起
- 生殖腺
|
| | トップの表現 | - 海馬のI領域
- バレル皮質
- 水晶体上皮
- 網膜色素上皮
- 黒質
- 脈絡叢上皮
- 虹彩
- 前頭前皮質
- 血
- 外頸動脈
|
| | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- タンパク質結合
- 金属イオン結合
- 転写活性化因子活性
- 転写コリプレッサー活性
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 転写の正の制御、DNAテンプレート
- 転写の負の調節、DNAテンプレート
- 転写の調節、DNAテンプレート
- 転写、DNAテンプレート
- G0からG1への遷移の負の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オルソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | | |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | NM_001012424 NM_001190977 NM_001190979 NM_001190980 NM_005748
|
|---|
NM_001320080 |
| |
|---|
| RefSeq (タンパク質) | |
|---|
NP_001177906 NP_001177908 NP_001177909 NP_001307009 NP_005739 |
| |
|---|
| 場所 (UCSC) | 12章: 42.16 – 42.24 Mb | 15 章: 93.18 – 93.23 Mb |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
YY1関連因子2は、ヒトではYAF2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、筋肉限定遺伝子の負の調節に関与するジンクフィンガータンパク質であるYY1と相互作用する。この遺伝子産物自体には単一のN末端C2-X10-C2ジンクフィンガーが含まれており、YY1とは対照的に、筋形成分化中にアップレギュレーションされる。また、カルシウム活性化プロテアーゼであるm-カルパインによるYY1のタンパク質分解切断を促進することから、このタンパク質がYY1の負の効果に拮抗するメカニズムが示唆される。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000015153 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000022634 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Kalenik JL、Chen D、Bradley ME、Chen SJ、Lee TC (1997 年 3 月)。「多機能転写因子 YY1 と相互作用する新規ジンクフィンガータンパク質の酵母ツーハイブリッドクローニング」。Nucleic Acids Res . 25 (4): 843–9. doi :10.1093/nar/25.4.843. PMC 146511 . PMID 9016636。
- ^ ab 「Entrez Gene: YAF2 YY1 関連因子 2」。
さらに読む
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、et al. (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Mädge B, Geisen C, Möröy T, Schwab M (2003). 「Yaf2 は Myc の生物学的機能を阻害する」. Cancer Lett . 193 (2): 171–6. doi :10.1016/S0304-3835(02)00696-1. PMID 12706874.
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Ogawa H, Ishiguro K, Gaubatz S, et al. (2002). 「G0 細胞で E2F および Myc 応答遺伝子を占有するクロマチン修飾因子との複合体」. Science . 296 (5570): 1132–6. Bibcode :2002Sci...296.1132O. doi :10.1126/science.1069861. PMID 12004135. S2CID 34863978.
- Sawa C, Yoshikawa T, Matsuda-Suzuki F, et al. (2002). 「YEAF1/RYBP と YAF-2 は、YY1 および E4TF1/hGABP 転写因子の補因子ファミリーの機能的に異なるメンバーです」。J . Biol. Chem . 277 (25): 22484–90. doi : 10.1074/jbc.M203060200 . PMID 11953439。
- Bannasch D、Mädge B、Schwab M (2001)。「Yaf2 と MycN の中央領域との機能的相互作用」。Oncogene . 20 ( 41): 5913–9. doi :10.1038/sj.onc.1204747. PMID 11593398. S2CID 33486505.
外部リンク