SARS-CoV-2の近位起源

SARS-CoV-2の近位起源は、 COVID-19パンデミックの発生直後の2020年3月17日にNature Medicine誌に掲載された科学論文のタイトルである。^{[ 1 ] [ 2 ]}この論文は、 COVID-19の起源に関する初期の調査を代表するものとして影響力があり、 Kristian G. Andersen、Andrew Rambaut、W. Ian Lipkin、Edward C. Holmes 、Robert F. Garryなどの著名なウイルス学者によって書かれた。著者らは、 SARS-CoV-2および関連コロナウイルスのゲノム、およびSARS-CoV-2スパイクタンパク質は、ウイルスが実験室からの漏洩ではなく、人獣共通感染症を介して自然にヒト集団に広がったことを示唆していると説明した。^{[ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]}

COVID-19パンデミックの初期の発生から、COVID-19の原因ウイルスであるSARS-CoV-2の実験室起源の可能性についての噂や憶測が広まった。実験室起源説のさまざまなバージョンでは、コウモリ由来のSARS-CoV-2の祖先がヒトに感染した可能性のあるさまざまなシナリオが提示されており、その中には自然または人工ウイルスの実験室での感染も含まれる。初期の噂の中には、生物兵器としてのウイルスの意図的な漏洩、または人工ウイルスの偶発的な漏洩に焦点を当てたものもあった。情報公開請求によって入手した以前の電子メールで、Proximal Originsの筆頭著者であるKristian G. Andersenは、これらの噂を払拭することに注力していると述べ、「現在出回っている主な荒唐無稽な理論は、このウイルスが何らかの意図をもって人工的に作られたというものだ」と語った。

2020年3月17日、Nature Medicine誌は「SARS-CoV-2の近位起源」と題する通信記事を掲載し、COVID-19パンデミックを引き起こしたコロナウイルスの起源を遺伝学的観点から論じた。この記事はSARS-CoV-2のゲノムと、ヒト細胞への結合を可能にする部位の分析に焦点を当てた。^{[ 3 ]}これは、クリスティアン・G・アンダーセン（スクリップス研究所、ラホヤ）、アンドリュー・ランボー（エジンバラ大学）、W・イアン・リプキン（コロンビア大学メールマン公衆衛生大学院、ニューヨーク）、エドワード・C・ホームズ（シドニー大学、オーストラリア）、ロバート・F・ギャリー（チューレーン大学、ニューオーリンズ）によって報告された。^{[ 6 ]}科学者たちは次のように述べている。「我々はSARS-CoV-2ゲノムの注目すべき特徴について見解を示し、それらがどのように発生した可能性があるかのシナリオについて議論する。我々の分析は、SARS-CoV-2が実験室で作られたものでも、意図的に操作されたウイルスでもないことを明確に示す。」^{[ 3 ]}これは、SARS-CoV-2が実験室から発生した人為的な感染症ではないことを「確固として決定」した最初の科学報告であった。^{[ 7 ]}

報告書は次のような声明で締めくくられていた。

ここで説明したゲノムの特徴は、ヒトにおけるSARS-CoV-2の感染力と伝染性を部分的に説明できる可能性がある。SARS-CoV-2が意図的に操作されたウイルスではないという証拠はあるものの、ここで説明した他の起源説を証明または反証することは現時点では不可能である。しかし、最適化されたRBDやポリ塩基性切断部位を含むSARS-CoV-2の注目すべき特徴はすべて自然界の関連コロナウイルスで観察されているため、いかなる種類の実験室ベースのシナリオも妥当ではないと考えている。^{[ 3 ]}

報告書で提唱された理論は、コロナウイルスは生物学的進化によって2つの方法のいずれかでしか発生し得ないというものだった。^{[ 8 ]}

1. ヒトへの感染（人獣共通感染症）の前に、動物宿主内で自然選択が起こったことが、ヒト細胞への感染に不可欠なSARS-CoV-2と同様のスパイクタンパク質を持つマレーセンザンコウ（Manis javanica）のコロナウイルスによって示唆されている。コウモリコロナウイルス、例えばRhinolophus affinis由来のRaTG13はSARS-CoV-2と遺伝的に関連しており（ゲノム類似度は約96%）、動物におけるゲノム混合（組換え）によってヒトに感染するウイルスが生じた可能性がある。
2. Natural selection produced the human coronavirus by mutation in humans. The spike protein of SARS-CoV-2 interacts with furin, an enzyme found in human cells. Furin-like sites are present in other viruses such as HIV and Ebola virus, but not in bat or pangolin coronaviruses, suggesting that the specific furin interaction developed only in humans.

Proponents of a laboratory leak argued that the authors concealed conflicts of interest related to their own research.^[9][10][11] In 2023, Republicans in the United States raised an allegation that the paper was a coverup to suppress the COVID-19 lab leak theory.^[12][13] Republicans alleged that a conference call between some of the letter's authors and senior scientists including Anthony Fauci, prior to the publication of the letter, was intended to cover up a laboratory leak.^{[1][14][15][16]} In 2023, House Republicans released private messages shared by the authors of the paper, expressing a range of views, including credibility for a lab leak hypothesis, not included in the final and peer-reviewed publication.^[17]