| リープ5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| エイリアス | REEP5、C5orf18、D5S346、DP1、TB2、YOP1、Yip2e、受容体アクセサリタンパク質5、POB16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム: 125265; MGI : 1270152;ホモロジーン: 68479;ジーンカード:REEP5; OMA :REEP5 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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受容体発現増強タンパク質5は、ヒトではREEP5遺伝子によってコードされるタンパク質である。 [5] [6] [7] 受容体発現増強タンパク質は、ヒトではREEP5遺伝子によってコードされるタンパク質である 。
遺伝子
REEP5は、5番染色体のマイナス鎖上の塩基対112876385から112922289の間に位置している。[8]この遺伝子には5つのエクソンが含まれている。[8]ヒトでは、REEP5の上流と下流にDCP2とSRP19遺伝子が位置している。 [9]
タンパク質
このタンパク質はREEPファミリーのメンバーであり、一般的には小胞体への改変を通じて細胞内輸送を促進し、Gタンパク質共役受容体の活性を高める能力を持っています。[10]ヒトタンパク質は189アミノ酸長で、2つの膜貫通領域と1つの命名領域TB2_DP1_HVA22を含みます。[11]改変前のタンパク質質量は21.5 kdalです。[12] SwissProtのヒトタンパク質コレクションと比較すると、REEP5はすべてのアミノ酸の通常の割合で構成されています。[12]電気的に中性なアミノ酸の長い配列を除けば、有意なパターンは見られません。[12]ヒトには2番目のアイソフォームが存在し、117番目のアミノ酸の後の変化の結果として131アミノ酸長になっています。[13] 5番目のエクソンの大部分は含まれていません。

規制
遺伝子レベル
組織発現
REEP5は多くの組織で比較的高いレベルで発現しており、副腎、脂肪、胆嚢、心臓、腎臓、前立腺、肺、膀胱の組織では、転写産物1キロベースあたり少なくとも20回の読み取り、100万回のマッピング読み取りが見られます。[14]脳と甲状腺組織では、発現がさらに高くなっています。[14]

転写因子
EGR/神経成長因子は、神経可塑性を促進するREEP5プロモーター内に結合部位を持つ転写因子であり、脳内の受容体発現増強タンパク質5のレベルの上昇を説明できる可能性がある。[15]
さらに、心臓の発達と機能に関連する2つの転写因子がプロモーター内に結合部位を持っている可能性がある。転写ボックス20(TBX20)は心臓の発達に関連しており、タンパク質欠乏は成体マウスの心臓機能低下や妊娠前の乳児の死亡に関連している。[16] MyoDは筋原性調節因子であり、一部の鳥類の胎児心臓のプルキンエ細胞で検出されており、収縮機能に関連している。
タンパク質レベル
細胞内レベルでは、REEP5は小胞体で発現している。[17]免疫化学染色では、REEP5が小胞体に局在していることが判明している。[18]
ヒトおよび近縁相同遺伝子において、多数の翻訳後修飾が計算により予測されている。2番目のアミノ酸のアセチル化が予測された。[19]ヒト、マウス、ニワトリでは、150番目のアミノ酸のリン酸化が予測されている。[20] O-GlcNAc付加も、部位128、188、189で予測されている。 [21] SUMO化部位は、アミノ酸147、175、186、187で予測されている。 [22]プロペプチド切断は、アミノ酸11で検出された。[23] 糖化は、アミノ酸16、117、164、186、187で予測されている。[24]
相同性
パラログ
REEP5にはヒトでは5つの相同遺伝子があり、REEP1、REEP2、REEP3、REEP4、REEPである[25]。
オルソログ
REEP5には、原生生物の一種であるSymbiodinium microadriacticumのように、ヒトから遠く離れた相同遺伝子が存在する。 [25]配列同一性は脊椎動物では高いが、このグループ外では大幅に低下する。DP1/TB2/HVA22領域は、2つの膜貫通領域と比較してよく保存されている。
進化速度
REEP5タンパク質の進化速度は中程度に高く、シトクロムcとフィブリノーゲンアルファの中間に位置します。中立的な突然変異は100万年に1回程度発生すると予想されます。

交流パートナー
REEP5は、酵母2ハイブリダイゼーション法で検出されたGタンパク質シグナル伝達調節因子2を含む多くのタンパク質と相互作用します。RGS2は、Gタンパク質シグナル伝達2経路と平滑筋組織の収縮に役割を果たします。Derlin 2(Derl2)は、抗タグ共免疫沈降法で検出されたようにREEP5と相互作用し、小胞体で誤って折り畳まれた糖タンパク質を分解します。[26]コリン作動性受容体ムスカリン5は、ユビキチン再構築によって相互作用物質として検出されました。[27] CHRM5はアセチルコリンに結合し、中枢神経系と末梢神経系の機能に影響を与える可能性があります。[28]
Gタンパク質シグナル伝達調節因子2も酵母2ハイブリダイゼーションで検出され、平滑筋の収縮に関与している可能性のあるGタンパク質受容体の調節因子である。[27] [29]
いくつかの論文で4つのタンパク質が実験的に検出された。[30]そのうちの3つ、アトラスチンGTPase 1、アトラスチンGTPase 2、およびジンクフィンガーFYVE型含有27は、小胞体(特に細管)の構造化、軸索の発達、またはニューロンの成長に関連している。[17] [31] 4つ目はREEP6で、受容体を細胞表面に輸送するとともに、小胞体構造を調節する役割を担っている。[32]
SARS-CoV-2
REEP5は、SARS-CoV-2と相互作用する多くのヒトタンパク質の1つです。具体的には、小胞体とゴルジ体の間の中間区画に現れるコロナウイルスタンパク質P0DTC5がREEP5と相互作用します。P0DTC5はウイルスの形態形成に重要なウイルスエンベロープタンパク質であり、REEP5が何らかの形でウイルスのパッケージングやヒト細胞からの放出に関連している可能性があります。[33]
臨床的意義
研究により、REEP5 はいくつかの病気や障害に関連していることがわかっています。
大腸がんでは、REEP5 の発現が CXCR1 の活性を高めます。CXCR1 はがん細胞の増殖と拡散に寄与するタンパク質受容体です。研究者らは、REEP5 の発現が低いと CXRC1 の効率が低下し、肺がん細胞の転移能力が低下することを発見しました。[10]これは、がん治療の潜在的なターゲットであると同時に、REEP5 が他の受容体タンパク質の活性を高めるタンパク質として機能するというさらなる証拠となります。REEP5 に関連する別の種類のがんは大腸がんで、このタンパク質は通常、HCCR1 と相互作用して中和します。HCCR1 は、そうでなければP53を妨害し、がんの進行に寄与するタンパク質です。 [34]
REEP5 は心臓疾患とも関連付けられており、その関連性に関する研究により、筋細胞の接合筋小胞体の組織化に役立つことが明らかになっています。REEP5 は接合筋小胞体を T 管に整列させ、カルシウムイオンの効果的な放出を促進します。タンパク質の機能が阻害されると、接合部がずれ、カルシウムイオンの放出が効果的でなくなります。心臓を動かす筋肉の収縮に対するカルシウムイオンの重要性を考えると、REEP5 を標的とすることは、一部の疾患の治療選択肢になる可能性があります。[35]
さらに、REEP5 mRNA内で発見された特定のSNPと大うつ病性障害との関連を示す統計的証拠もいくつかある。[36]しかし、生物学的メカニズムは確認されておらず、この研究では限られた集団のみを対象としていた。[36]
参考文献
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さらに読む
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