ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ペックス3 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | PEX3、PBD10A、TRG18、ペルオキシソーム生合成因子3、PBD10B |
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| 外部ID | オミム:603164; MGI : 1929646;ホモロジーン: 2691;ジーンカード:PEX3; OMA :PEX3 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体10(マウス)[2] |
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| | バンド | 10|10 A2 | 始める | 13,399,586 bp [2] |
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| 終わり | 13,428,886 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 内皮細胞
- 右副腎皮質
- 左副腎
- 左副腎皮質
- 卵母細胞
- 太ももの皮
- 人間のペニス
- 腎髄質
- 睾丸
- 外陰部
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| | トップの表現 | - 精子細胞
- 精細管
- 外耳の皮膚
- 褐色脂肪組織
- 精嚢
- 精母細胞
- 大動脈外膜
- 白色脂肪組織
- 脈絡叢上皮
- 肝臓の左葉
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質二量体化活性
- タンパク質結合
- 脂質結合
- タンパク質高分子アダプター活性
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- 細胞質
- 膜
- ペルオキシソーム膜
- ペルオキシソーム
- 核質
- タンパク質脂質複合体
- 小胞体
- ペルオキシソーム膜の不可欠な構成要素
- タンパク質含有複合体
| | 生物学的プロセス |
- ペルオキシソーム組織
- ペルオキシソーム膜の生合成
- ペルオキシソーム膜へのタンパク質の輸入
- 膜輸送
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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NM_001164195 NM_019961 NM_001347361 |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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NP_001157667 NP_001334290 NP_064345 |
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| 場所 (UCSC) | 6 章: 143.45 – 143.49 Mb | 10 章: 13.4 – 13.43 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ペルオキシソーム生合成因子3は、ヒトではPEX3遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
インタラクション
PEX3はPEX19と相互作用することが示されている。[7] [8] [9] [10]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000034693 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000019809 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Kammerer S、 Holzinger A、Welsch U、Roscher AA (1998 年 6 月)。「ヒトペルオキシソームアセンブリタンパク質 Pex3p をコードする遺伝子のクローニングと特性評価」。FEBS Letters。429 ( 1 ): 53– 60。doi :10.1016/S0014-5793(98)00557-2。PMID 9657383。S2CID 33291739 。
- ^ 「Entrez Gene: PEX3 ペルオキシソーム生合成因子 3」。
- ^ ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ・グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルシュタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサク S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- ^ Mayerhofer PU、Kattenfeld T、 Roscher AA、Muntau AC (2002 年 3 月)。「ヒト PEX19 の 2 つのスプライスバリアントはペルオキシソームの組み立てにおいて異なる機能を発揮する」。生化学および生物物理学的研究通信。291 (5): 1180– 6。doi :10.1006/bbrc.2002.6568。PMID 11883941 。
- ^ Sacksteder KA、Jones JM、South ST、Li X、Liu Y、Gould SJ (2000 年 3 月)。「PEX19 は複数のペルオキシソーム膜タンパク質に結合し、主に細胞質に存在し、ペルオキシソーム膜合成に必要である」。The Journal of Cell Biology。148 ( 5): 931– 44。doi :10.1083 / jcb.148.5.931。PMC 2174547。PMID 10704444。
- ^ Fransen M, Wylin T, Brees C, Mannaerts GP, Van Veldhoven PP (2001 年 7 月). 「ヒト pex19p は、選別配列とは異なる領域でペルオキシソームの膜貫通タンパク質に結合する」.分子細胞生物学. 21 (13): 4413– 24. doi :10.1128/MCB.21.13.4413-4424.2001. PMC 87101. PMID 11390669 .
さらに読む
- South ST、 Gould SJ (1999 年 1 月)。「既存のペルオキシソームがない場合のペルオキシソーム合成」。The Journal of Cell Biology。144 ( 2): 255– 66。doi :10.1083/ jcb.144.2.255。PMC 2132891。PMID 9922452。
- Soukupova M、Sprenger C、Gorgas K、Kunau WH 、 Dodt G (1999 年 6 月)。「ヒトペルオキシン PEX3 の同定と特性」。European Journal of Cell Biology。78 ( 6): 357– 74。doi : 10.1016 /S0171-9335(99)80078-8。PMID 10430017 。
- Muntau AC、Holzinger A、Mayerhofer PU、Gärtner J、Roscher AA、Kammerer S (2000 年 2 月)。「ペルオキシソームアセンブリタンパク質をコードするヒト PEX3 遺伝子: ゲノム構成、位置マッピング、候補表現型における変異分析」。生化学および生物物理学的研究通信。268 (3): 704– 10。doi :10.1006/bbrc.2000.2193。PMID 10679269 。
- Sacksteder KA、Jones JM、South ST、Li X、Liu Y、Gould SJ (2000 年 3 月)。「PEX19 は複数のペルオキシソーム膜タンパク質に結合し、主に細胞質に存在し、ペルオキシソーム膜合成に必要である」。The Journal of Cell Biology。148 ( 5): 931– 44。doi :10.1083 / jcb.148.5.931。PMC 2174547。PMID 10704444 。
- Ghaedi K, Tamura S, Okumoto K, Matsuzono Y, Fujiki Y (2000 年 6 月). 「ペルオキシン pex3p はペルオキシソーム生合成における膜構築を開始する」.細胞の分子生物学. 11 (6): 2085– 102. doi : 10.1091 /mbc.11.6.2085. PMC 14905. PMID 10848631.
