ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| 税金1BP1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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2M7Q、4BMJ、4NLH、5AAS、4Z4M、4Z4K |
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| 識別子 |
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| エイリアス | TAX1BP1、CALCOCO3、T6BP、TXBP151、Tax1結合タンパク質1 |
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| 外部ID | オミム:605326; MGI : 1289308;ホモロジーン: 4395;ジーンカード:TAX1BP1; OMA :TAX1BP1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体6(マウス)[2] |
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| | バンド | 6 B3|6 25.7 cM | 始める | 52,690,714 bp [2] |
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| 終わり | 52,743,765 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 二次卵母細胞
- 気管支上皮細胞
- 網膜色素上皮
- 羊水
- 鼻咽頭上皮
- 口腔
- 脈絡叢上皮
- 副鼻腔粘膜
- 鼻上皮
- 右心室
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| | トップの表現 | - 回腸上皮
- 角膜実質
- 嗅上皮
- 左結腸
- 精子細胞
- 乳腺
- 胎児の尾
- 第四脳室脈絡叢
- 受精卵
- 精嚢
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 腫瘍壊死因子を介したシグナル伝達経路の調節
- I型インターフェロン産生の抑制
- アポトーシス過程の負の調節
- NF-κB転写因子活性の負の制御
- アポトーシスの過程
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001079864 NM_001206901 NM_001206902 NM_006024 NM_001362794
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NM_001362795 |
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NM_025816 NM_001355595 NM_001355596 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001073333 NP_001193830 NP_001193831 NP_006015 NP_001349723
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NP_001349724 |
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NP_080092 NP_001342524 NP_001342525 |
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| 場所 (UCSC) | 7 章: 27.74 – 27.84 Mb | 6 章: 52.69 – 52.74 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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Tax1結合タンパク質1は、ヒトではTAX1BP1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
インタラクション
TAX1BP1はTNFAIP3 [6]およびTRAF6 [7]と相互作用することが示されています。TAX1BP1はTNFAIP3またはTRAF6に結合し、NF-κBの転写活性化を抑制します。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000106052 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000004535 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: TAX1BP1 Tax1 (ヒトT細胞白血病ウイルスI型) 結合タンパク質1」。
- ^ De Valck D、Jin DY、Heyninck K、Van de Craen M、Contreras R、Fiers W、Jeang KT、Beyaert R (1999 年 7 月)。「ジンクフィンガータンパク質 A20 は、特定のカスパーゼによって切断される新しい抗アポトーシスタンパク質と相互作用する」。Oncogene . 18 ( 29): 4182–90. doi : 10.1038/sj.onc.1202787 . PMID 10435631。
- ^ Ling L, Goeddel DV (2000 年 8 月). 「T6BP、IL-1 シグナル伝達に関与する TRAF6 相互作用タンパク質」.米国科学アカデミー紀要. 97 (17): 9567–72. Bibcode :2000PNAS...97.9567L. doi : 10.1073/pnas.170279097 . PMC 16905. PMID 10920205 .
さらに読む
- サンガーセンター、ワシントン大学ゲノムシーケンシングセンター (1998 年 11 月)。「完全なヒトゲノム配列に向けて」。ゲノム研究。8 (11): 1097–108。doi : 10.1101/ gr.8.11.1097。PMID 9847074 。
