ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
セット 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス SET 、2PP2A、I2PP2A、IGAAD、IPP2A2、PHAPII、TAF-I、TAF-IBETA、SET核プロトオンコゲン、MRD58 外部ID オミム ：600960; MGI : 1860267; ホモロジーン : 55707; ジーンカード ：セット; OMA :SET - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体2（マウス） [2] バンド 2|2 B 始める 29,947,390 bp [2] 終わり 29,962,589 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 神経節隆起 アキレス腱 心室帯 鼻咽頭上皮 結腸上皮 胚上皮 眼瞼結膜 リンパ節 視神経 壁側胸膜
トップの表現 胎児の尾 胚葉上層 腹壁 移動性腸管神経堤細胞 桑実胚 心室帯 胚 精管 原始的な線 体節
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
DNA結合 ヒストン結合 タンパク質結合 タンパク質ホスファターゼ阻害活性 タンパク質ホスファターゼ調節活性 細胞成分
細胞質 細胞質 核質 小胞体 細胞質の核周囲領域 核 脂肪滴 タンパク質含有複合体 生物学的プロセス
ニューロンのアポトーシス過程の負の調節 ヌクレオソームアセンブリ mRNAの安定性の調節 DNA複製 ヌクレオソーム分解 核細胞質輸送 ウイルスプロセス 転写の負の調節、DNAテンプレート ヒストンのアセチル化の抑制 触媒活性の負の調節 触媒活性の調節 リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性の負の調節 リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性の調節 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001122821 NM_001248000 NM_001248001 NM_003011 NM_001374326
RefSeq (タンパク質) NP_001116293 NP_001234929 NP_001234930 NP_003002 NP_001361255
場所 (UCSC) 9 章: 128.68 – 128.7 Mb 2 章: 29.95 – 29.96 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
タンパク質SETは タンパク質SET1 とも呼ばれ 、 ヒトでは SET 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6] [7]
インタラクション タンパク質 SET は以下と 相互作用する ことが示されています。
参考文献
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さらに読む
Nagata K, Kawase H, Handa H, Yano K, Yamasaki M, Ishimi Y, Okuda A, Kikuchi A, Matsumoto K (1995 年 5 月). 「骨髄性白血病誘発に関連する推定癌遺伝子 set によってコードされる複製因子」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 92 (10): 4279–83. Bibcode :1995PNAS...92.4279N. doi : 10.1073 /pnas.92.10.4279 . PMC 41927. PMID 7753797. Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」. Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. Aomori Y, Pavlakis GN, Copeland TD (1994 年 3 月)。 「 急性未分化白血病の転座切断点によってコード化される核リン酸化タンパク質 SET の生体内リン酸化部位の同定」。FEBS Letters。340 ( 3 ): 231–5。Bibcode :1994FEBSL.340..231A。doi : 10.1016 /0014-5793(94) 80144-4。PMID 8131851。S2CID 36974869 。 Vaesen M、Barnikol-Watanabe S、Götz H、Awni LA、Cole T、Zimmermann B、Kratzin HD、Hilschmann N (1994 年 2 月)。「推定 HLA クラス II 関連タンパク質 2 種の精製と特性: PHAPI および PHAPII」。 生物化学 Hoppe -Seyler。375 ( 2): 113–26。doi :10.1515/bchm3.1994.375.2.113。PMID 8192856 。 Aomori Y, Pavlakis GN, Copeland TD (1994 年 1 月)。「急性未分化白血病の転座切断点によってコード化される核リン酸化タンパク質 SET の同定と特性評価」。The Journal of Biological Chemistry。269 ( 3): 2258–62。doi : 10.1016 / S0021-9258 (17)42162-4。PMID 8294483 。 Adler HT、Nallaseth FS、Walter G、Tkachuk DC (1997 年 11 月)。