SN5 5000

SN5 5000
利用可能な構造
電子データ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	1SYS
識別子
エイリアス	SNX5、ソーティングネキシン5
外部ID	オミム：605937; MGI : 1916428;ホモロジーン: 40944;ジーンカード：SNX5; OMA :SNX5 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体20（ヒト）
終わり	17,968,980 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体2（マウス）
終わり	144,112,826 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	甲状腺の左葉; ; 甲状腺の右葉; ; 心室帯; ; アキレス腱; ; 直腸; ; 生殖腺; ; 脾臓; ; 精巣上体; ; 二次卵母細胞; ; 左卵巣;
	トップの表現
	骨髄間質; ; 胎児の尾; ; 腹壁; ; 胚葉上層; ; 生殖腺隆起; ; 下顎突出; ; 真皮; ; 輸出管; ; 移動性腸管神経堤細胞; ; 上顎突出;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	ダイナクチン結合; タンパク質結合; ホスファチジルイノシトール結合; タンパク質ヘテロ二量体形成活性; 脂質結合; カドヘリン結合; ホスファチジルイノシトール-5-リン酸結合; D1ドーパミン受容体結合; ホスファチジルイノシトール-4-リン酸結合; ホスファチジルイノシトール-3,5-ビスリン酸結合;
細胞成分	細胞質; エンドソーム; 細胞投影; 初期エンドソーム膜; レトロマー、管状複合体; 膜; フリル; 細胞膜の細胞質側の外因性成分; 細胞膜; エンドソーム膜の外因性成分; 管状エンドソーム; レトロマー複合体; 初期エンドソーム; 貪食カップ; 細胞質小胞膜; マクロピノサイトーシスカップ; 細胞質小胞; 細胞質; ブラシの境界線; 細胞内解剖構造;
生物学的プロセス	エンドサイトーシス; 小胞組織; 逆行輸送、エンドソームからゴルジ体へ; タンパク質輸送; 飲作用; 細胞内タンパク質輸送; マクロオートファジーの調節; 表皮成長因子の分解プロセス; 腎臓のナトリウム排泄の正の調節; 血圧の負の調節;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	27131
	69178
	ENSG00000089006
	ENSMUSG00000027423
	翻訳; :
	翻訳:
	NM_152227 ; NM_001282454 ; NM_014426
	NM_001199188 ; NM_024225
	NP_001269383 ; NP_055241 ; NP_689413
	NP_001186117 ; NP_077187
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

ソーティングネキシン5は、ヒトではSNX5遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]^[7]

この遺伝子はソーティングネキシンファミリーのメンバーをコードします。このファミリーのメンバーは、ホスホイノシチド結合ドメインであるフォックス（PX）ドメインを含み、細胞内輸送に関与しています。このタンパク質は、哺乳類のレトロマー複合体の構成要素であり、^[6]エンドソームからトランスゴルジネットワークへの貨物回収を促進します。また、ファンコニ貧血相補群Aタンパク質に結合することも示されています。この遺伝子は、同じタンパク質をコードする2つの転写バリアントを生成します。^[7]

インタラクション

SNX5はFANCAと相互作用することが示されている。^[5]

参考文献

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さらに読む

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000089006 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027423 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid10600472-5] Otsuki T; Kajigaya S; Ozawa K; Liu JM (2000 年 1 月). 「ソーティングネキシンファミリーの新しいメンバーである SNX5 は、ファンコニ貧血相補群 A タンパク質に結合する」. Biochem Biophys Res Commun . 265 (3): 630–5. doi :10.1006/bbrc.1999.1731. PMID 10600472.

[pmid17148574-6] Wassmer T; Attar N; Bujny MV; Oakley J; Traer CJ; Cullen PJ (2006 年 12 月)。「機能喪失スクリーニングにより、SNX5 と SNX6 が哺乳類レトロマーの潜在的構成要素であることが判明」。J Cell Sci . 120 ( Pt 1): 45–54。doi : 10.1242/jcs.03302。PMID 17148574。

[entrez-7] "Entrez Gene: SNX5 ソーティング nexin 5".