プム1

プム1
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	1IB2、1M8W、1M8X、1M8Y、1M8Z、2YJY、3BSB、3BSX、3Q0L、3Q0M、3Q0N、3Q0O、3Q0P
識別子
エイリアス	PUM1、HSPUM、PUMH、PUMH1、PUML1、プミリオ RNA 結合ファミリーメンバー 1、SCA47
外部ID	オミム：607204; MGI : 1931749;ホモロジーン: 22830;ジーンカード：PUM1; OMA :PUM1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体1（ヒト）
終わり	31,065,991 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	迷走神経背側運動核; ; 海馬のI領域; ; 胚上皮; ; 浅側頭動脈; ; 臓側胸膜; ; 脛骨; ; 下オリーブ核; ; 歯肉上皮; ; 毛包; ; 壁側胸膜;
	該当なし
	参照表現データの詳細
	; ; ; ;
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	mRNA 3'-UTR結合; タンパク質結合; RNA結合; miRNA結合;
細胞成分	細胞質; Pボディ; 細胞質ストレス顆粒; 核; 核質; 細胞質; 核の粒;
生物学的プロセス	miRNAによる遺伝子サイレンシングの制御; 細胞分化; mRNAの安定性の調節; 成人の運動行動; miRNAによる遺伝子サイレンシングの正の制御; 幹細胞の分化; 細胞周期の調節; 転写後遺伝子サイレンシング; 染色体分離の調節; RIG-Iシグナル伝達経路の正の調節; mRNAの不安定化; 精子形成; 翻訳の規制; 遺伝子発現の転写後制御; miRNAによる遺伝子サイレンシングに関与するmiRNAの生成;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	9698
	80912
	ENSG00000134644
	ENSMUSG00000028580
	Q14671
	Q80U78
	NM_014676 ; NM_001020658
	NM_001159603 ; NM_001159604 ; NM_001159605 ; NM_001159606 ; NM_030722
	NP_001018494 ; NP_055491
NP_001153075 ; NP_001153076 ; NP_001153077 ; NP_001153078 ; NP_109647;
	NP_001343493 ; NP_001343494 ; NP_001343495
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

Pumilioホモログ1は、ヒトではPUM1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[4]

関数

この遺伝子は、ショウジョウバエの Pumilio タンパク質やC. elegansの fem-3 mRNA 結合因子タンパク質に関連する進化的に保存されたRNA 結合タンパク質であるPUF ファミリーのメンバーをコードします。コードされたタンパク質には、8 つの繰り返しと N 末端および C 末端の隣接領域からなる配列特異的 RNA 結合ドメインが含まれており、特定の mRNA の 3' 非翻訳領域に結合することで、それらの翻訳調節因子として機能します。コードされたタンパク質の無脊椎動物および下等脊椎動物における進化的に保存された機能は、ヒトのタンパク質が胚発生、および細胞の発生と分化の翻訳調節に関与している可能性があることを示唆しています。異なるアイソフォームをコードする選択的スプライシング転写バリアントが報告されています。^[4]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000134644 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ ab "Entrez 遺伝子: PUM1 pumilio ホモログ 1 (ショウジョウバエ)".

さらに読む

Spassov DS、Jurecic R (2004)。「RNA結合タンパク質のPUFファミリー：進化的に保存された構造は保存された機能に等しいか？」IUBMB Life。55（7）：359–66。doi ：10.1080 /15216540310001603093。PMID 14584586。
Nagase T, Miyajima N, Tanaka A, et al. (1995). 「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。III. ヒト細胞株 KG-1 からの cDNA クローンの解析により推定された 40 個の新しい遺伝子 (KIAA0081-KIAA0120) のコード配列」。DNA Res . 2 (1): 37–43. doi : 10.1093/dnares/2.1.37 . PMID 7788527。
Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). 「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Wang X、Zamore PD、Hall TM (2001)。「Pumilioホモロジードメインの結晶構造」。Mol . Cell . 7 (4): 855–65. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00229-5 . PMID 11336708。
Wang X、McLachlan J、Zamore PD、Hall TM (2002)。「ヒトプミリオ相同ドメインによるRNAのモジュール認識」。Cell . 110 (4): 501–12. doi : 10.1016/S0092-8674(02)00873-5 . PMID 12202039. S2CID 13644449.
Spassov DS 、 Jurecic R (2003)。「RNA結合タンパク質のPumilioファミリーのヒトメンバーであるPUM1およびPUM2遺伝子のクローニングと比較配列分析」。Gene . 299 (1–2): 195–204。doi :10.1016/S0378-1119(02)01060-0。PMID 12459267 。
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
Dazard JE、Gal H、Amariglio N、他 (2003)。「UVB照射に対するヒトケラチノサイトおよび扁平上皮癌の反応のゲノム全体にわたる比較：皮膚癌および上皮癌への影響」。Oncogene . 22 (19): 2993–3006. doi : 10.1038/sj.onc.1206537 . PMID 12771951。
太田孝文、鈴木勇、西川孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
Brandenberger R、Wei H、Zhang S、他 (2005)。「トランスクリプトーム特性評価により、ヒト ES 細胞の成長と分化を制御するシグナル伝達ネットワークが解明」Nat. Biotechnol . 22 (6): 707–16. doi :10.1038/nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, et al. (2004). 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」Genome Res . 14 (7): 1324–32. doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748 .
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
Jordanova A、Irobi J、Thomas FP、他 (2006)。「優性中間型シャルコー・マリー・トゥース神経障害における変異チロシルtRNA合成酵素の機能障害と軸索分布」Nat. Genet . 38 (2): 197–202. doi :10.1038/ng1727. PMID 16429158. S2CID 16668375.
Gregory SG、 Barlow KF、 McLay KE、他 (2006)。「ヒト染色体 1 の DNA 配列と生物学的注釈」。Nature . 441 ( 7091 ): 315–21。Bibcode :2006Natur.441..315G。doi : 10.1038/nature04727。PMID 16710414。
Lim J、Hao T、Shaw C、他 (2006)。「ヒト遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性症のタンパク質間相互作用ネットワーク」。Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569. S2CID 13709685。
Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、et al. (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000134644 – Ensembl、2017 年 5 月

[2] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[3] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[entrez-4] "Entrez 遺伝子: PUM1 pumilio ホモログ 1 (ショウジョウバエ)".