転写因子IID

転写因子 II D ( TF _II D ) は、RNA ポリメラーゼ II 前開始複合体を構成するいくつかの一般的な転写因子の 1 つです。RNAポリメラーゼ II ホロ酵素は、真核生物の RNA ポリメラーゼ IIの一種で、生細胞内のタンパク質コード遺伝子のプロモーターにリクルートされます。これは、 RNA ポリメラーゼ II 、一般的な転写因子のサブセット、およびSRB タンパク質として知られる調節タンパク質で構成されています。転写の開始前に、転写因子 II D (TF _II D) 複合体は、TATA ボックス、イニシエーター、下流プロモーター、モチーフ 10、または下流調節要素を含むプロモーター配列モチーフを特異的に認識することにより、遺伝子のコアプロモーターDNA に結合します。^[1]

機能

RNAポリメラーゼIIによる転写の開始に必要な70以上のポリペプチドの活動を調整する
コアプロモーターに結合してポリメラーゼを適切に配置する
転写複合体の残りの部分を組み立てるための足場として機能する
規制信号のチャネルとして機能する

構造

TF _II D自体は、TBPとTATA結合タンパク質関連因子（TBP関連因子、またはTAF ）と呼ばれるいくつかのサブユニットで構成されています。試験管内では、TATAボックスを含むプロモーターでの転写に必要なのはTBPのみです。^[2]しかし、特にTBPが結合するTATAボックス配列がない場合、TAFはプロモーター選択性を追加します。^{[1] TAFは、TF}_II D ^[3]とB-TF _II Dの2つの異なる複合体に含まれています。 ^[4] TF _II D複合体は、TBPと8つ以上のTAFで構成されています。しかし、TBPの大部分は、TBPとTAFII170（BTAF1 ）が1:1の比率で構成されているB-TF _II D複合体に存在します。^[5] TF _II DとB-TF _{II Dは同等ではありません。TF}_II Dを利用した転写反応はSP1などの遺伝子特異的転写因子に応答しますが、B-TF _II Dで再構成された反応は応答しません。^[5]

TF _II D複合体のサブユニットには以下が含まれる: ^[2]

TBP (TATA 結合タンパク質)、または:
- 動物におけるTBP関連因子（TBPL1 ; TBPL2）^[6]
TAF1（TAFII250）
TAF2（CIF150）
TAF3 (TAFII140)
TAF4 (TAFII130/135)
TAF4B (TAFII105)
TAF5（TAFII100）
TAF6 (TAFII70/80)
TAF7 (TAFII55)
TAF8 (TAFII43)
TAF9 (TAFII31/32)
TAF9B (TAFII31L)
TAF10（TAFII30）
TAF11 (TAFII28)
TAF12 (TAFII20/15)
TAF13 (TAFII18)
TAF15 (TAFII68)

参照

参考文献

^ ab Louder, RK; He, Y; López-Blanco, JR; Fang, J; Chacón, P; Nogales, E (2016). 「プロモーター結合TFIIDの構造とヒト開始前複合体アセンブリのモデル」。Nature . 531 (7596): 604–609. Bibcode :2016Natur.531..604L. doi :10.1038/nature17394. PMC 4856295 . PMID 27007846.
^ ab Lee, Tong Ihn; Young, Richard A. (2000). 「真核生物タンパク質コード遺伝子の転写」Annu. Rev. Genet . 34 : 77–137. doi :10.1146/annurev.genet.34.1.77. PMID 11092823.
^ Dynlacht, Brian David; Hoey, Timothy; Tjian, Robert (1991年8月). 「転写活性化を媒介するTATA結合タンパク質に関連する共活性化因子の単離」. Cell . 66 (3): 563–576. doi :10.1016/0092-8674(81)90019-2. PMID 1907890. S2CID 5000858.
^ 「NCBI Entrez GeneID: 9044 BTAF1 BTAF1 RNAポリメラーゼII、B-TFIID転写因子関連、170 kDa（Mot1ホモログ、S. cerevisiae）」。
^ ab Timmers, H.; Meyers, RE; Sharp, PA (1992年9月). 「転写因子B-TFIIDの構成」Proc Natl Acad Sci USA . 89 (17): 8140–4. Bibcode :1992PNAS...89.8140T. doi : 10.1073/pnas.89.17.8140 . PMC 49872 . PMID 1387711.
^ Duttke, SH (2015年3月). 「基礎転写機構の進化と多様化」.生化学の動向. 40 (3): 127–9. doi :10.1016/j.tibs.2015.01.005. PMC 4410091. PMID 25661246 .

外部リンク

米国国立医学図書館医学件名表(MeSH)の転写 + 因子 + TFIID
EM データバンク (EMDB) の TFIID の 3D 電子顕微鏡構造

[:0-1] Louder, RK; He, Y; López-Blanco, JR; Fang, J; Chacón, P; Nogales, E (2016). 「プロモーター結合TFIIDの構造とヒト開始前複合体アセンブリのモデル」。Nature . 531 (7596): 604–609. Bibcode :2016Natur.531..604L. doi :10.1038/nature17394. PMC 4856295 . PMID 27007846.

[Lee-2] Lee, Tong Ihn; Young, Richard A. (2000). 「真核生物タンパク質コード遺伝子の転写」Annu. Rev. Genet . 34 : 77–137. doi :10.1146/annurev.genet.34.1.77. PMID 11092823.

[Dynlacht-3] Dynlacht, Brian David; Hoey, Timothy; Tjian, Robert (1991年8月). 「転写活性化を媒介するTATA結合タンパク質に関連する共活性化因子の単離」. Cell . 66 (3): 563–576. doi :10.1016/0092-8674(81)90019-2. PMID 1907890. S2CID 5000858.

[BTAF-4] 「NCBI Entrez GeneID: 9044 BTAF1 BTAF1 RNAポリメラーゼII、B-TFIID転写因子関連、170 kDa（Mot1ホモログ、S. cerevisiae）」。

[Timmers-5] Timmers, H.; Meyers, RE; Sharp, PA (1992年9月). 「転写因子B-TFIIDの構成」Proc Natl Acad Sci USA . 89 (17): 8140–4. Bibcode :1992PNAS...89.8140T. doi : 10.1073/pnas.89.17.8140 . PMC 49872 . PMID 1387711.

[pmid25661246-6] Duttke, SH (2015年3月). 「基礎転写機構の進化と多様化」.生化学の動向. 40 (3): 127–9. doi :10.1016/j.tibs.2015.01.005. PMC 4410091. PMID 25661246 .

機能

構造

参照

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外部リンク

関連するトピック

RNA ポリメラーゼ II

前開始複合体

一般的な転写因子

ポリメラーゼ II ホロ酵素は、