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| エイリアス | PCBP2、HNRNPE2、HNRPE2、hnRNP-E2、ポリ(rC)結合タンパク質2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：601210; MGI : 108202;ホモロジーン: 74536;ジーンカード：PCBP2; OMA :PCBP2 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ポリ(rC)結合タンパク質2は、ヒトではPCBP2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は多機能であると思われます。PCBP-1 および hnRNPK とともに、主要な細胞ポリ (rC) 結合タンパク質に相当します。RNA 結合に関与している可能性のある 3 つのK 相同 (KH) ドメインが含まれています。このコードされたタンパク質は PCBP-1 とともに、IRES のステムループ IV との配列特異的相互作用を介してポリオウイルス RNA の翻訳コアクチベーターとしても機能し、5' 末端のクローバーリーフ構造に結合することでポリオウイルス RNA の複製を促進します。
また、15-リポキシゲナーゼ mRNA、ヒトパピローマウイルス 16 型 L2 mRNA、および A 型肝炎ウイルス RNA の翻訳制御にも関与していることが示唆されています。コード化されたタンパク質は、α-グロビン mRNA の安定性に関連する配列特異的なα-グロビン mRNP 複合体の形成にも関与していると示唆されています。
このマルチエクソン構造mRNAはレトロトランスポジションされて、同様の機能を持つPCBP-1イントロンレス遺伝子を生成すると考えられています。この遺伝子とPCBP-1には、遺伝子全体の重複イベントの結果として生じたと考えられるパラログPCBP3とPCBP4があります。また、処理された2つの疑似遺伝子PCBP2P1とPCBP2P2もあります。現在、この遺伝子には2つの選択的スプライシング転写バリアントが記載されています。[6]
ヒトでは、PCBP2遺伝子は、肝細胞癌に関与する転写された超保存要素であるTUC338と重複している。[7]
インタラクション
PCBP2はHNRPK、[8] PTBP1、HNRNPLと相互作用することが示されている。[8]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000197111 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000056851 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Tommerup N、Leffers H (1997 年 5 月)。「in situ ハイブリダイゼーションによるヒト KH ボックス含有遺伝子の割り当て: HNRNPK は 9q21.32-q21.33、PCBP1 は 2p12-p13、PCBP2 は 12q13.12-q13.13 にマップされ、FRA12A より遠位」。Genomics。32 ( 2 ) : 297–8。doi : 10.1006 /geno.1996.0121。PMID 8833161 。
- ^ 「Entrez Gene: PCBP2 ポリ(rC) 結合タンパク質 2」。2024年4月30日時点のオリジナルよりアーカイブ。2017年9月7日閲覧。
- ^ Braconi C, Valeri N, Kogure T, Gasparini P, Huang N, Nuovo GJ, Terracciano L, Croce CM, Patel T (2011-01-11). 「肝細胞癌における超保存要素を持つ転写非コードRNAの発現と機能的役割」。米国科学アカデミー 紀要。108 ( 2 ): 786–91。Bibcode :2011PNAS..108..786B。doi : 10.1073/ pnas.1011098108。PMC 3021052。PMID 21187392。
- ^ ab Kim JH、Hahm B、Kim YK、Choi M、Jang SK (2000 年 5 月)。「核と細胞質の間を移動する hnRNP 間のタンパク質間相互作用」。J . Mol. Biol . 298 (3): 395–405. doi :10.1006/jmbi.2000.3687. PMID 10772858。
さらに読む
- Kiledjian M、Wang X、Liebhaber SA (1995)。「α-グロビンmRNP安定性複合体における2つのKHドメインタンパク質の同定」。EMBO J. 14 ( 17): 4357–64. doi :10.1002/j.1460-2075.1995.tb00110.x. PMC 394520. PMID 7556077 。
- Leffers H、Dejgaard K、Celis JE (1995)。「それぞれ3つのK相同(KH)ドメインを含む2つの主要な細胞ポリ(rC)結合ヒトタンパク質の特性」。Eur . J. Biochem . 230 (2): 447–53. doi :10.1111/j.1432-1033.1995.tb20581.x. PMID 7607214。
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Blyn LB、Swiderek KM、Richards O、Stahl DC、Semler BL、Ehrenfeld E (1996)。「ポリ(rC)結合タンパク質2はポリオウイルスRNA 5'非コード領域のステムループIVに結合する：自動液体クロマトグラフィー-タンデム質量分析による同定」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 93 ( 20): 11115–20。Bibcode : 1996PNAS ...9311115B。doi : 10.1073 / pnas.93.20.11115。PMC 38293。PMID 8855318。
