トリブ1

トリブ1
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	5CEM、5CEK、5IGO、5IGQ
識別子
エイリアス	TRIB1、C8FW、GIG-2、GIG2、SKIP1、TRB-1、TRB1、トリブルス擬似キナーゼ1
外部ID	オミム：609461; MGI : 2443397;ホモロジーン: 75216;ジーンカード：TRIB1; OMA :TRIB1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体8（ヒト）
終わり	125,438,403 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	15番染色体（マウス）
終わり	59,528,948 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	膀胱粘膜; ; S状結腸粘膜; ; 臓側胸膜; ; 胆嚢; ; 副鼻腔粘膜; ; 精巣上体の尾; ; 耳下腺; ; 腹直筋の骨格筋組織; ; 腎臓尿細管; ; 甲状腺;
	トップの表現
	顆粒球; ; 網膜色素上皮; ; 耳下腺; ; 涙腺; ; 胎児の尾; ; 性器結節; ; ランゲルハンス島; ; 左結腸; ; レンズ; ; リップ;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質キナーゼ活性; ユビキチンタンパク質転移酵素調節活性; タンパク質キナーゼ阻害活性; 転写因子結合; タンパク質結合; マイトジェン活性化タンパク質キナーゼキナーゼ結合; ATP結合; ユビキチンタンパク質リガーゼ結合;
細胞成分	細胞質; 核;
生物学的プロセス	平滑筋細胞増殖の抑制; タンパク質キナーゼ活性の負の調節; マクロファージ分化の正の調節; 平滑筋細胞の移動の負の調節; DNA結合転写因子活性の負の制御; 好中球分化の負の調節; リポ多糖類を介したシグナル伝達経路の負の調節; タンパク質リン酸化; JNKカスケード; リポ多糖類に対する反応; 好酸球分化の正の調節; MAPキナーゼ活性の調節; プロテアソームユビキチン依存性タンパク質分解プロセスの正の制御;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	10221
	211770
	ENSG00000173334
	ENSMUSG00000032501
	Q96RU8
	Q8K4K4
	NM_001282985 ; NM_025195
	NM_144549
	NP_001269914 ; NP_079471
	NP_653132
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

トリブルズホモログ1は、ヒトではTRIB1遺伝子によってコードされるタンパク質キナーゼである。^[5]^[6]^[7]このタンパク質擬似キナーゼ（擬似酵素）の相同遺伝子は、動物界のほぼあらゆるところに見られる。^[8]これは、MAPK経路のMAPKKレベルのシグナル伝達タンパク質に結合することによって生物学的機能を発揮し、したがって、細胞の増殖、アポトーシスおよび分化を媒介するこの経路の機能において調節的役割を誘発する。トリブルズ-1はtrib1遺伝子によってコードされ、ヒトでは最長腕（q）の8番染色体の位置24.13に見られる。最近の結晶構造は、トリブルズ1が「壊れた」Cヘリックス領域、C/EBPalphaなどのユビキチン化基質の結合部位、および重要な調節性Cテール領域を含む珍しい3D構造であることを示している。^[9]TRIB2やTRIB3と同様に、TRIB1は最近、潜在的なアロステリック薬物標的として考えられている。^[10]

関数

トリブルス-1は、タンパク質キナーゼスーパーファミリーのCAMK Ser/Thrタンパク質キナーゼファミリーの一部であるトリブルスサブファミリーの3つのメンバーの1つです。トリブルスサブファミリーは擬似キナーゼの1つであり、その構造内に推定キナーゼ領域を発現しながらも非触媒性であることを意味します。トリブルスサブファミリーには機能的なATP結合ポケットがないため、基質をリン酸化することはできません。代わりに、トリブルスタンパク質は足場タンパク質として機能し、基質に結合して機能に局在化します^[8]

Tribbles-1 の発現は非常に可変性が高く、時間と細胞の種類に応じて常に変化しており^[11] 、これは細胞内に大量の調節が存在することを示唆しています。タンパク質の一次構造には PEST 領域が含まれており、細胞内で分解されやすいタンパク質であることを示しています。Tribbles-1 は基質に結合することで自身の発現を調節する役割を果たしており、MAPK 経路上でその機能を生み出すだけでなく、結合中に分解から保護する働きもします。これにより、 Tribbles-1 の機能に正のフィードバックループが形成されます。Tribbles-1 の機能は、その量の増加を直接助けるからです。正のフィードバックループは、外部刺激の緩和が必要な状況で生物学全体でよく見られるため、Tribbles-1 が示す正のフィードバックループは、Tribbles-1 が細胞応答において機能的な役割を果たしていることを示唆しています。