- De Valck D、Jin DY、Heyninck K、Van de Craen M、Contreras R、Fiers W、Jeang KT、Beyaert R (1999 年 7 月)。「ジンクフィンガータンパク質 A20 は、特定のカスパーゼによって切断される新しい抗アポトーシスタンパク質と相互作用します」。Oncogene . 18 ( 29): 4182–90. doi : 10.1038/sj.onc.1202787 . PMID 10435631。
- Ling L、Goeddel DV (2000 年 8 月)。「T6BP、IL-1 シグナル伝達に関与する TRAF6 相互作用タンパク質」。米国科学 アカデミー紀要。97 (17): 9567–72。Bibcode : 2000PNAS ...97.9567L。doi : 10.1073/ pnas.170279097。PMC 16905。PMID 10920205。
- Hartley JL、Temple GF、 Brasch MA (2000 年 11 月)。「in vitro部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。ゲノム研究。10 ( 11): 1788–95。doi :10.1101/gr.143000。PMC 310948。PMID 11076863。
- ヴィーマン S、ヴァイル B、ヴェレンロイター R、ガッセンフーバー J、グラスル S、アンゾルゲ W、ベッヒャー M、ブロッカー H、バウアーザックス S、ブルーム H、ラウバー J、デュスターヘフト A、バイエル A、ケーラー K、ストラック N、メーヴェス HW、オッテンヴェルダー B 、オーバーマイヤー B、タンペ J、ホイブナー D、ワンブット R、コーン B、クライン M、プストカ A (2001 年 3 月)。 「ヒトの遺伝子とタンパク質のカタログを目指して: ヒト cDNA をコードする 500 個の新規完全タンパク質の配列決定と分析」。ゲノム研究。11 (3): 422-35。土井:10.1101/gr.GR1547R。PMC 311072。PMID 11230166。
- Klinkenberg M、Van Huffel S、Heyninck K、Beyaert R (2001 年 6 月) 。「NF-kappaB 活性化およびタンパク質間相互作用の阻害における A20 の亜鉛フィンガーの機能的冗長性」。FEBS Letters。498 ( 1 ): 93–7。doi : 10.1016/S0014-5793(01)02504-2。PMID 11389905。S2CID 32414520 。
- Dodon MD、Hamaia S、Martin J、Gazzolo L (2002 年 5月)。「異種核リボ核タンパク質 A1 は、ヒト T 細胞白血病ウイルス 1 型 rex 調節タンパク質とその応答要素との結合を阻害する」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 21): 18744–52。doi : 10.1074/ jbc.M109087200。PMID 11893730。
- Wu K、Bottazzi ME、de la Fuente C、Deng L、Gitlin SD、Maddukuri A、Dadgar S、Li H、Vertes A、Pumfery A、Kashanchi F (2004 年 1 月)。「tax 関連複合体のタンパク質プロファイル」。The Journal of Biological Chemistry。279 ( 1): 495–508。doi : 10.1074/ jbc.M310069200。PMID 14530271。
- Nagaraja GM、Kandpal RP (2004 年 1 月)。「染色体 13q12 にコード化された Rho GTPase 活性化タンパク質は乳癌細胞の増殖を抑制し、酵母ツーハイブリッド スクリーンはいくつかのタンパク質との相互作用を示す」。生化学および生物物理学的研究通信。313 (3): 654–65。doi :10.1016/j.bbrc.2003.12.001。PMID 14697242 。
- Colland F、Jacq X、Trouplin V、Mougin C、Groizeleau C、Hamburger A、Meil A、Wojcik J、Legrain P、Gauthier JM (2004 年 7 月)。 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」。ゲノム研究。14 (7): 1324–32。土井:10.1101/gr.2334104。PMC 442148。PMID 15231748。
- Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (2004 年 9 月). 「ヒトとマウスの遺伝子の配列比較によりプロモーター領域に相同ブロック構造が明らかになった」. Genome Research . 14 (9): 1711–8. doi :10.1101/gr.2435604. PMC 515316. PMID 15342556 .
- Wiemann S、Arlt D、Huber W、Wellenreuther R、Schleeger S、Mehrle A、Bechtel S、Sauermann M、Korf U、Pepperkok R、Sültmann H、Poustka A (2004 年 10 月)。 「ORFeome から生物学へ: 機能的ゲノミクス パイプライン」。ゲノム研究。14 (10B): 2136–44。土井:10.1101/gr.2576704。PMC 528930。PMID 15489336。
- Mehrle A、Rosenfelder H、Schupp I、del Val C、Arlt D、Hahne F、Bechtel S、Simpson J、Hofmann O、Hide W、Glatting KH、Huber W、Pepperkok R、Poustka A、Wiemann S (2006 年 1 月)。「2006 年の LIFEdb データベース」。核酸研究。34 (データベース 号): D415-8。doi :10.1093/nar/gkj139。PMC 1347501。PMID 16381901。
- Morriswood B、Ryzhakov G、Puri C、Arden SD、Roberts R、Dendrou C、Kendrick-Jones J、Buss F (2007 年 8 月)。「T6BP と NDP52 は、サイトカインシグナル伝達と細胞接着において潜在的な役割を果たすミオシン VI 結合パートナーです」。Journal of Cell Science。120 ( Pt 15 ): 2574–85。doi :10.1242/jcs.007005。PMC 2621013。PMID 17635994。