Protein-coding gene in the species Homo sapiens
| TINF2 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | TINF2、DKCA3、TIN2、TERF1相互作用核因子2 |
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| 外部ID | オミム:604319; MGI : 107246;ホモロジーン: 8264;ジーンカード:TINF2; OMA :TINF2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 14番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 14 C3|14 28.19 cM | 始める | 55,912,146 bp [2] |
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| 終わり | 55,919,277 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 顆粒球
- 右副腎
- 右副腎皮質
- 左副腎
- 単球
- 左副腎皮質
- 骨髄細胞
- 血
- 扁桃腺
- 脾臓
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| | トップの表現 | - 一次卵母細胞
- 二次卵母細胞
- 原始的な線
- 受精卵
- 胚葉上層
- 精細管
- 精母細胞
- 胎児の尾
- 顆粒球
- 体節
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 核テロメアキャップ複合体
- 核マトリックス
- 核小体周囲染色中心
- 核質
- 染色体
- シェルターインコンプレックス
- テロメア
- 核
- 核体
| | 生物学的プロセス |
- 染色体、テロメア領域へのタンパク質の局在
- 上皮細胞増殖の抑制
- テロメアの組み立て
- タンパク質ADPリボシル化の負の制御
- テロメアキャッピング
- テロメラーゼによるテロメア維持の負の制御
- テロメアの延長によるテロメア維持の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | |
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ENSG00000092330 ENSG00000284915 |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001099274 NM_012461 NM_001363668 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001092744 NP_036593 NP_001350597 |
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| 場所 (UCSC) | 14章: 24.24 – 24.24 Mb | 14 章: 55.91 – 55.92 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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TERF1相互作用核因子2は、ヒトではTINF2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] TINF2はテロメアの末端にあるシェルターリンタンパク質複合体の構成要素である。[7]
インタラクション
TINF2はACD [8] [9]、 POT1 [ 8] [9] [10]、TERF1 [5] [9] [11]と相互作用することが示されている。
参考文献
- ^ abc ENSG00000284915 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000092330、ENSG00000284915 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000007589 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab Kim SH、Kaminker P、 Campisi J (1999年12月)。「TIN2、ヒト細胞におけるテロメア長の新たな調節因子」。Nature Genetics。23 ( 4): 405–12。doi : 10.1038/70508。PMC 4940194。PMID 10581025。
- ^ 「Entrez Gene: TINF2 TERF1 (TRF1) 相互作用核因子 2」。
- ^ Savage SA、Giri N、Baerlocher GM、Orr N、Lansdorp PM、Alter BP (2008 年 2 月)。「シェルターインテロメア保護複合体の構成要素である TINF2 は、先天性角化異常症で変異している」。American Journal of Human Genetics。82 ( 2): 501–9。doi :10.1016/ j.ajhg.2007.10.004。PMC 2427222。PMID 18252230。
- ^ ab Ye JZ、Hockemeyer D、Krutchinsky AN、Loayza D、Hooper SM、Chait BT、de Lange T (2004 年 7 月)。「POT1 相互作用タンパク質 PIP1: POT1 を TIN2/TRF1 複合体にリクルートするテロメア長調節因子」。遺伝子と 発達。18 ( 14 ): 1649–54。doi :10.1101/gad.1215404。PMC 478187。PMID 15231715。
- ^ abc Liu D、Safari A、O'Connor MS、Chan DW、Laegeler A、Qin J、Songyang Z (2004 年 7 月)。「PTOP は POT1 と相互作用し、テロメアへの局在を調節する」。Nature Cell Biology。6 ( 7 ): 673–80。doi :10.1038 / ncb1142。PMID 15181449。S2CID 11543383 。
- ^ Loayza D 、De Lange T (2003 年 6 月)。「TRF1 テロメア長制御の末端トランスデューサーとしての POT1」。Nature . 423 ( 6943): 1013–8。Bibcode : 2003Natur.423.1013L。doi : 10.1038/nature01688。PMID 12768206。S2CID 4370276。
