Protein-coding gene in the species Homo sapiens
SPON1 利用可能な構造 電子データ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2ZOT、2ZOU、3COO、3Q13
識別子 エイリアス SPON1 、VSGP/F-スポンジン、f-スポンジン、スポンジン 1 外部ID オミム ：604989; MGI : 2385287; ホモロジーン : 4453; ジーンカード ：SPON1; OMA :SPON1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体7（マウス） [2] バンド 7|7 F1 始める 113,365,235 bp [2] 終わり 113,642,605 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 胆嚢 S状結腸粘膜 心膜 肺の下葉 噴門 膀胱粘膜 外淡蒼球 右肺 臓側胸膜 壁側胸膜
トップの表現 水晶体上皮 虹彩 毛様体 外頸動脈 頸部 内頸動脈 網膜色素上皮 アトリウム 脱落膜 視交叉上核
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質結合 金属イオン結合 細胞外マトリックス構造成分 LBDドメイン結合 細胞成分
細胞外マトリックス 細胞外領域 小胞体腔 細胞外空間 コラーゲン含有細胞外マトリックス 生物学的プロセス
細胞接着 タンパク質O結合フコシル化 タンパク質処理の正の調節 タンパク質結合の正の調節 アミロイドβ形成の抑制 アミロイド前駆体タンパク質の分解過程の正の調節 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
スポンジン-1 （F-スポンジンとも呼ばれる）は、ヒトでは SPON1 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である。 [5]これは 底板 の細胞によって分泌され、 軸索誘導 に関与している可能性がある。 [6]このタンパク質は807個のアミノ酸を含み、構造的には6つの トロンボスポンジ ンドメイン、1つの リーリン ドメイン、および1つのスポンジンドメイン
から構成される。
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000262655 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000038156 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1999年4月). 「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XI. 試験管内で大きなタンパク質をコードする脳由来の100個の新しいcDNAクローンの完全な配列」。DNA Res . 5 (5): 277–86. doi : 10.1093/dnares/5.5.277 . PMID 9872452. ^ 「Entrez Gene: SPON1 スポンジン 1、細胞外マトリックスタンパク質」。
さらに読む
Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H (2003). 「KIAA 遺伝子の発現可能な cDNA クローンの構築: 330 個の KIAA cDNA クローンの手動キュレーション」. DNA Res . 9 (3): 99–106. doi : 10.1093/dnares/9.3.99 . PMID 12168954. Klar A、Baldassare M 、Jessell TM (1992)。「F-スポンジン：底板で高レベルで発現する遺伝子は、神経細胞の接着と神経突起の伸展を促進する分泌タンパク質をコードする」。Cell . 69 (1): 95–110. doi :10.1016/0092-8674(92)90121-R. PMID 1555244. S2CID 14880785. Bonaldo MF、Lennon G、Soares MB (1997)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする 2 つのアプローチ」。Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548。 宮本 健、森下 勇、山崎 正 (2001)。「ウシ卵胞液からの血管平滑筋細胞増殖促進因子の単離と特性評価、およびウシとヒト卵巣からのそのcDNAクローニング」。Arch . Biochem. Biophys . 390 (1): 93–100. doi :10.1006/abbi.2001.2367. PMID 11368520。 Gonzalez de Peredo A、Klein D、Macek B (2002)。「トロンボスポンジン1型リピートのC-マンノシル化とO-フコシル化」。Mol . Cell. Proteomics . 1 (1): 11–8. doi : 10.1074/mcp.M100011-MCP200 . PMID 12096136。 Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26 ): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ...9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。 Ho A, Südhof TC (2004). 「F-スポンジンのアミロイドβ前駆体タンパク質への結合：アミロイドβ前駆体タンパク質の切断を調節する候補アミロイドβ前駆体タンパク質リガンド」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (8): 2548–53. Bibcode :2004PNAS..101.2548H. doi : 10.1073/pnas.0308655100 . PMC 356987 . PMID 14983046. Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。 Pyle-Chenault RA、Stolk JA、Molesh DA (2005)。「VSGP/ F-スポンジン： 新しい 卵巣癌マーカー」。 腫瘍生物 。26 (5): 245–57。doi : 10.1159 /000087379。PMID 16103746。S2CID 13409234。 Otsuki T, Ota T, Nishikawa T (2007). 「オリゴキャップ cDNA ライブラリから分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする全長ヒト cDNA を選択するためのシリコでのシグナル配列とキーワードトラップ」 DNA Res . 12 (2): 117–26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743. 北川正史、工藤裕也、飯塚真司 (2006) 「ヒト歯根膜細胞のセメント芽細胞分化に対する F-スポンジンの効果」 (PDF) 。 生化学。生物物理学。解像度共通 。 349 (3): 1050–6。 土井 ：10.1016/j.bbrc.2006.08.142。 PMID 16965763。
外部リンク
