ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ペックス10 |
|---|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | PEX10、NALD、PBD6A、PBD6B、RNF69、ペルオキシソーム生合成因子10 |
|---|
| 外部ID | オミム:602859; MGI : 2684988;ホモロジーン: 5671;ジーンカード:PEX10; OMA :PEX10 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | クロ。 | 染色体4(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 4|4 E2 | 始める | 155,151,473 bp [2] |
|---|
| 終わり | 155,156,890 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| トップの表現 | - 耳下腺
- 上腕二頭筋の腱
- C1セグメント
- 右副腎皮質
- 左副腎
- 左副腎皮質
- 扁桃体
- 内淡蒼球
- 左精巣
- 右精巣
|
| | トップの表現 | - 卵黄嚢
- 手
- 大動脈弁
- 耳石器官
- 卵形嚢
- 網膜の神経層
- 太ももの筋肉
- 右腎臓
- 上行大動脈
- ヒラメ筋
|
| | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- 亜鉛イオン結合
- タンパク質C末端結合
- タンパク質結合
- 金属イオン結合
| | 細胞成分 |
- ペルオキシソーム
- 膜
- ペルオキシソーム膜の不可欠な構成要素
- 細胞内解剖構造
- ペルオキシソーム膜
| | 生物学的プロセス |
- ペルオキシソーム組織
- ペルオキシソームマトリックスへのタンパク質の輸入
- タンパク質のユビキチン化
- ペルオキシソームへのタンパク質標的化
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オルソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | | |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | |
|---|
NM_002617 NM_153818 NM_001374425 NM_001374426 NM_001374427 |
| |
|---|
| RefSeq (タンパク質) | |
|---|
NP_002608 NP_722540 NP_001361354 NP_001361355 NP_001361356 |
| |
|---|
| 場所 (UCSC) | 1 章: 2.4 – 2.41 Mb | 4 章: 155.15 – 155.16 Mb |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
ペルオキシソーム生合成因子10は、ヒトではPEX10遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]選択的スプライシングの結果、異なるアイソフォームをコードする2つの転写変異体が生じる。
関数
ペルオキシソーム生合成因子10はペルオキシソームマトリックスタンパク質の輸入に関与している。このタンパク質はペルオキシソーム膜に局在する。[6]
臨床的意義
この遺伝子の変異は、新生児副腎白質ジストロフィーからゼルウィガー症候群に至るまで、ペルオキシソーム生合成障害のゼルウィガースペクトル内の表現型を引き起こします。[6]
インタラクション
PEX10はPEX12 [7] [8]およびPEX19 [9] [10]と相互作用することが示されている。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000157911 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000029047 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Warren DS、Morrell JC、Moser HW、Valle D、Gould SJ (1998 年 12 月)。「ペルオキシソーム生合成障害の相補群 7 に欠陥のある遺伝子 PEX10 の同定」。Am J Hum Genet。63 ( 2): 347– 59。doi : 10.1086 /301963。PMC 1377304。PMID 9683594。
- ^ abc 「Entrez Gene:PEX10ペルオキシソーム生合成因子10」。
- ^ Chang CC、Warren DS、Sacksteder KA、Gould SJ (1999 年 11 月)。「PEX12 は PEX5 および PEX10 と相互作用し、ペルオキシソームマトリックスタンパク質の輸入における受容体ドッキングの下流で作用する」。J . Cell Biol . 147 (4): 761– 74. doi :10.1083/jcb.147.4.761. PMC 2156163. PMID 10562279 。
- ^ Okumoto K, Abe I, Fujiki Y (2000 年 8 月). 「ペルオキシン Pex12p の分子解剖: リングフィンガードメインは Pex12p の機能に必須であり、ペルオキシソーム標的シグナルタイプ 1 受容体 Pex5p およびリングペルオキシン Pex10p と相互作用する」. J. Biol. Chem . 275 (33): 25700–10 . doi : 10.1074/jbc.M003303200 . PMID 10837480.