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000173334 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000032501 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Wilkin F, Suarez-Huerta N, Robaye B, Peetermans J, Libert F, Dumont JE, Maenhaut C (1997 年 9 月). 「犬の甲状腺細胞における分裂促進経路によって mRNA が制御されるリン酸化タンパク質の特性」. European Journal of Biochemistry . 248 (3): 660–8. doi : 10.1111/j.1432-1033.1997.t01-1-00660.x . PMID 9342215.
^ Hegedus Z、Czibula A、Kiss - Toth E (2006 年 7 月)。「トリブル: 細胞機能の新たな調節因子; 進化的側面」。細胞および分子生命科学。63 (14): 1632–41。doi :10.1007/s00018-006-6007-9。PMC 11136108。PMID 16715410。S2CID 24556931 。
^ 「Entrez Gene: TRIB1 トリブルホモログ 1 (ショウジョウバエ)」.
^ ab Eyers PA、Keeshan K、 Kannan N (2017 年 4 月)。「21 世紀のトリブル: 生物学と疾患におけるトリブル擬似キナーゼの進化する役割」。Trends in Cell Biology。27 (4): 284–298。doi :10.1016/ j.tcb.2016.11.002。PMC 5382568。PMID 27908682。
^ マーフィー JM、ナカタニ Y、ジェイミソン SA、ダイ W、ルーセット IS、メイス PD (2015 年 11 月)。「TRIB1シュードキナーゼによるCCAATエンハンサー結合タンパク質動員の分子機構」。構造。23 (11): 2111–21。土井：10.1016/j.str.2015.08.017。PMID 26455797。
^ Foulkes DM、Byrne DP、Bailey FP、Eyers PA（2015年10月）。「トリブル擬似キナーゼ：化学生物学と創薬の新たなターゲット？」生化学協会誌。43 （5）：1095–103。doi ： 10.1042 /BST20150109。PMID 26517930 。
^ Sung HY、Francis SE、 Crossman DC、Kiss-Toth E (2006 年 4 月)。「哺乳類トリブルの発現とシグナル伝達調節機能の調節は細胞型に特異的である」。免疫学レター。104 (1–2): 171–7。doi :10.1016/j.imlet.2005.11.010。PMID 16364454 。

さらに読む

Tang K、 Finley RL、Nie D、Honn KV (2000 年 3 月)。「酵母ツーハイブリッドスクリーニングによる 12-リポキシゲナーゼと細胞タンパク質の相互作用の特定」。生化学。39 ( 12): 3185–91。doi :10.1021/bi992664v。PMID 10727209 。
Wu M、Xu LG、Zhai Z、Shu HB (2003 年 7 月)。「SINK は p65 と相互作用する NF-kappaB 依存性転写の負の調節因子である」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 29): 27072–9。doi : 10.1074/ jbc.M209814200。PMID 12736262。
Kiss-Toth E、Bagstaff SM、Sung HY、Jozsa V、Dempsey C、Caunt JC、他 (2004 年 10 月)。「ヒトトリブル、ミトゲン活性化タンパク質キナーゼカスケードを制御するタンパク質ファミリー」。The Journal of Biological Chemistry。279 ( 41): 42703–8。doi : 10.1074/jbc.M407732200。hdl : 2262 / 33449。PMID 15299019。
Xu C、Zhang J、Huang X、Sun J、Xu Y、Tang Y、他 (2006 年 6 月)。「ヒトペプチジルプロリルイソメラーゼ様タンパク質 1 の溶液構造と SKIP との相互作用に関する考察」。The Journal of Biological Chemistry。281 ( 23): 15900–8。doi : 10.1074/ jbc.M511155200。PMID 16595688 。
Sung HY、Guan H、Czibula A、King AR、Eder K、Heath E、他 (2007 年 6 月)。「ヒト tribbles-1 は MAPK シグナル伝達経路を介して平滑筋細胞の増殖と走化性を制御する」。The Journal of Biological Chemistry。282 ( 25 ): 18379–87。doi : 10.1074/ jbc.M610792200。PMC 2366084。PMID 17452330。

外部リンク

UCSC ゲノムブラウザにおける TRIB1 ヒト遺伝子の位置。
UCSC ゲノムブラウザにおける TRIB1 ヒト遺伝子の詳細。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000173334 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000032501 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid9342215-5] Wilkin F, Suarez-Huerta N, Robaye B, Peetermans J, Libert F, Dumont JE, Maenhaut C (1997 年 9 月). 「犬の甲状腺細胞における分裂促進経路によって mRNA が制御されるリン酸化タンパク質の特性」. European Journal of Biochemistry . 248 (3): 660–8. doi : 10.1111/j.1432-1033.1997.t01-1-00660.x . PMID 9342215.

[pmid16715410-6] ^ Hegedus Z、Czibula A、Kiss - Toth E (2006 年 7 月)。「トリブル: 細胞機能の新たな調節因子; 進化的側面」。細胞および分子生命科学。63 (14): 1632–41。doi :10.1007/s00018-006-6007-9。PMC 11136108。PMID 16715410。S2CID 24556931 。

[entrez-7] 「Entrez Gene: TRIB1 トリブルホモログ 1 (ショウジョウバエ)」.

[pmid27908682-8] Eyers PA、Keeshan K、 Kannan N (2017 年 4 月)。「21 世紀のトリブル: 生物学と疾患におけるトリブル擬似キナーゼの進化する役割」。Trends in Cell Biology。27 (4): 284–298。doi :10.1016/ j.tcb.2016.11.002。PMC 5382568。PMID 27908682。

[pmid26455797-9] マーフィー JM、ナカタニ Y、ジェイミソン SA、ダイ W、ルーセット IS、メイス PD (2015 年 11 月)。「TRIB1シュードキナーゼによるCCAATエンハンサー結合タンパク質動員の分子機構」。構造。23 (11): 2111–21。土井：10.1016/j.str.2015.08.017。PMID 26455797。

[pmid26517930-10] Foulkes DM、Byrne DP、Bailey FP、Eyers PA（2015年10月）。「トリブル擬似キナーゼ：化学生物学と創薬の新たなターゲット？」生化学協会誌。43 （5）：1095–103。doi ： 10.1042 /BST20150109。PMID 26517930 。

[pmid16364454-11] ^ Sung HY、Francis SE、 Crossman DC、Kiss-Toth E (2006 年 4 月)。「哺乳類トリブルの発現とシグナル伝達調節機能の調節は細胞型に特異的である」。免疫学レター。104 (1–2): 171–7。doi :10.1016/j.imlet.2005.11.010。PMID 16364454 。