センポ8

センポ8
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	1XT9、2BKQ、2BKR
識別子
エイリアス	SENP8、DEN1、NEDP1、PRSC2、SUMO/セントリンペプチダーゼファミリーメンバー、NEDD8特異的、SUMOペプチダーゼファミリーメンバー、NEDD8特異的
外部ID	オミム：608659; MGI : 1918849;ホモロジーン: 14084;ジーンカード：SENP8; OMA :SENP8 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	15番染色体（ヒト）
終わり	72,143,692 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	9番染色体（マウス）
終わり	59,657,993 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	精子; ; 生殖腺; ; 二次卵母細胞; ; 睾丸; ; 右精巣; ; 左精巣; ; 太ももの筋肉; ; ランゲルハンス島; ; 腓腹筋; ; 心室帯;
	トップの表現
	二次卵母細胞; ; 受精卵; ; 一次卵母細胞; ; 腰椎神経節; ; 性器結節; ; 胎児の尾; ; 手; ; 耳石器官; ; 顔面運動核; ; 卵形嚢;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	ペプチダーゼ活性; システイン型ペプチダーゼ活性; 加水分解酵素活性; NEDD8特異的プロテアーゼ活性; エンドペプチダーゼ活性;
細胞成分	細胞質; 核;
生物学的プロセス	タンパク質分解; タンパク質の脱ユビキチン化; タンパク質の脱SUMO化; 翻訳後タンパク質修飾;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	123228
	71599
	ENSG00000166192
	ENSMUSG00000051705
	Q96LD8
	Q9D2Z4
	NM_001166340 ; NM_001172109 ; NM_001172110 ; NM_001172111 ; NM_145204
	NM_001172068 ; NM_001172069 ; NM_001172070 ; NM_001172071 ; NM_027838
	NP_001159812 ; NP_001165580 ; NP_001165581 ; NP_001165582 ; NP_660205
	NP_001165539 ; NP_001165540 ; NP_001165541 ; NP_001165542 ; NP_082114
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

セントリン特異的プロテアーゼ8は、ヒトではSENP8遺伝子によってコードされる酵素である。^[5]^[6]^[7]

NEDD8 (MIM 603171) は、いくつかのユビキチンリガーゼのカルリン( CUL1、MIM 603134 を参照) サブユニットに結合するユビキチン様タンパク質です。この結合はネディレーションと呼ばれ、最適なユビキチンリガーゼ活性に必要です。NEDD8 特異的デネディラーゼ、例えば NEDP1 や DEN1 は、C 末端ジグリシンモチーフで NEDD8プロペプチドを処理し、カルリンから NEDD8 を除去するために必要です (Gan-Erdene et al., 2003)。[OMIM 提供] ^[7]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000166192 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000051705 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Mendoza HM、Shen LN、Botting C、Lewis A、Chen J、Ink B、Hay RT (2003 年 7 月)。「NEDP1 は Cullins を脱 NEDDylates する高度に保存されたシステインプロテアーゼです」。J Biol Chem . 278 (28): 25637–43. doi : 10.1074/jbc.M212948200 . PMID 12730221。
^ Gan-Erdene T、Nagamalleswari K、Yin L、Wu K、Pan ZQ、Wilkinson KD (2003 年 7 月)。「ULP ファミリーのデネジラーゼである DEN1 の同定と特性評価」。J Biol Chem . 278 (31): 28892–900. doi : 10.1074/jbc.M302890200 . PMID 12759362。
^ ab 「Entrez Gene: SENP8 SUMO/セントリン特異的ペプチダーゼファミリーメンバー8」。

さらに読む

Mikolajczyk J、Drag M、Békés M、Cao JT、Ronai Z、Salvsen GS (2007)。「小型ユビキチン関連修飾因子 (SUMO) 特異的プロテアーゼ: ヒト SENP の特異性と活性のプロファイリング」。J . Biol. Chem . 282 (36): 26217–24. doi : 10.1074/jbc.M702444200 . PMID 17591783。
Drag M、Mikolajczyk J、Krishnakumar IM、Huang Z、Salvesen GS (2008)。「合成基質を用いたヒト脱SUMO化酵素（SENP）の活性プロファイリングは、ファミリーの2つの新たに特徴付けられたメンバーの予期せぬ特異性を示唆している」。Biochem . J. 409 ( 2): 461–9. doi :10.1042/BJ20070940. PMID 17916063. S2CID 12234952。
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
Wu K、Yamoah K、Dolios G、et al. (2003)。「DEN1 は、Nedd8 の C 末端を処理し、高 neddylated CUL1 を脱結合させることができる二重機能プロテアーゼです。」J. Biol. Chem . 278 (31): 28882–91. doi : 10.1074/jbc.M302888200 . PMID 12759363。
太田孝文、鈴木勇、西川孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
Xirodimas DP、Saville MK 、 Bourdon JC、et al. (2004)。「Mdm2 を介した p53 の NEDD8 結合は転写活性を阻害する」。Cell . 118 (1): 83–97. doi : 10.1016/j.cell.2004.06.016 . PMID 15242646。
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Reverter D、Wu K、Erdene TG、他 (2005)。「Nedd8 と Ulp/Senp プロテアーゼファミリーメンバー Den1 の複合体の構造」。J . Mol. Biol . 345 (1): 141–51. doi :10.1016/j.jmb.2004.10.022. PMID 15567417。
Shen LN、Liu H、Dong C、et al. (2005)。「脱NEDD化酵素NEDP1によるNEDD8ユビキチン識別の構造的基礎」。EMBO J. 24 (7): 1341–51. doi : 10.1038/sj.emboj.7600628. PMC 1142549. PMID 15775960 。

外部リンク

PDBe-KBの UniProt : Q96LD8 (Sentrin 特異的プロテアーゼ 8)のPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000166192 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000051705 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid12730221-5] Mendoza HM、Shen LN、Botting C、Lewis A、Chen J、Ink B、Hay RT (2003 年 7 月)。「NEDP1 は Cullins を脱 NEDDylates する高度に保存されたシステインプロテアーゼです」。J Biol Chem . 278 (28): 25637–43. doi : 10.1074/jbc.M212948200 . PMID 12730221。

[pmid12759362-6] Gan-Erdene T、Nagamalleswari K、Yin L、Wu K、Pan ZQ、Wilkinson KD (2003 年 7 月)。「ULP ファミリーのデネジラーゼである DEN1 の同定と特性評価」。J Biol Chem . 278 (31): 28892–900. doi : 10.1074/jbc.M302890200 . PMID 12759362。

[entrez-7] 「Entrez Gene: SENP8 SUMO/セントリン特異的ペプチダーゼファミリーメンバー8」。