ヒトのタンパク質コード遺伝子
| TFDP1 |
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| 利用可能な構造 |
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| ＰＤＢ | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | TFDP1、DP1、DRTF1、Dp-1、DILC、転写因子Dp-1 |
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| 外部ID | オミム：189902; MGI : 101934;ホモロジーン: 38276;ジーンカード：TFDP1; OMA :TFDP1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置（マウス） |
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 | | クロ。 | 染色体8（マウス）[2] |
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| | バンド | 8|8 A1.1 | 始める | 13,338,751 bp [2] |
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| 終わり | 13,378,448 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス（相同遺伝子） |
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| トップの表現 | - 二次卵母細胞
- 海綿骨
- 心室帯
- 骨髄
- 子宮内膜間質細胞
- 神経節隆起
- 直腸
- 鼻粘膜の嗅覚領域
- 食道粘膜
- 頬粘膜細胞
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| | トップの表現 | - 顆粒球
- 胚葉上層
- 心室帯
- 真皮
- 胎児の尾
- 腹壁
- 胎児肝臓造血前駆細胞
- 毛包
- 性器結節
- 原始的な線
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合
- タンパク質ドメイン特異的結合
- DNA結合転写因子活性
- タンパク質結合
- 転写活性化因子活性
- 転写因子結合
- RNAポリメラーゼII転写調節領域配列特異的DNA結合
- DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
| | 細胞成分 |
- 転写制御因子複合体
- 核
- ミトコンドリア
- 核質
- 細胞質
- 細胞質
- RNAポリメラーゼII転写調節因子複合体
| | 生物学的プロセス |
- 転写の調節、DNAテンプレート
- RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
- アポトーシスシグナル伝達経路に関与するミトコンドリア膜へのタンパク質挿入の正の調節
- 細胞周期
- 細胞集団の増殖
- DNA損傷応答、p53クラスメディエーターによるシグナル伝達により細胞周期停止を引き起こす
- 転写、DNAテンプレート
- 有糸分裂細胞周期のG1/S移行に関与する転写の制御
- RNAポリメラーゼIIによる転写
- G0からG1への遷移の負の調節
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
- 脂肪細胞増殖の抑制
- 表皮の発達
- アノイキス
- 転写の正の制御、DNAテンプレート
- 細胞周期の調節
- DNA生合成プロセスの調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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NM_001291765
NM_001291766
NM_001291768
NM_009361
NM_001358991 |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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NP_001278694
NP_001278695
NP_001278697
NP_033387
NP_001345920 |
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| 場所 (UCSC) | 13 章: 113.58 – 113.64 Mb | 8 章: 13.34 – 13.38 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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転写因子Dp-1は、ヒトではTFDP1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
関数
E2F転写因子ファミリー（MIM 189971参照）は、さまざまな細胞プロモーター、特に細胞周期に関与するプロモーターの発現を制御します。E2F因子は、二量体化パートナーDP1と関連してホモ二量体またはヘテロ二量体としてDNAに結合します。TFDP1は、関連する転写因子ファミリーの最初の例である可能性があります。TFDP2（MIM 602160）を参照してください。[OMIM提供] [7]
インタラクション
TFDP1 は以下と相互作用することが示されています:
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000198176 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000038482 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Girling R、Partridge JF、Bandara LR、Burden N、Totty NF、Hsuan JJ、La Thangue NB (1993 年 11 月)。「転写因子 DRTF1/E2F の新しい構成要素」。Nature . 365 ( 6445 ) : 468。Bibcode :1993Natur.365R.468G。doi : 10.1038/365468d0。PMID 8413592。
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- ^ ab 「Entrez Gene: TFDP1 転写因子 Dp-1」。
- ^ ab Sardet C, Vidal M, Cobrinik D, Geng Y, Onufryk C, Chen A, Weinberg RA (1995年3月). 「E2Fファミリーの2つのメンバーであるE2F-4とE2F-5は、細胞周期の初期段階で発現する」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (6): 2403– 7. Bibcode :1995PNAS...92.2403S. doi : 10.1073/pnas.92.6.2403 . PMC 42492 . PMID 7892279.
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- ^ Wu CL, Zukerberg LR, Ngwu C, Harlow E, Lees JA (1995年5月). 「E2FとDPファミリータンパク質の生体内関連」. Mol. Cell. Biol . 15 (5): 2536– 46. doi :10.1128/mcb.15.5.2536. PMC 230484. PMID 7739537 .
