TAF1A

TAF1A
識別子
エイリアス	TAF1A、MGC:17061、RAFI48、SL1、TAFI48、TATAボックス結合タンパク質関連因子、RNAポリメラーゼIサブユニットA
外部ID	オミム：604903; MGI : 109578;ホモロジーン: 4155;ジーンカード：TAF1A; OMA :TAF1A - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体1（ヒト）
終わり	222,589,933 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体1（マウス）
終わり	183,191,020 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	卵母細胞; ; 二次卵母細胞; ; 睾丸; ; 心室帯; ; 生殖腺; ; 神経節隆起; ; アキレス腱; ; 単球; ; リンパ節; ; 子宮内膜間質細胞;
	トップの表現
	一次卵母細胞; ; 受精卵; ; 二次卵母細胞; ; 網膜の神経層; ; 回腸上皮; ; 精母細胞; ; 心室帯; ; パネートセル; ; 髄質集合管; ; 桑実胚;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	DNA結合; タンパク質結合;
細胞成分	微小管細胞骨格; RNAポリメラーゼI転写調節因子複合体; 核; 核質;
生物学的プロセス	RNAポリメラーゼIプロモーターからの転写開始; RNAポリメラーゼIによる転写; RNAポリメラーゼI転写の終結; 転写能のある構造におけるクロマチンのエピジェネティックな維持; RNAポリメラーゼIIによる転写; 転写の調節、DNAテンプレート; 転写、DNAテンプレート; RNAポリメラーゼIプロモーターからの転写伸長;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	9015
	21339
	ENSG00000143498
	ENSMUSG00000072258
	Q15573 ; Q5JRA7
	P97357
	NM_001201536 ; NM_005681 ; NM_139352
	NM_001277957 ; NM_001277958 ; NM_001277959 ; NM_021466
	NP_001188465 ; NP_005672 ; NP_647603
	NP_001264886 ; NP_001264887 ; NP_001264888 ; NP_067441
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

TATAボックス結合タンパク質関連因子RNAポリメラーゼIサブユニットAは、ヒトではTAF1A遺伝子によってコードされる酵素である。^[5]^[6]

関数

RNAポリメラーゼIによる転写の開始には、TATA結合タンパク質（TBP）とRNAポリメラーゼIに特異的な3つのTBP関連因子（TAF）からなる複合体の形成が必要である。選択因子1（SL1）として知られるこの複合体は、リボソームRNA遺伝子のコアプロモーターに結合してポリメラーゼを適切に配置し、制御シグナルのチャネルとして機能する。この遺伝子は、最小のSL1特異的TAFをコードしている。異なるアイソフォームをコードする2つの転写産物が同定されている。^[6]

インタラクション

TAF1Aは酸性ロイシンリッチ核リン酸化タンパク質32ファミリーメンバーA ^[7]およびタンパク質SETと相互作用することが示されている。^[7]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000143498 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000072258 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Comai L、Zomerdijk JC、Beckmann H、Zhou S、Admon A、Tjian R (1994 年 12 月)。「転写因子 SL1 の再構成: SL1 または TFIID サブユニットによる TBP の排他的結合」。Science。266 ( 5193 ) : 1966–72。Bibcode : 1994Sci ...266.1966C。doi :10.1126/science.7801123。PMID 7801123 。
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さらに読む

Rudloff U, Eberhard D, Tora L, Stunnenberg H, Grummt I (1994). 「TBP関連因子はDNAと相互作用し、RNAポリメラーゼI転写の種特異性を制御する」EMBO J. 13 ( 11): 2611–6. doi :10.1002/j.1460-2075.1994.tb06551.x. PMC 395135. PMID 8013460 .
Di Pietro C、Rapisarda A、Amico V、Bonaiuto C、Viola A、Scalia M、Motta S、Amato A、Engel H、Messina A、Sichel G、Grzeschik K、Purrello M (2000)。「クラス I 全般転写開始因子 SL1 の TAF(I)48、TAF(I)63、および TAF(I)110 サブユニットをコードするヒト遺伝子 TAF1A、TAF1B、および TAF1C のゲノム局在」。Cytogenet。Cell Genet。89 ( 1–2 ) : 133–6。doi :10.1159 / 000015592。PMID 10894955。S2CID 27014629 。
Zhai W, Comai L (2000). 「腫瘍抑制因子p53によるRNAポリメラーゼI転写の抑制」Mol. Cell. Biol . 20 (16): 5930–8. doi : 10.1128/MCB.20.16.5930-5938.2000. PMC 86070. PMID 10913176.
Seo SB、McNamara P、Heo S、Turner A、Lane WS、Chakravarti D (2001)。「ヒト細胞複合体INHATによるヒストンのアセチル化と転写の調節、セットオンコプロテインを含む」。Cell . 104 (1): 119–30. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00196-9 . PMID 11163245. S2CID 11144887 .
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Dynes JL、Xu S、Bothner S、Lahti JM、Hori RT (2004)。「カルボキシル末端はTAF(I)48を核と核小体に誘導し、複数の核輸入受容体と結合する」。J . Biochem . 135 (3): 429–38. doi :10.1093/jb/mvh051. PMID 15113842。
山本功、山本正之、花田功、野木勇、松山剛、村松正 (2004)。「RNAポリメラーゼI関連因子PAF49による多重タンパク質間相互作用とrRNA転写におけるPAF49の役割」。Mol . Cell. Biol . 24 (14): 6338–49. doi :10.1128/MCB.24.14.6338-6349.2004. PMC 434256. PMID 15226435 。
Grandori C、Gomez-Roman N、Felton-Edkins ZA、Ngouenet C、Galloway DA、Eisenman RN、White RJ (2005)。「c-Myc はヒトリボソーム DNA に結合し、RNA ポリメラーゼ I による rRNA 遺伝子の転写を刺激する」。Nat . Cell Biol . 7 (3): 311–8. doi :10.1038/ncb1224. PMID 15723054. S2CID 8913931.
ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實＝岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセットスタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005）。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000143498 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000072258 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid7801123-5] Comai L、Zomerdijk JC、Beckmann H、Zhou S、Admon A、Tjian R (1994 年 12 月)。「転写因子 SL1 の再構成: SL1 または TFIID サブユニットによる TBP の排他的結合」。Science。266 ( 5193 ) : 1966–72。Bibcode : 1994Sci ...266.1966C。doi :10.1126/science.7801123。PMID 7801123 。

[entrez-6] 「Entrez Gene: TAF1A TATA ボックス結合タンパク質 (TBP) 関連因子、RNA ポリメラーゼ I、A、48kDa」。

[pmid11163245-7] Seo SB、McNamara P、Heo S、Turner A、Lane WS、Chakravarti D (2001年1月)。「ヒト細胞複合体INHATによるヒストンのアセチル化と転写の調節、セットオンコプロテインを含む」。Cell . 104 ( 1): 119–30. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00196-9 . PMID 11163245. S2CID 11144887.