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DNAポリメラーゼIIIホロ酵素は、原核生物のDNA複製に関与する主要な酵素複合体である。これは、トーマス・コーンバーグ(アーサー・コーンバーグの息子)とマルコム・ゲフターによって1970年に発見された。この複合体は高い処理能力(結合イベントごとに加えられるヌクレオチドの数)を持ち、特に大腸菌ゲノムの複製に関しては、他の4つのDNAポリメラーゼ(Pol I、Pol II、Pol IV、およびPol V )と連携して機能する。複製活動に関与する主要なホロ酵素であるDNA Pol IIIホロ酵素は、3'→5'を読み取り、5'→3'を合成するエキソヌクレアーゼ活性によって複製ミスを修正する校正機能も持つ。DNA Pol IIIは、複製フォークに位置する レプリソームの構成要素である。
コンポーネント
レプリソームは以下から構成されます。
- 2つのDNAポリメラーゼIII酵素は、それぞれα、ε、θサブユニットから構成されています。(レプリソームにはポリメラーゼIIIの3番目のコピーがあることが証明されています。[1])
- 2 βユニット ( dnaN ) はスライディングDNA クランプとして機能し、ポリメラーゼを DNA に結合したままにします。
- 2 つのτユニット ( dnaX ) は、コア酵素 (α、ε、θ サブユニット) の 2 つを二量体化するように機能します。
- 1 つのγユニット (dnaX とも呼ばれる) は、ラギング鎖の岡崎フラグメントのクランプローダーとして機能し、2 つの β サブユニットがユニットを形成して DNA に結合するのを助けます。γ ユニットは、3 つの γ サブユニット、1 つの δ サブユニット ( holA )、および 1 つの δ' サブユニット ( holB ) を含む 5 つの γ サブユニットで構成されています。δ は、ラギング鎖のコピーに関与しています。
- Χ(holC)とΨ(holD)は1:1複合体を形成し、γまたはτに結合します。XはRNAプライマーからDNAへの切り替えを媒介することもできます。[2]
活動
DNAポリメラーゼIIIは、1秒間に約1000ヌクレオチドの速度で塩基対を合成します。[3] DNAポリメラーゼIIIの活動は、複製起点で鎖が分離した後に始まります。DNA合成はde novoで開始できないため、一本鎖DNAの一部に相補的なRNAプライマーがプライマーゼ(RNAポリメラーゼ)によって合成されます。[要出典]
( RNAの場合は「!」 、 DNAの場合は「$」 、ポリメラーゼの場合は「*」)
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_ _ _ _ | RNA | <--リボース(糖)-リン酸骨格
GUAU | Pol | <-- RNAプライマー
* * * * |_ _ _ _| <--水素結合
CATAGCATCC <--テンプレートss DNA (一本鎖DNA )
_ _ _ _ _ _ _ _ _ _ <--デオキシリボース(糖)-リン酸骨格
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3'OHへの付加
複製が進み、レプリソームが前進すると、DNAポリメラーゼIIIがRNAプライマーに到達し、プライマーの3'OHにDNAを付加して複製を開始します。[引用が必要]
* * * * !!! !!! ! ! _ _ _ _ _ _ _ _ | DNA | <--デオキシリボース(糖)-リン酸骨格 GUAU | Pol | <-- RNAプライマー * * * * |_III_ _| <--水素結合 CATAGCATCC <--テンプレートss DNA (一本鎖DNA ) _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ <--デオキシリボース(糖)-リン酸骨格 $ $ $ $ $ $ $ $ $ $
DNAの合成
DNA ポリメラーゼ III は、DNA のリーディング鎖またはラギング鎖 (岡崎フラグメント) のどちらで起こっているかに応じて、連続または不連続の DNA 鎖を合成します。DNA ポリメラーゼ III は処理能力が高いため、DNA を非常に速く合成します。この高い処理能力は、DNA 鎖を「保持」する β クランプに一部起因します。[引用が必要]
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_ _ _ _ _ _ _ _ _ _| DNA | <--デオキシリボース(糖)-リン酸骨格
GUAUCGTAGG| Pol | <-- RNAプライマー
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CATAGCATCC <--テンプレートss DNA (一本鎖DNA )
_ _ _ _ _ _ _ _ _ _ <--デオキシリボース(糖)-リン酸骨格
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プライマーの除去
目的の領域の複製後、RNA プライマーはニックトランスレーションのプロセスを経てDNA ポリメラーゼ Iによって除去されます。RNA プライマーの除去により、DNA リガーゼは新しい断片と以前の鎖の間の DNA-DNA ニックを連結することができます。DNA ポリメラーゼ I と III は、他の多くの酵素とともに、DNA 複製の高忠実度、高処理性に必要です。[要出典]
参照
参考文献
- ^ Reyes-Lamothe R、 Sherratt D、Leake M (2010)。「大腸菌における活性DNA複製機構の化学量論と構造」。サイエンス。328 ( 5977): 498–501。Bibcode : 2010Sci ...328..498R。doi : 10.1126/science.11 85757。PMC 2859602。PMID 20413500。
- ^ Olson MW、Dallmann HG、McHenry CS (1995 年 12 月)。「大腸菌 DNA ポリメラーゼ III ホロ酵素の DnaX 複合体。カイプサイ複合体は、デルタデルタ'に対するタウとガンマの親和性を生理学的に関連する範囲まで増加させることによって機能します」。J . Biol. Chem . 270 (49): 29570–7。doi : 10.1074/ jbc.270.49.29570。PMID 7494000 。
- ^ Kelman Z, O'Donnell M (1995). 「DNAポリメラーゼIIIホロ酵素:染色体複製装置の構造と機能」. Annu. Rev. Biochem . 64 : 171–200. doi :10.1146/annurev.bi.64.070195.001131. PMID 7574479.