「HRX 白血病融合タンパク質は、白血病関連タンパク質 SET およびタンパク質ホスファターゼ 2A とヘテロ複合体を形成する」。The Journal of Biological Chemistry。272 ( 45): 28407–14。doi : 10.1074/jbc.272.45.28407。PMID 9353299 。 Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. Carlson SG、Eng E、Kim EG、Perlman EJ、Copeland TD、Ballermann BJ (1998 年 10 月)。「腎臓の発達とウィルムス腫瘍におけるタンパク質ホスファターゼ 2A の阻害剤 SET の発現」。 米国 腎臓 学会 誌 。9 (10): 1873–80。doi : 10.1681/ASN.V9101873。PMID 9773788 。 Brennan CM、Gallouzi IE 、 Steitz JA (2000 年 10 月)。「HuR に対するタンパク質リガンドは、生体内での標的 mRNA との相互作用を調節する」。The Journal of Cell Biology。151 ( 1): 1–14。doi : 10.1083 /jcb.151.1.1。PMC 2189805。PMID 11018049 。 Shikama N、Chan HM、Krstic-Demonacos M、Smith L、Lee CW、Cairns W、La Thangue NB (2000 年 12 月)。「ヌクレオソームアセンブリタンパク質と p300/CREB 結合タンパク質ファミリーコアクチベーター間の機能的相互作用」。 分子 細胞 生物 学 。20 (23): 8933–43。doi :10.1128/ MCB.20.23.8933-8943.2000。PMC 86548。PMID 11073993 。 Hartley JL、Temple GF、 Brasch MA (2000 年 11 月)。「in vitro 部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。 ゲノム 研究 。10 ( 11): 1788–95。doi :10.1101/gr.143000。PMC 310948。PMID 11076863 。 Seo SB、McNamara P、Heo S、Turner A、Lane WS、Chakravarti D (2001 年 1 月)。「ヒト細胞複合体 INHAT によるヒストンのアセチル化と転写の調節 (セットオンコプロテインを含む)」。 Cell . 104 (1): 119–30. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00196-9 . PMID 11163245. S2CID 11144887. Minakuchi M, Kakazu N, Gorrin-Rivas MJ, Abe T, Copeland TD, Ueda K, Aomori Y (2001 年 3 月). 「急性未分化白血病関連タンパク質 SET に結合する新規タンパク質 SEB の同定と特性評価」 (PDF) . European Journal of Biochemistry . 268 (5): 1340–51. doi : 10.1046/j.1432-1327.2001.02000.x . hdl :2433/150179. PMID 11231286. Beresford PJ、Zhang D、Oh DY、Fan Z、Greer EL、Russo ML、Jaju M、Lieberman J (2001 年 11 月)。「Granzyme A は小胞体関連カスパーゼ非依存性ヌクレアーゼを活性化し、一本鎖 DNA ニックを誘発する」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 46): 43285–93。doi : 10.1074/ jbc.M108137200。PMID 11555662 。 Qu D、Li Q、Lim HY、Cheung NS、Li R、Wang JH、Qi RZ (2002 年 3 月)。「タンパク質 SET はニューロン Cdk5 活性化因子 p35nck5a に結合し、Cdk5/p35nck5a の活性を調節する」。The Journal of Biological Chemistry。277 (9): 7324–32。doi: 10.1074 / jbc.M107270200。hdl : 10536 / DRO /DU:30101408。PMID 11741927 。 Fan Z、Beresford PJ、Zhang D 、 Lieberman J (2002 年 4 月)。「HMG2 はヌクレオソームアセンブリタンパク質 SET と相互作用し、細胞傷害性 T リンパ球プロテアーゼ グランザイム A の標的となる」。 分子 細胞生物学 。22 ( 8 ): 2810–20。doi :10.1128/ MCB.22.8.2810-2820.2002。PMC 133744。PMID 11909973 。 Cervoni N、Detich N、Seo SB、Chakravarti D、Szyf M (2002 年 7 月)。「ヒストンアセチルトランスフェラーゼの阻害剤である腫瘍タンパク質 Set/TAF-1beta は DNA の活性脱メチル化を阻害し、DNA メチル化と転写サイレンシングを統合する」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 28): 25026–31。doi : 10.1074/jbc.M202256200。PMID 11978794 。