- Muntau AC、Mayerhofer PU、Paton BC、Kammerer S、Roscher AA (2000 年 10 月)。「ヒト PEX3 の変異によるペルオキシソーム膜合成の欠陥が Zellweger 症候群、相補群 G を引き起こす」。American Journal of Human Genetics。67 ( 4 ): 967– 75。doi :10.1086/303071。PMC 1287898。PMID 10958759。
- Ghaedi K、Honsho M、Shimozawa N、Suzuki Y、Kondo N、Fujiki Y (2000 年 10 月)。「PEX3 は相補性グループ G のペルオキシソーム膜アセンブリ欠陥型 Zellweger 症候群の原因遺伝子である」。American Journal of Human Genetics。67 ( 4 ): 976– 81。doi :10.1086/303086。PMC 1287899。PMID 10968777。
- Fransen M、Wylin T、Brees C、Mannaerts GP、Van Veldhoven PP (2001 年 7 月)。「ヒト pex19p は、その選別配列とは異なる領域でペルオキシソームの膜貫通タンパク質に結合する」。分子細胞生物学。21 (13): 4413– 24。doi : 10.1128 / MCB.21.13.4413-4424.2001。PMC 87101。PMID 11390669。
- Mayerhofer PU、Kattenfeld T、 Roscher AA、Muntau AC (2002 年 3 月)。「ヒト PEX19 の 2 つのスプライスバリアントはペルオキシソームの組み立てにおいて異なる機能を発揮する」。生化学および生物物理学的研究通信。291 (5): 1180– 6。doi :10.1006/bbrc.2002.6568。PMID 11883941 。
- Fransen M, Brees C, Ghys K, Amery L, Mannaerts GP, Ladant D, Van Veldhoven PP (2002 年 3 月)。「非転写ベースの細菌ツーハイブリッドアッセイを使用した哺乳類ペルオキシン相互作用の分析」。 分子および細胞プロテオミクス。1 ( 3): 243– 52。doi : 10.1074/mcp.M100025-MCP200。PMID 12096124。
- Muntau AC、Roscher AA、Kunau WH、Dodt G (2003年7 月)。「蛍光共鳴エネルギー移動 (FRET) 分析によるヒト PEX3 と PEX19 の相互作用の特徴」。European Journal of Cell Biology。82 ( 7): 333– 42。doi :10.1078/0171-9335-00325。PMID 12924628 。
- Muntau AC、Roscher AA、Kunau WH、Dodt G (2003)。「蛍光共鳴エネルギー移動 (FRET) によって可視化された PEX3 と PEX19 の相互作用」。ペルオキシソーム障害と遺伝子の調節。実験医学と生物学の進歩。第 544 巻。pp. 221– 4。doi : 10.1007/978-1-4419-9072-3_27。ISBN 978-1-4613-4782-8. PMID 14713233。
- Fang Y、Morrell JC、Jones JM、 Gould SJ (2004 年 3 月)。「PEX3 はクラス I ペルオキシソーム膜タンパク質の輸入における PEX19 ドッキング因子として機能する」。The Journal of Cell Biology。164 ( 6): 863– 75。doi :10.1083/jcb.200311131。PMC 2172291。PMID 15007061。
- ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實=岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ=グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Matsuzono Y, Matsuzaki T, Fujiki Y (2006 年 9 月). 「ペルオキシン Pex19p の機能ドメイン マッピング: Pex3p との相互作用は機能と転座に必須」. Journal of Cell Science . 119 (Pt 17): 3539–50 . doi : 10.1242/jcs.03100 . PMID 16895967.
外部リンク
- ペルオキシソーム生合成障害、ゼルウィガー症候群スペクトラムに関する GeneReviews/NCBI/NIH/UW のエントリ
- ペルオキシソーム生合成障害、ゼルウィガー症候群スペクトラムに関する OMIM エントリ