PSIP1

PSIP1
利用可能な構造物
PDB	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコード一覧
	1Z9E、2B4J、2M16、2MSR、2MTN、2N3A、3F9K、3HPG、3HPH、3U88、3ZEH、4FU6
識別子
別名	PSIP1、DFS70、LEDGF、PAIP、PSIP2、p52、p75、PC4、SFRS1相互作用タンパク質1
外部ID	オミム: 603620 ; MGI : 2142116 ;ホモロジーン: 13242 ;ジーンカード: PSIP1 ; OMA : PSIP1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クリスチャン	染色体9（ヒト）
終わり	15,510,995 bp
遺伝子の位置（マウス）
クリスチャン	染色体4（マウス）
終わり	83,404,696 bp
RNA発現パターン
	トップは
	二次卵母細胞; 心室帯; 神経節隆起; 小脳半球; 小脳の右半球; ブロードマンエリア9; アキレス腱; 視神経; C1セグメント; 側坐核;
	トップは
	胚の尾; 心室帯; 生殖器結節; 精母細胞; 接合子; 神経節隆起; 二次卵母細胞; 外側中隔核; 腹壁; 上胚葉;
	より多くの参照発現データ
	より多くの参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	DNA結合; 転写共活性化因子活性; クロマチン結合; タンパク質結合; 超らせん状DNA結合; RNA結合;
細胞成分	細胞質; 核周辺部; 核質; 核小体; 核;
生物学的プロセス	転写の調節、DNAテンプレート; 熱に対する反応; 酸化ストレスへの反応; 転写、DNA鋳型; 統合型プロウイルス潜伏の確立; mRNA 5'スプライス部位の認識; RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御; ウイルスプロセス; 核輸送;
	出典：Amigo / QuickGO
オルソログ
	11168
	101739
	ENSG00000164985
	ENSMUSG00000028484
	O75475
	Q99JF8
	NM_001128217 NM_021144 NM_033222 NM_001317898 NM_001317900
	NM_001290527 NM_133948 NM_001347143 NM_001355203
	NP_001121689 NP_001304827 NP_001304829 NP_066967 NP_150091
	NP_001277456 NP_001334072 NP_598709 NP_001342132
	ウィキデータ
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PC4およびSFRS1相互作用タンパク質1は、レンズ上皮由来成長因子（LEDGF/p75）、高密度微細斑点70kDタンパク質（DFS 70）、または転写共活性化因子p75/p52としても知られており、ヒトではPSIP1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[⁵^]^[⁶^]

関数

PSIP1 は特定の細胞メカニズムと明確に結び付けられていません。LEDGF/p75 (レンズ上皮由来増殖因子) という用語は、PSIP1 の初期の特性に基づいて一般的に使用されるようになりましたが、このタンパク質はほとんどの組織に存在し、レンズ上皮の発達に直接的な役割がないため、これは誤称です。転写共活性化因子である LEDGF/p75 は、 HIV 統合を助ける宿主因子として注目を集めており^{[ 7 ]}、ノックダウンすると HIV 統合レベルに深刻な影響を与える唯一のインテグラーゼ相互作用因子であると考えられます。^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} HIVインテグラーゼとヒト LEDGF/p75の相互作用は、抗 HIV 薬開発の有望な標的です。^{[ 11 ]} LEDGF/p75 は、MLL 複合体を HOX 遺伝子にリクルートして、その発現を制御します。^{[ 12 ]} LEDGF/p52は、H3K36トリメチル化クロマチンにスプライシング因子をリクルートして代替スプライシングを調節することが示されており、^{[ 13 ]}また、HOTTIP lncRNAも調節し、HOX遺伝子をシスで調節することが示されている。^{[ 14 ]}

構造

LEDGF/p75は、60kDa、530アミノ酸長のタンパク質です。^{[ 15 ]} このタンパク質のN末端部分は、PWWPドメイン、核局在化配列、および2つのATフックDNA結合モチーフから構成されています。LEDGF/p75のC末端部分には、インテグラーゼ結合ドメインと呼ばれる構造が含まれており、^{[ 16 ]}レンチウイルスインテグラーゼタンパク質や多数の細胞タンパク質と相互作用します。N末端部分はクロマチンと強く相互作用するため、LEDGF/p75は恒常的に核に存在するタンパク質です。このタンパク質のアイソフォームであるLEDGF/p52は、選択的スプライシングによって生成されます。LEDGF/p52は、LEDGF/p75のN末端325アミノ酸を共有していますが、インテグラーゼ結合ドメインを欠いています。

相互作用

PSIP1 has been shown to interact with the proteins ASF/SF2, JPO2, Cdc7-Dbf4, and POGZ as well as the menin/MLL protein complex.^[17]^[18]

References

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関数

構造

相互作用

References

Further reading