ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
SF3A1 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1ZKH、2DT6、2DT7
識別子 エイリアス SF3A1 、PRP21、PRPF21、SAP114、SF3A120、スプライシング因子3aサブユニット1 外部ID オミム ：605595; MGI : 1914715; ホモロジーン : 4294; ジーンカード ：SF3A1; OMA :SF3A1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 11番染色体（マウス） [2] バンド 11|11 A1 始める 4,110,350 bp [2] 終わり 4,132,541 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 精子 腓骨神経 子宮内膜間質細胞 神経節隆起 心室帯 結腸上皮 骨髄細胞 左卵巣 左精巣 右精巣
トップの表現 胚葉上層 卵黄嚢 耳小胞 胎児の尾 心室帯 性器結節 球形嚢 体節 網膜の神経層 受精卵
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能 細胞成分
触媒ステップ 2 スプライソソーム スプライソソーム複合体 U2型スプライソソーム複合体 U2型プレスプライソソーム 核 核質 核の粒 U2 snRNP U2型プレ触媒スプライソソーム 生物学的プロセス
スプライソソームを介したmRNAスプライシング mRNA処理 RNA処理 mRNA 3'スプライス部位の認識 RNAスプライシング スプライソソームを介した選択的mRNAスプライシングの制御 U2型プレスプライソソームアセンブリ 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
スプライシング因子3サブユニット1は、ヒトでは SF3A1 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
この遺伝子は、スプライシング因子 3a タンパク質複合体のサブユニット 1 をコードします。スプライシング因子 3a ヘテロ三量体にはサブユニット 1、2、3 が含まれ、15S U2 snRNP をプレ mRNA スプライシングを実行する活性 17S 粒子に in vitro で変換するために必要です。サブユニット 1 は SURP タンパク質ファミリーに属し、RNA 結合を媒介すると考えられている SURP (SWAP または Suppressor-of-White-APricot とも呼ばれる) モチーフにちなんで名付けられました。サブユニット 1 はアミノ末端半分に直列に繰り返される SURP モチーフを持ち、カルボキシ末端半分にはプロリンに富む領域とユビキチン様ドメインが含まれます。短縮されたサブユニット 1 誘導体の結合研究により、2 つの SURP モチーフはサブユニット 3 への結合に必要であり、サブユニット 2 との接触は SURP モチーフのカルボキシ末端の配列を介して発生する可能性があることが実証されました。選択的スプライシングの結果、異なるアイソフォームをコードする複数の転写産物変異体が生じる。 [6]
インタラクション SF3A1はSF3A3 [7] [8] および CDC5L [9] と 相互作用する ことが示されている 。
参考文献
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さらに読む
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外部リンク
