アップワード・サン・リバー遺跡

2013年に行われた遺跡の発掘調査で、研究者たちは火葬された人物の真下の層から2人の女児の遺骨を発見した。^{[ 1 ]} 2人は赤土で覆われ、装飾された鹿角の棒4本、石製のダーツの穂先2つ、両面加工石器などの副葬品とともに竪穴式埋葬で一緒に埋葬されていた。^{[ 11 ]} 鹿角の棒とダーツの穂先は武器の一部であった可能性が高い。^{[ 4 ]}地元の人々は2人にXach'itee'aanenh t'eede gaay（日の出の少女）とYełkaanenh t'eede gaay（夜明けの薄明の少女） という名前を与え、考古学者はそれぞれUSR1とUSR2と呼んでいる。^{[ 9 ]}

1個体（USR2）は胎児期で、おそらく死産した30週齢の胎児であり、もう1個体（USR1）は6～12週齢の乳児であった。^{[ 12 ] [ 9 ]}胎児期の個体は、アメリカ大陸で発見された唯一の胎児期で最年少の後期更新世の個体である。 ^{[ 1 ]} 3個体とも夏に死亡した。^{[ 13 ] [ 2 ]}彼らの歯は、ネイティブアメリカンや北東アジア人の歯と最も類似した特徴を示している。^{[ 12 ] [ 6 ]}

古代の集団と比較すると、USR1とUSR2は、オン・ユア・ニーズ洞窟のシュカ・カーに最も近い遺伝的近縁性を示している。^{[ 16 ]} USR1は、アンジック1、ケネウィックマン、または約6,000年前のルーシー諸島の女性など、アメリカ大陸の後の古代の個体には見られない方法で、シベリア人や東アジア人との遺伝的近縁性も示している。 ^{[ 17 ]} USR1は、古代のネイティブアメリカン集団が北部ネイティブアメリカンと南部ネイティブアメリカンの系統に分かれたという仮説よりも前の集団に属しており、後のどちらの集団とも遺伝的にクラスターを形成しない。^{[ 18 ]} USR1は、スワード半島のトレイルクリーク洞窟の洞窟2の個体と明確なクレードを形成する。^{[ 19 ]}

現代の集団と比較すると、USR1 は現代のネイティブ アメリカンに最も近い遺伝的親和性を示し、次にシベリア人、東アジア人である。^{[ 9 ]} USR1 は、現代のネイティブ アメリカンのどの集団とも遺伝的にクラスターを形成しない。^{[ 9 ]} USR1からマルタ少年までの遺伝的距離は、現代のネイティブ アメリカンの集団からマルタ少年までの遺伝的距離と同じである。^{[ 20 ]} USR1 は、現代のネイティブ アメリカンには見られないデニソワ人に対する追加の遺伝的親和性を示している。この追加のデニソワ人に対する親和性は、異質なデニソワ人の混入レベルが高い古代集団からのサンプリングの変動によるものと考えられる。 ^{[ 21 ]}

核DNA分析によると、USR1とUSR2は近縁関係にあり、おそらく異父兄弟からいとこまでの範囲にあると考えられる。^{[ 22 ]}しかし、mtDNA分析では、2人の乳児は母方の血縁関係にないことが示されている。^{[ 10 ] [ 2 ]} 2人の乳児は、アメリカ大陸でのみ見られるmtDNA系統を持っている。^{[ 10 ]} 生後6～12週の乳児USR1はC1bに由来する。^{[ 10 ]}出生前の乳児USR2は、トライアルクリーク洞窟の個体とも一致するハプログループB2の基底系統を持っている。この特定のmtDNA系統は、アメリカ大陸で一般的に見られる派生B2系統とは異なる。^{[ 10 ] [ 19 ]}

両個体はこれらのmtDNA系統の最北端の発見であり、古代集団のmtDNA多様性が現代人よりも高いことを示しており、ベーリング海峡停滞仮説を裏付けている。^{[ 10 ]}

USR1は、古代ベーリンジア人と呼ばれる仮説上の古代集団を代表するものと考えられている。^{[ 14 ]}古代ベーリンジア人は現在、USR1、USR2、およびトレイルクリーク洞窟の9,000年前の個体の3人から構成されていると考えられている。^{[ 23 ]}この遺伝的クラスターは考古学的証拠と一致しており、アップワードサンリバー遺跡とトレイルクリーク洞窟は互いに750 km（466マイル）以上離れているにもかかわらず、両方とも遺物技術に類似点がある。 ^{[ 24 ]} USR1のDNA分析に基づくと、古代ベーリンジア人は約36,000年前に東アジア人から分岐し、約25,000年前まで継続的な遺伝子流動があったと仮説されている。古代ベーリンジア人はまた、約22,000～18,100年前にネイティブアメリカンの祖先から分岐したと仮説されている。^{[ 14 ]}  

表現型解析によると、USR1は現代の東アジア人やネイティブアメリカンによく見られる派生型EDARアレルを持っていません。 ^{[ 25 ]}しかし、USR1は選択的掃去の標的となった派生型rs174570 FADS2アレルを持っています。^{[ 26 ]}