ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| TSEN34 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | TSEN34、LENG5、PCH2C、SEN34、SEN34L、tRNAスプライシングエンドヌクレアーゼサブユニット34 |
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| 外部ID | OMIM :608754; MGI :1913328; HomoloGene :44182; GeneCards :TSEN34; OMA :TSEN34 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 7番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 7|7 A1 | 始める | 3,695,862 bp [2] |
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| 終わり | 3,704,023 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 血
- 右副腎
- 右副腎皮質
- 左副腎
- 左副腎皮質
- 生殖腺
- 横行結腸粘膜
- 右卵巣
- 右子宮管
- 左卵巣
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| | トップの表現 | - 中脳
- 神経管
- 卵黄嚢
- 胚葉上層
- 胎盤
- 菱脳体
- 心室帯
- 胃
- リップ
- 心臓
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- tRNA-イントロンエンドヌクレアーゼ活性
- リアーゼ活性
- 核酸結合
- ヌクレアーゼ活性
| | 細胞成分 |
- 核小体
- 核
- tRNA-イントロンエンドヌクレアーゼ複合体
- 核質
| | 生物学的プロセス |
- mRNA処理
- tRNA型イントロンスプライス部位の認識と切断
- RNAホスホジエステル結合加水分解、エンドヌクレアーゼ
- エンドヌクレアーゼによる切断と連結を介したtRNAスプライシング
- RNAホスホジエステル結合加水分解
- tRNA処理
- 核酸ホスホジエステル結合加水分解
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | ENSG00000278622 ENSG00000274129 ENSG00000274796 ENSG00000278712 ENSG00000275165
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ENSG00000278605 ENSG00000273896 ENSG00000274078 ENSG00000274672 ENSG00000170892 |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001077446 NM_001282332 NM_001282333 NM_024075 NM_001386740 |
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NM_001164204 NM_001164205 NM_024168 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001070914 NP_001269261 NP_001269262 NP_076980 |
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NP_001157676 NP_001157677 NP_077130 |
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| 場所 (UCSC) | 19章: 54.19 – 54.19 Mb | 7 章: 3.7 – 3.7 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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tRNAスプライシングエンドヌクレアーゼサブユニットSen34は、ヒトではTSEN34遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6] [7]
tRNAスプライシングは細胞の成長と分裂に必要な基本的なプロセスです。SEN34はtRNAスプライシングエンドヌクレアーゼのサブユニットであり、tRNAスプライシングの最初のステップであるイントロンの除去を触媒します(Paushkin et al., 2004)。[OMIM提供] [7]
インタラクション
TSEN34はTSEN2と相互作用することが示されている。[6]
参考文献
- ^ abc ENSG00000274129、ENSG00000274796、ENSG00000278712、ENSG00000275165、ENSG00000278605、ENSG00000273896、ENSG00000274078、ENSG00000274672、ENSG00000170892 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000278622、ENSG00000274129、ENSG00000274796、ENSG00000278712、ENSG00000275165、ENSG00000278605、 ENSG00000273896、ENSG00000274078、ENSG00000274672、ENSG00000170892 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000035585 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Wende H、 Volz A、 Ziegler A (2000年9 月)。「ヒト白血球受容体クラスターの特徴は広範な遺伝子重複と大きな逆位」。免疫遺伝学。51 (8–9): 703–13。doi :10.1007/s002510000187。PMID 10941842。S2CID 20719684 。
- ^ ab Paushkin SV、Patel M、Furia BS、Peltz SW、Trotta CR(2004年4月)。「ヒトエンドヌクレアーゼ複合体の同定により、tRNAスプライシングとプレmRNA 3'末端形成の関連が明らかになった」。Cell。117 ( 3 ):311–21。doi :10.1016 /S0092-8674(04) 00342-3。PMID 15109492。S2CID 16049289 。
- ^ ab 「Entrez Gene: TSEN34 tRNAスプライシングエンドヌクレアーゼ34ホモログ(S. cerevisiae)」。
さらに読む
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). 「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Bonaldo MF、Lennon G、Soares MB (1997)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする 2 つのアプローチ」。Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548。
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」. Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
外部リンク
- 橋小脳低形成症 2 型および 4 型に関する GeneReviews/NCBI/NIH/UW のエントリ