ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| TNRC6B |
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| 識別子 |
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| エイリアス | TNRC6B、6Bを含むトリヌクレオチド繰り返し、アダプター6Bを含むトリヌクレオチド繰り返し、GDSBA |
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| 外部ID | オミム:610740; MGI : 2443730;ホモロジーン: 66194;ジーンカード:TNRC6B; OMA :TNRC6B - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 15番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 15|15 E1 | 始める | 80,595,514 bp [2] |
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| 終わり | 80,825,286 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 頬粘膜細胞
- 鼻咽頭上皮
- 腓骨神経
- 卵母細胞
- 精巣上体頭
- 海綿骨
- 二次卵母細胞
- 精嚢
- 乳首
- 精巣上体の尾
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| | トップの表現 | - 受精卵
- 二次卵母細胞
- 顆粒球
- 性器結節
- 脛骨大腿関節
- 胎児の尾
- 網膜の神経層
- 人間の胎児
- レンズ
- 下丘
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- RNA干渉
- 核転写されたmRNAポリ(A)テール短縮の正の制御
- 翻訳の規制
- 核転写されたmRNAの分解過程の正の調節、脱アデニル化依存性の分解
- 遺伝子サイレンシング
- 翻訳阻害によるmiRNAを介した遺伝子サイレンシング
- Wntシグナル伝達経路、カルシウム調節経路
- 巨核球分化の制御
- 遺伝子発現の正の調節
- 遺伝子発現の負の調節
- miRNAによる遺伝子サイレンシング
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_015088 NM_001024843 NM_001162501 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001020014 NP_001155973 NP_055903 |
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| 場所 (UCSC) | 22章: 40.04 – 40.34 Mb | 15 章: 80.6 – 80.83 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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トリヌクレオチド反復配列含有遺伝子6Bタンパク質は、ヒトではTNRC6B遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
インタラクション
TNRC6BはEIF2C2と相互作用することが示されている。[6]また、アルゴノートタンパク質と関連することも知られており、 HeLa細胞におけるmiRNA誘導遺伝子サイレンシングに必要であることが示されている。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000100354 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000047888 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: 6B を含む TNRC6B トリヌクレオチド反復」。
- ^ Till S、Lejeune E、Thermann R、Bortfeld M、Hothorn M、Enderle D、Heinrich C、Hentze MW、Ladurner AG (2007 年 10 月)。「Argonaute 相互作用タンパク質の保存モチーフが Argonaute PIWI ドメインを介して機能的相互作用を媒介する」Nat. Struct. Mol. Biol . 14 (10): 897– 903. doi :10.1038/nsmb1302. PMID 17891150. S2CID 8136380.
- ^ Meister G, Landthaler M, Peters L, Chen PY, Urlaub H, Lührmann R, Tuschl T (2005 年 12 月). 「新規アルゴノート関連タンパク質の同定」. Curr. Biol . 15 (23): 2149– 55. doi :10.1016/j.cub.2005.10.048. hdl : 11858/00-001M-0000-0012-E763-B . PMID 16289642. S2CID 2740901.
さらに読む
- 中島大将、岡崎直人、山川博司、他(2003年)。 「KIAA 遺伝子の発現準備が整った cDNA クローンの構築: 330 個の KIAA cDNA クローンの手動キュレーション」。DNA研究所9 (3): 99–106 .土井: 10.1093/dnares/9.3.99。PMID 12168954。
- Bonaldo MF、Lennon G、Soares MB (1997)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする 2 つのアプローチ」。Genome Res . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548。
- Gubin AN、Njoroge JM、 Bouffard GG、Miller JL (1999)。「増殖中のヒト赤血球細胞における遺伝子発現」。ゲノミクス。59 ( 2 ) : 168– 77。doi : 10.1006/geno.1999.5855。PMID 10409428 。
- Kikuno R, Nagase T, Ishikawa K, et al. (1999). 「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XIV. 試験管内で巨大タンパク質をコードする脳由来の100個の新しいcDNAクローンの完全配列」。DNA Res . 6 (3): 197– 205. doi : 10.1093/dnares/6.3.197 . PMID 10470851。
- Dunham I, Shimizu N, Roe BA, et al. (1999). 「ヒト染色体22のDNA配列」. Nature . 402 (6761): 489– 95. Bibcode :1999Natur.402..489D. doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Schneider MD、Najand N、Chaker S、et al. (2006)。「Gawky は、ショウジョウバエの初期発生に必要な細胞質 mRNA プロセシングボディの構成要素です。」J. Cell Biol . 174 (3): 349– 58. doi :10.1083/jcb.200512103. PMC 2064231. PMID 16880270 。