- ^ Sacksteder KA、Jones JM、South ST、Li X、Liu Y、Gould SJ (2000 年 3 月)。「PEX19 は複数のペルオキシソーム膜タンパク質に結合し、主に細胞質に存在し、ペルオキシソーム膜合成に必要である」。J . Cell Biol . 148 (5): 931– 44. doi :10.1083/jcb.148.5.931. PMC 2174547. PMID 10704444 。
- ^ Fransen M、Wylin T、Brees C、Mannaerts GP、Van Veldhoven PP (2001 年 7 月)。「ヒト pex19p は、選別配列とは異なる領域でペルオキシソーム膜貫通タンパク質に結合する」。Mol . Cell. Biol . 21 (13): 4413– 24. doi :10.1128 / MCB.21.13.4413-4424.2001. PMC 87101. PMID 11390669。
さらに読む
- Okumoto K, Itoh R, Shimozawa N, et al. (1998). 「PEX10 の変異は相補性グループ B の Zellweger ペルオキシソーム欠損症候群の原因である。」Hum. Mol. Genet . 7 (9): 1399– 405. doi : 10.1093/hmg/7.9.1399 . PMID 9700193.
- South ST, Gould SJ (1999). 「既存のペルオキシソームがない場合のペルオキシソーム合成」J. Cell Biol . 144 (2): 255– 66. doi : 10.1083/jcb.144.2.255. PMC 2132891. PMID 9922452.
- Chang CC、Warren DS、Sacksteder KA、Gould SJ (1999)。「PEX12 は PEX5 および PEX10 と相互作用し、ペルオキシソームマトリックスタンパク質の輸入における受容体ドッキングの下流で作用する」。J . Cell Biol . 147 (4): 761– 74. doi :10.1083/jcb.147.4.761. PMC 2156163. PMID 10562279 。
- Sacksteder KA、Jones JM、South ST、et al. (2000)。「PEX19 は複数のペルオキシソーム膜タンパク質に結合し、主に細胞質に存在し、ペルオキシソーム膜合成に必要である」。J . Cell Biol . 148 (5): 931– 44. doi :10.1083/jcb.148.5.931. PMC 2174547. PMID 10704444 。
- 奥本 健、阿部 郁、藤木 勇 (2000)。「ペルオキシン Pex12p の分子解剖:リングフィンガードメインは Pex12p の機能に必須であり、ペルオキシソーム標的シグナルタイプ 1 受容体 Pex5p およびリングペルオキシン Pex10p と相互作用する」。J. Biol. Chem . 275 (33): 25700– 10. doi : 10.1074/jbc.M003303200 . PMID 10837480。
- Warren DS、Wolfe BD、Gould SJ (2000)。「PEX10欠損ペルオキシソーム生合成障害患者における表現型と遺伝子型の関係」。Hum . Mutat . 15 (6): 509– 21. doi :10.1002/1098-1004(200006)15:6<509::AID-HUMU3>3.0.CO;2-#. PMID 10862081. S2CID 196604223.
- Fransen M、Wylin T、Brees C、et al. (2001)。「ヒト pex19p は、その選別配列とは異なる領域でペルオキシソーム膜タンパク質に結合する」。Mol . Cell. Biol . 21 (13): 4413– 24. doi : 10.1128 /MCB.21.13.4413-4424.2001. PMC 87101. PMID 11390669。
- Fransen M, Brees C, Ghys K, et al. (2002). 「非転写ベースの細菌ツーハイブリッドアッセイを用いた哺乳類ペルオキシン相互作用の分析」Mol. Cell. Proteomics . 1 (3): 243– 52. doi : 10.1074/mcp.M100025-MCP200 . PMID 12096124.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- 下沢 暢、長瀬 剛、竹本 勇、他 (2003)。「ペルオキシソーム生合成障害を持つ日本人患者の遺伝的異質性と、PEX10 遺伝子の最も一般的な変異の創始者ハプロタイプの証拠」ペルオキシソーム障害と遺伝子の調節。実験医学と生物学の進歩。第 544 巻。p. 71。doi : 10.1007/ 978-1-4419-9072-3_10。ISBN 978-1-4613-4782-8. PMID 14713216。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature 437 ( 7062 ) : 1173– 8。Bibcode : 2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 / nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
- Gregory SG、 Barlow KF、 McLay KE、他 (2006)。「ヒト染色体 1 の DNA 配列と生物学的注釈」。Nature . 441 ( 7091 ): 315– 21。Bibcode :2006Natur.441..315G。doi : 10.1038/nature04727。PMID 16710414。
外部リンク
- ペルオキシソーム生合成障害、ゼルウィガー症候群スペクトラムに関する GeneReviews/NCBI/NIH/UW のエントリ
- ペルオキシソーム生合成障害、ゼルウィガー症候群スペクトラムに関する OMIM エントリ