ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| WIPI2 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | WIPI2、ATG18B、Atg21、WIPI-2、CGI-50、WDリピートドメイン、ホスホイノシチド相互作用2、IDDSSA |
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| 外部ID | OMIM :609225; MGI :1923831; HomoloGene :90887; GeneCards :WIPI2; OMA :WIPI2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 5番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 5|5 G2 | 始める | 142,613,453 bp [2] |
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| 終わり | 142,656,343 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 中側頭回
- ブロードマン領域23
- 乳首
- 嗅球
- ベータ細胞
- 迷走神経下神経節
- 腹側被蓋野
- 耳下腺
- ポンス
- 内皮細胞
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| | トップの表現 | - 精母細胞
- 涙腺
- 右腎臓
- 視床下部背内側核
- 桑実胚
- 桑実胚
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 上前頭回
- 蝸牛管の前庭膜
- 精子細胞
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ホスファチジルイノシトール-5-リン酸結合
- タンパク質結合
- ホスファチジルイノシトール-3-リン酸結合
- ホスファチジルイノシトール-3,5-ビスリン酸結合
- 脂質結合
| | 細胞成分 |
- オートファゴソーム
- 細胞質
- ファゴフォアアセンブリ部位膜
- 膜
- ファゴフォア組み立て部位
- 膜の外因性成分
- 核質
- タンパク質含有複合体
| | 生物学的プロセス |
- オートファジー
- オートファゴソームの成熟
- マクロオートファジー
- オートファゴソームの組み立て
- ミトコンドリアのオートファジー
- タンパク質脂質化
- 核のオートファジー
- タンパク質のファゴフォア組み立て部位への局在
- オートファゴソームの組み立てに関与するタンパク質の脂質化
- 異種食
- 飢餓に対する細胞反応
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001033518 NM_001033519 NM_001033520 NM_001278299 NM_015610
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NM_016003 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001028690 NP_001028691 NP_001028692 NP_001265228 NP_056425
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NP_057087 NP_056425.1 |
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| 場所 (UCSC) | 7 章: 5.19 – 5.23 Mb | 5 章: 142.61 – 142.66 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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WDリピートドメインホスホイノシチド相互作用タンパク質2は、ヒトではWIPI2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
WD40リピートタンパク質は、多くの重要な生物学的機能の重要な構成要素です。これらは、同時かつ可逆的なタンパク質間相互作用のためのベータプロペラプラットフォームを提示することにより、多タンパク質複合体の組み立てを制御します。WIPI2などのWD40リピートタンパク質のWIPIサブファミリーのメンバーは、7枚羽根のプロペラ構造を持ち、リン脂質との相互作用のための保存されたモチーフを含みます。[5] [6]
WIPI2 は Atg18 の哺乳類ホモログであり、Atg21 とは異なり、密接に関連したタンパク質WIPI1も同様です。WIPI2 mRNA は、一般的に使用されるいくつかの実験細胞株 (HEK293A、HeLa、A431) およびいくつかの癌細胞株で容易に検出されますが、WIPI1 の発現は癌細胞に限定されています[要出典] (ただし、多くのヒト組織でも検出されます)。
Atgタンパク質はオートファジーを制御します。オートファジーは細胞の健康を維持し、栄養欠乏期間を生き延びるために必要なリソソーム分解経路であり、また癌、神経変性、さまざまな病原体に対する免疫反応にも役割を果たします。 [7] WIPI2はDFCP-1、ULK-1、Atg16とともに形成中のオートファゴソームに早期にリクルートされ、Atg8(LC3)の脂質化を正に制御します。これはWIPI1には当てはまりません。WIPI2はリソソーム制御において重要な役割を果たすことが示されています。
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000157954 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000029578 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab Proikas-Cezanne T、Waddell S、Gaugel A、Frickey T、Lupas A、Nordheim A (2004 年 12 月)。「新規 7 ブレード WIPI タンパク質ファミリーのメンバーである WIPI-1alpha (WIPI49) は、ヒトの癌で異常発現し、飢餓誘発性オートファジーに関連している」。Oncogene . 23 ( 58): 9314– 25. doi :10.1038/sj.onc.1208331. PMID 15602573. S2CID 22642893。
- ^ ab 「Entrez Gene: WIPI2 WD リピートドメイン、ホスホイノシチド相互作用 2」。
- ^ Orsi A、Polson HE、Tooze SA(2009年12月)。 「オートファジーに関与する膜輸送イベント」。Curr Opin Cell Biol . 22(2):150~ 6。doi :10.1016/j.ceb.2009.11.013。PMID 20036114 。
* Polson HE、de Lartigue J、Rigden DJ、Reedijk M、Urbé S、Clague MJ、Tooze SA (2010)。「哺乳類 Atg18 (WIPI2) はオメガソームアンカー型ファゴフォアに局在し、LC3 脂質化を正に制御する」。 オートファジー。6 ( 4 ): 506– 22。doi : 10.4161/auto.6.4.11863。PMID 20505359。
さらに読む
- Mehrle A、Rosenfelder H、 Schupp I 、他 (2006)。「2006 年の LIFEdb データベース」。Nucleic Acids Res . 34 (データベース号): D415–8。doi : 10.1093/nar/gkj139。PMC 1347501。PMID 16381901。
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeome から生物学へ: 機能ゲノミクスパイプライン」Genome Res . 14 (10B): 2136–44 . doi :10.1101/gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336 .
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121– 7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Hillier LW 、 Fulton RS、Fulton LA 、他 (2003)。「ヒト染色体7のDNA配列」。Nature . 424 ( 6945): 157– 64。Bibcode :2003Natur.424..157H。doi : 10.1038/nature01782。PMID 12853948。
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, et al. (2001). 「大規模cDNAシーケンシングにより同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」EMBO Rep . 1 (3): 287–92 . doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614 .
- Wiemann S、Weil B、Wellenreuther R、他 (2001)。「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログに向けて:ヒトcDNAをコードする新規完全タンパク質500種の配列決定および分析」。Genome Res . 11 (3): 422– 35. doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166 。
- Hartley JL、Temple GF、Brasch MA (2001)。「In Vitro 部位特異的組換えを用いた DNA クローニング」。Genome Res . 10 (11): 1788–95 . doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863 。
- Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, et al. (2000). 「比較プロテオミクスによる Caenorhabditis elegans で進化的に保存されている新規ヒト遺伝子の同定」Genome Res . 10 (5): 703–13 . doi :10.1101/gr.10.5.703. PMC 310876 . PMID 10810093.
- <メタデータを入力するには、欠落している最初の著者を追加してください。> (1999)。「完全なヒトゲノム配列に向けて」。Genome Res . 8 (11): 1097– 108。doi : 10.1101/ gr.8.11.1097。PMID 9847074 。