- ^ シュテルツル U、ヴォルム U、ラロウスキー M、ハーニッヒ C、ブレンベック FH、ゲーラー H、シュトロディッケ M、ツェンクナー M、シェーンヘル A、ケッペン S、ティム J、ミンツラフ S、エイブラハム C、ボック N、キーツマン S、ゲーデ A、トクセズE、ドローゲ A、クロビッチ S、コーン B、バーヒマイヤーW、Lehrach H、Wanker EE (2005 年 9 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワーク: プロテオームに注釈を付けるためのリソース」。セル。122 (6): 957–68。土井:10.1016/j.cell.2005.08.029。hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0。PMID 16169070。
さらに読む
- Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」. Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Li B、Oestreich S、de Lange T (2000 年 5 月)。「ヒト Rap1 の同定: テロメア進化への影響」。Cell . 101 ( 5): 471–83. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80858-2 . PMID 10850490。
- Mignon -Ravix C、Depetris D、Delobel B、Croquette MF、Mattei MG (2002 年 2 月)。「ヒト間質テロメアは、生体内で特定の TRF2 および TIN2 タンパク質と結合する」。European Journal of Human Genetics。10 ( 2): 107–12。doi : 10.1038/ sj.ejhg.5200775。PMID 11938440。
- 山田 正之、辻 暢、中村 正之、森合 亮、小林 大介、八木橋 明、渡辺 暢 (2003)。「TRF1、TRF2、TIN2 遺伝子のダウンレギュレーションは胃癌のテロメア DNA の維持に重要である」。抗癌研究。22 (6A): 3303–7。PMID 12530079。
- Loayza D 、De Lange T (2003 年 6 月)。「TRF1 テロメア長制御の末端トランスデューサーとしての POT1」。Nature。423 (6943 ) : 1013–8。Bibcode : 2003Natur.423.1013L。doi : 10.1038/nature01688。PMID 12768206。S2CID 4370276。
- Kim SH、Han S、You YH、Chen DJ 、 Campisi J (2003 年 7 月)。「ヒトテロメア関連タンパク質 TIN2 は、in vitro でテロメア DNA 領域間の相互作用を刺激する」。EMBO レポート。4 ( 7 ): 685–91。doi :10.1038/ sj.embor.embor872。PMC 1326318。PMID 12835755。
- Loayza D、Parsons H、Donigian J、Hoke K、de Lange T (2004 年 3 月)。「ヒト POT1 の DNA 結合特性: ノナマー 5'-TAGGGTTAG-3' 最小結合部位、配列特異性、および多量体部位への内部結合」。The Journal of Biological Chemistry。279 ( 13): 13241–8。doi : 10.1074/ jbc.M312309200。PMID 14715659。
- Ye JZ、de Lange T (2004年6 月)。「TIN2 は TRF1 テロメア長制御複合体におけるタンキラーゼ 1 PARP 調節因子である」。Nature Genetics。36 ( 6): 618–23。doi : 10.1038/ ng1360。PMID 15133513 。
- Liu D、Safari A、O'Connor MS、Chan DW、Laegeler A、Qin J、Songyang Z (2004 年 7 月)。「PTOP は POT1 と相互作用し、テロメアへの局在を調節する」。Nature Cell Biology。6 ( 7 ) : 673–80。doi :10.1038/ncb1142。PMID 15181449。S2CID 11543383。
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- Ye JZ、Donigian JR、van Overbeek M、Loayza D、Luo Y、Krutchinsky AN、Chait BT、de Lange T (2004 年 11 月)。「TIN2 は TRF1 と TRF2 に同時に結合し、テロメア上の TRF2 複合体を安定化する」。The Journal of Biological Chemistry。279 ( 45): 47264–71。doi : 10.1074/ jbc.M409047200。PMID 15316005。
- Liu D、O'Connor MS、Qin J 、Songyang Z (2004 年 12 月)。「テロソーム、複数のテロメアタンパク質によって形成される哺乳類テロメア関連複合体」。The Journal of Biological Chemistry。279 ( 49): 51338–42。doi : 10.1074/jbc.M409293200。PMID 15383534。
- Oh BK、Kim YJ、Park C、Park YN (2005 年 1 月)。 「テロメア結合タンパク質 TRF1、TRF2、および TIN2 の上方制御は、ヒトの多段階肝癌発生中のテロメア短縮に関連している」。 アメリカ病理学ジャーナル。166 (1): 73–80。doi :10.1016/S0002-9440(10)62233- X。PMC 1602303。PMID 15632001。
- Kaminker P、Plachot C、Kim SH、Chung P、Crippen D、Petersen OW、Bissell MJ、Campisi J、Lelièvre SA (2005 年 3 月)。「ヒト乳腺上皮細胞の成長停止における高次核組織化: テロメア関連タンパク質 TIN2 の新たな役割」。Journal of Cell Science。118 ( Pt 6): 1321–30。doi : 10.1242/ jcs.01709。PMC 2933191。PMID 15741234。
外部リンク
- 先天性角化異常症に関する GeneReviews/NCBI/NIH/UW のエントリ
- PDBe-KBは、ヒトTERF1相互作用核因子2(TINF2)のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要を提供します。