RN40

RN40
識別子
エイリアス	RNF40、BRE1B、RBP95、STARING、リングフィンガータンパク質40
外部ID	オミム：607700; MGI : 2142048;ホモロジーン: 8856;ジーンカード：RNF40; OMA :RNF40 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	16番染色体（ヒト）
終わり	30,776,307 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体7（マウス）
終わり	127,203,971 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	心室帯; ; 左精巣; ; 右精巣; ; 神経節隆起; ; 横行結腸粘膜; ; ランゲルハンス島; ; 甲状腺の右葉; ; 顆粒球; ; 腓骨神経; ; 小脳の右半球;
	トップの表現
	顆粒球; ; 精子細胞; ; 精母細胞; ; 網膜の神経層; ; 受精卵; ; 心室帯; ; リップ; ; 太ももの筋肉; ; 海馬歯状回顆粒細胞; ; 食道;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	金属イオン結合; タンパク質含有複合体結合; ユビキチン結合酵素結合; シンタキシン1結合; タンパク質ホモ二量体化活性; mRNA 3'-UTR結合; ユビキチンタンパク質リガーゼ結合; タンパク質結合; ユビキチンタンパク質転移酵素活性; トランスフェラーゼ活性;
細胞成分	軸索末端; 細胞質; 膜; HULCコンプレックス; 膜の外因性成分; ユビキチンリガーゼ複合体; 核; ニューロン投影; 核質; タンパク質含有複合体;
生物学的プロセス	mRNAポリアデニル化の負の制御; ヒストンH2Bのユビキチン化; プロテアソームタンパク質分解過程の正の調節; ペプチドホルモンに対する反応; 有糸分裂細胞周期の調節; タンパク質ポリユビキチン化の正の制御; ヒストンモノユビキチン化; ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス; ヒストンH2Bユビキチン化の正の制御; タンパク質のユビキチン化; クロマチン組織;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	9810
	233900
	ENSG00000103549
	ENSMUSG00000030816
	O75150
	Q3U319
	NM_001207033 ; NM_001207034 ; NM_001286572 ; NM_014771 ; NM_194352
	NM_172281 ; NM_001360883
	NP_001193962 ; NP_001193963 ; NP_001273501 ; NP_055586
	NP_758485 ; NP_001347812
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

E3ユビキチンタンパク質リガーゼBRE1Bは、ヒトではRNF40遺伝子によってコードされる酵素である。^[5]^[6]^[7]^[8]

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質には、タンパク質間およびタンパク質-DNA相互作用に関与することが知られているモチーフであるRINGフィンガーが含まれています。このタンパク質は、腫瘍抑制タンパク質RB1と相互作用することが報告されています。ラットの対応タンパク質の研究では、このタンパク質がE3ユビキチン-タンパク質リガーゼとして機能し、神経伝達物質放出機構の必須成分であるシンタキシン1のユビキチン化と分解を促進する可能性があることが示唆されました。^[8]

インタラクション

RNF40はSTX1Aと相互作用することが示されている。^[7]

参考文献

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^ ab 「Entrez Gene: RNF40 リングフィンガータンパク質 40」。

さらに読む

ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實＝岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセットスタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005）。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
大月哲、太田哲、西川哲、林和、鈴木裕、山本丈、若松亜、木村和、坂本和、波多野直、河合裕、石井俊、斉藤和、小島俊、杉山達、小野達也、岡野和、吉川裕、青塚 S、佐々木 N、服部 A、奥村 K、永井 K、菅野 S、磯貝 T (2005)。「オリゴキャップされたcDNAライブラリーからの分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする完全長ヒトcDNAの選択のためのシグナル配列およびキーワードトラップのインシリコ」。DNA研究所12 (2): 117-26。土井：10.1093/dnares/12.2.117。PMID 16303743。
Zhu B、Zheng Y、Pham AD、Mandal SS、Erdjument-Bromage H、Tempst P、Reinberg D (2005)。「ヒトヒストンH2Bのモノユビキチン化：関与する因子とHOX遺伝子調節におけるその役割」。Mol . Cell . 20 (4): 601–11. doi : 10.1016/j.molcel.2005.09.025 . PMID 16307923。
Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000103549 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000030816 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid9734811-5] 石川健、永瀬孝、須山正之、宮島直、田中明、小谷秀、野村直、小原修 (1998 年 12 月)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。X. 試験管内で大きなタンパク質をコードできる脳由来の 100 個の新しい cDNA クローンの完全な配列」。DNA Res . 5 (3): 169–76. doi : 10.1093/dnares/5.3.169 . PMID 9734811。

[pmid10944455-6] Wen H, Ao S (2000 年 9 月). 「RBP95、新規ロイシンジッパータンパク質は網膜芽細胞腫タンパク質に結合する」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 275 (1): 141–8. doi :10.1006/bbrc.2000.3242. PMID 10944455.

[pmid12121982-7] Chin LS、Vavalle JP、Li L (2002 年 9 月)。「Staring、シンタキシン 1 を分解の標的とする新規 E3 ユビキチン-タンパク質リガーゼ」。J . Biol. Chem . 277 ( 38): 35071–9。doi : 10.1074/ jbc.M203300200。PMID 12121982。

[entrez-8] 「Entrez Gene: RNF40 リングフィンガータンパク質 40」。