- Funke B、Zuleger B、Benavente R、Schuster T、Goller M、Stévenin J、Horak I (1996)。「マウスポリ(C)結合タンパク質は複数のアイソフォームで存在し、いくつかのRNA結合タンパク質と相互作用する」。Nucleic Acids Res . 24 (19): 3821–8. doi :10.1093/nar/24.19.3821. PMC 146158 . PMID 8871564。
- Blyn LB、Towner JS、Semler BL、Ehrenfeld E (1997)。「ポリオウイルスRNAの翻訳にはポリ(rC)結合タンパク質2が必要である」。J . Virol . 71 (8): 6243–6. doi :10.1128/JVI.71.8.6243-6246.1997. PMC 191892. PMID 9223526 。
- Kiledjian M、DeMaria CT、Brewer G、Novick K (1997)。「アルファグロビンmRNA安定性複合体の成分としてのAUF1（異種核リボ核タンパク質D）の同定」。Mol . Cell. Biol . 17 (8): 4870–6. doi :10.1128/MCB.17.8.4870. PMC 232339. PMID 9234743 。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Czyzyk -Krzeska MF、Bendixen AC (1999)。「エリスロポエチンメッセンジャーRNAの3'非翻訳領域に関連する複合体中のポリ(C)結合タンパク質の同定」。Blood。93 ( 6 ):2111–20。doi :10.1182/ blood.V93.6.2111.406k24_2111_2120。PMID 10068686 。
- Wang Z、Day N、Trifillis P、Kiledjian M (1999)。「mRNA安定性複合体はポリ(A)結合タンパク質と連携してmRNAをin vitroで安定化させる」。Mol . Cell. Biol . 19 (7): 4552–60. doi :10.1128/MCB.19.7.4552. PMC 84253. PMID 10373504 。
- Makeyev AV、Chkheidze AN、Liebhaber SA (1999)。「mRNA の安定化に関与する高度に保存された RNA 結合タンパク質のセット、alphaCP-1 および alphaCP-2 は、イントロンのない遺伝子とそのイントロンを含むパラログから共発現される」。J . Biol. Chem . 274 (35): 24849–57. doi : 10.1074/jbc.274.35.24849 . PMID 10455157。
- Kim JH、Hahm B、Kim YK、Choi M、Jang SK (2000)。「核と細胞質の間を往復するhnRNP間のタンパク質間相互作用」。J. Mol. Biol . 298 (3): 395–405. doi :10.1006/jmbi.2000.3687. PMID 10772858。
- Makeyev AV、Liebhaber SA (2000)。「2つの新しい哺乳類遺伝子の同定により、KHドメインRNA結合タンパク質のサブファミリーが確立されました」。Genomics . 67 ( 3): 301–16. doi :10.1006/geno.2000.6244. PMID 10936052。
- Chang CJ、Luh HW、Wang SH、Lin HJ 、 Lee SC、Hu ST (2002)。「異種核リボ核タンパク質K（hnRNP K）はデングウイルスコアタンパク質と相互作用する」。DNA Cell Biol。20（9）：569–77。doi ： 10.1089 /104454901317094981。PMID 11747608。2023-09-28 にオリジナルからアーカイブ。2022-10-14に取得。
- Yeap BB、Voon DC、Vivian JP、McCulloch RK、Thomson AM、Giles KM、Czyzyk-Krzeska MF、Furneaux H、Wilce MC、Wilce JA、Leedman PJ (2002)。「アンドロゲン受容体メッセンジャーRNAの3'非翻訳領域内の保存されたUCリッチモチーフへのHuRおよびポリ(C)結合タンパク質の新規結合」。J . Biol. Chem . 277 (30): 27183–92. doi : 10.1074/jbc.M202883200 . PMID 12011088。
- Walter BL、Parsley TB、Ehrenfeld E、Semler BL (2002)。「ポリオウイルスの翻訳開始とウイルスRNA複製のための明確なポリ(rC)結合タンパク質KHドメイン決定因子」。J . Virol . 76 (23): 12008–22. doi :10.1128/JVI.76.23.12008-12022.2002. PMC 136902. PMID 12414943 。
- Abraham RS、Geyer SM、Price-Troska TL、Allmer C、Kyle RA、Gertz MA、Fonseca R (2003)。「免疫グロブリン軽鎖可変 (V) 領域遺伝子は軽鎖関連アミロイドーシス (AL) の臨床症状と転帰に影響を与える」。Blood . 101 ( 10 ): 3801–8. doi :10.1182/blood-2002-09-2707. PMID 12515719. S2CID 38371635.
- Pickering BM、Mitchell SA、Evans JR、Willis AE (2003)。「ポリピリミジン トラクト結合タンパク質とポリ r(C) 結合タンパク質 1 は BAG-1 IRES と相互作用し、in vitro および in vivo でその活性を刺激する」。Nucleic Acids Res . 31 (2): 639–46. doi :10.1093/nar/gkg146. PMC 140511 . PMID 12527772。