- ^ Helin K、Wu CL、Fattaey AR、Lees JA、Dynlacht BD、Ngwu C、Harlow E (1993 年 10 月)。 「転写因子E2F-1とDP-1のヘテロ二量体化は、協調的なトランス活性化を引き起こす」。遺伝子開発。7 (10): 1850 – 61. doi : 10.1101/gad.7.10.1850。PMID 8405995。
- ^ Hijmans EM、Voorhoeve PM、Beijersbergen RL、van 't Veer LJ、Bernards R (1995 年 6 月)。「E2F-5、体内で p130 と相互作用する新しい E2F ファミリー メンバー」。Mol . Cell. Biol . 15 (6): 3082– 9. doi :10.1128/mcb.15.6.3082. PMC 230539. PMID 7760804 。
- ^ Sørensen TS、Girling R、Lee CW、Gannon J、Bandara LR、La Thangue NB (1996年10月)。「DP-1とp53の機能的相互作用」。Mol . Cell. Biol . 16 (10): 5888– 95. doi :10.1128/mcb.16.10.5888. PMC 231590. PMID 8816502 。
さらに読む
- Wu CL, Zukerberg LR, Ngwu C, Harlow E, Lees JA (1995). 「E2F と DP ファミリータンパク質の生体内関連」. Mol. Cell. Biol . 15 (5): 2536– 46. doi :10.1128/mcb.15.5.2536. PMC 230484. PMID 7739537 .
- Hijmans EM、Voorhoeve PM、Beijersbergen RL、van 't Veer LJ、Bernards R (1995)。「E2F-5、生体内でp130と相互作用する新しいE2Fファミリーメンバー」。Mol . Cell. Biol . 15 (6): 3082– 9. doi :10.1128/mcb.15.6.3082. PMC 230539. PMID 7760804 。
- Sardet C, Vidal M, Cobrinik D, Geng Y, Onufryk C, Chen A, Weinberg RA (1995). 「E2F ファミリーの 2 つのメンバーである E2F-4 と E2F-5 は、細胞周期の初期段階で発現します」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 92 (6): 2403– 7. Bibcode :1995PNAS...92.2403S. doi : 10.1073/pnas.92.6.2403 . PMC 42492 . PMID 7892279.
- Ginsberg D、Vairo G、Chittenden T、Xiao ZX、Xu G、Wydner KL、DeCaprio JA、Lawrence JB、Livingston DM (1994)。「E2F 転写因子ファミリーの新しいメンバーである E2F-4 は p107 と相互作用する」。Genes Dev . 8 (22): 2665– 79. doi : 10.1101/gad.8.22.2665 . PMID 7958924。
- Beijersbergen RL、Kerkhoven RM、Zhu L、Carlée L、Voorhoeve PM、Bernards R (1994)。「E2F 遺伝子ファミリーの新しいメンバーである E2F-4 は発癌活性を持ち、生体内で p107 と関連する」。Genes Dev . 8 (22): 2680– 90. doi : 10.1101/gad.8.22.2680 . PMID 7958925。
- バンダラ LR、ラム EW、ソーレンセン TS、ザマニアン M、ガーリング R、ラ タング NB (1994)。 「DP-1: pRb およびアデノウイルス E4 orf 6/7 タンパク質による認識に機能的に重要な転写因子 DRTF1/E2F の細胞周期調節されリン酸化された成分」。エンボ J . 13 ( 13 ): 3104–14 .土井:10.1002/j.1460-2075.1994.tb06609.x。PMC 395201。PMID 8039504。
- Helin K、Wu CL、Fattaey AR、Lees JA、Dynlacht BD、Ngwu C、Harlow E (1993)。 「転写因子E2F-1とDP-1のヘテロ二量体化は、協調的なトランス活性化を引き起こす」。遺伝子開発。7 (10): 1850 – 61. doi : 10.1101/gad.7.10.1850。PMID 8405995。
- Rogers KT、Higgins PD、Milla MM、Phillips RS、Horowitz JM (1996)。「E2F のヘテロ二量体パートナーである DP-2: 生体内で発現した DP-2 タンパク質の同定と特性評価」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 93 (15): 7594– 9。Bibcode : 1996PNAS ...93.7594R。doi : 10.1073 / pnas.93.15.7594。PMC 38791。PMID 8755520 。
- Sørensen TS、Girling R、Lee CW、Gannon J、Bandara LR、La Thangue NB (1996)。「DP-1 と p53 の機能的相互作用」。Mol . Cell. Biol . 16 (10): 5888– 95. doi :10.1128/mcb.16.10.5888. PMC 231590. PMID 8816502 。
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- Sansal I、Dupont E、Toru D、Evrard C、Rouget P (2000)。「神経細胞の増殖と分化の調節因子であるNPDC-1はE2F-1と相互作用し、DNAへの結合を減らし、転写活性を調節する」。Oncogene . 19 ( 43): 5000– 9. doi :10.1038/sj.onc.1203843. PMID 11042687. S2CID 41370242。
- Hsu SI、Yang CM、Sim KG、Hentschel DM、O'Leary E、Bonventre JV (2001)。「TRIP-Br: E2F-1/DP-1 の転写活性を制御する PHD ジンクフィンガーおよびブロモドメイン相互作用タンパク質の新規ファミリー」。EMBO J. 20 ( 9): 2273– 85. doi :10.1093/emboj/20.9.2273. PMC 125435. PMID 11331592 。
