ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| SUMF1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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1Y1E、1Y1F、1Y1G、1Y1H、1Y1I、1Y1J、1Z70、2AFT、2AFY、2AII、2AIJ、2AIK、2HI8、2HIB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SUMF1、AAPA3037、FGE、UNQ3037、スルファターゼ修飾因子1 |
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| 外部ID | オミム:607939; MGI : 1889844;ホモロジーン: 16268;ジーンカード:SUMF1; OMA :SUMF1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体6(マウス)[2] |
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| | バンド | 6|6 E1 | 始める | 108,083,989 bp [2] |
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| 終わり | 108,162,543 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 腎髄質
- 腕の皮膚
- 滑膜
- 滑膜関節
- 脛骨
- 人間のペニス
- 太ももの皮
- 乳首
- 子宮内膜間質細胞
- 幽門
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| | トップの表現 | - 上行大動脈
- 大動脈弁
- 骨髄間質
- 水晶体上皮
- 脈絡叢上皮
- 結膜円蓋
- 虹彩
- 視索上核
- 積雲細胞
- 大動脈領域の中膜
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質ホモ二量体化活性
- 金属イオン結合
- 酸化還元酵素活性
- ホルミルグリシン生成酸化酵素活性
- 銅イオン結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 翻訳後タンパク質修飾
- スフィンゴ糖脂質代謝プロセス
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001164674 NM_001164675 NM_182760 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001158146 NP_001158147 NP_877437 |
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| 場所 (UCSC) | 3 章: 3.7 – 4.47 Mb | 6 章: 108.08 – 108.16 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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スルファターゼ修飾因子1は、ヒトではSUMF1遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6] [7]
スルファターゼは、グリコサミノグリカン、スルホリピド、ステロイド硫酸塩などの硫酸エステルの加水分解を触媒する。真核生物スルファターゼの活性部位の触媒残基であるC-α-ホルミルグリシン(FGly)は、小胞体(ER)内の好気性ホルミルグリシン生成酵素(FGE)のヒト型であるSUMF1によってシステインから翻訳後に生成される。SUMF1遺伝子の変異によって引き起こされるFGly形成の遺伝的欠陥は不活性なFGEをもたらし、続いてリソソーム蓄積障害である多発性スルファターゼ欠損症(MSD; MIM 272200)を引き起こす(Roeser et al.、2006)。[OMIM提供] [7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000144455 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000030101 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Dierks T、Schmidt B、Borissenko LV、Peng J、Preusser A、Mariappan M、von Figura K (2003 年 5 月)。「多発性スルファターゼ欠損症は、ヒト C(alpha)-ホルミルグリシン生成酵素をコードする遺伝子の変異によって引き起こされる」( PDF ) 。Cell。113 ( 4 ): 435–444。doi : 10.1016 /S0092-8674(03) 00347-7。PMID 12757705。S2CID 11571659 。
- ^ Cosma MP、Pepe S、Annunziata I、Newbold RF、Grompe M、Parenti G、Ballabio A (2003 年 5 月)。「多重スルファターゼ欠損遺伝子は、スルファターゼの活性に必須かつ制限的な因子をコード化している」。Cell . 113 ( 4): 445–456. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00348-9 . PMID 12757706. S2CID 15095377.
- ^ ab 「Entrez Gene: SUMF1 スルファターゼ修飾因子 1」。
さらに読む
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–16903。Bibcode :2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073 / pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Clark HF、Gurney AL、Abaya E、他 (2003)。「分泌タンパク質発見イニシアチブ (SPDI)、新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質を同定するための大規模な取り組み: バイオインフォマティクス評価」。Genome Res . 13 (10): 2265–2270. doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309 。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–45. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Cosma MP、Pepe S、Parenti G、et al. (2004)。「多重スルファターゼ欠損症におけるSUMF1変異の分子および機能解析」。Hum . Mutat . 23 (6): 576–581. doi :10.1002/humu.20040. PMID 15146462. S2CID 44637380.
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–2127. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Preusser-Kunze A、Mariappan M、Schmidt B、et al. (2005)。「ヒトCα-ホルミルグリシン生成酵素の分子特性」。J . Biol. Chem . 280 ( 15): 14900–14910。doi : 10.1074/ jbc.M413383200。PMID 15657036。
- Dierks T、Dickmanns A、 Preusser - Kunze A、他 (2005)。「多重スルファターゼ欠損の分子基盤とヒトホルミルグリシン生成酵素のホルミルグリシン生成のメカニズム」( PDF )。Cell 。121 (4): 541–552。doi : 10.1016 /j.cell.2005.03.001。PMID 15907468。S2CID 2956795。
- Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, et al. (2007). 「オリゴキャップ cDNA ライブラリーから分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする全長ヒト cDNA を選択するためのシリコでのシグナル配列とキーワードトラップ」。DNA Res . 12 (2): 117–126. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743。
- Roeser D, Preusser-Kunze A, Schmidt B, et al. (2006). 「ホルミルグリシン生成酵素によるすべてのヒトスルファターゼの一般的な結合メカニズム」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 103 (1): 81–86. Bibcode :2006PNAS..103...81R. doi : 10.1073/pnas.0507592102 . PMC 1324989 . PMID 16368756.
- Fraldi A、Biffi A、Lombardi A、et al. (2007)。「SUMF1 は 5 つのスルファターゼ欠損症において体内でのスルファターゼ活性を高める」。Biochem . J. 403 ( 2): 305–312. doi :10.1042/BJ20061783. PMC 1874239. PMID 17206939 。
- アヌンツィアータ I、ブーシェ V、ロンバルディ A、他。 (2007)。 「多発性スルファターゼ欠損症は、SUMF1 遺伝子の低型変異によるものです。」ハム。ムタット。28 (9): 928.土井: 10.1002/humu.9504。PMID 17657823。S2CID 8500605 。