ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| OCRL |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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4CMN、2KIE、2QV2、3QBT、3QIS |
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| 識別子 |
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| エイリアス | OCRL、LOCR、NPHL2、OCRL-1、OCRL1、ロウ眼脳腎症候群、イノシトールポリリン酸-5-ホスファターゼ、OCRLイノシトールポリリン酸-5-ホスファターゼ、INPP5F、Dent-2、DENT2 |
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| 外部ID | オミム:300535; MGI : 109589;ホモロジーン: 233;ジーンカード:OCRL; OMA :OCRL - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | X染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | X|X A5 | 始める | 47,912,387 bp [2] |
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| 終わり | 47,965,868 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - ブロードマン領域10
- 胃粘膜
- 正面ポール
- ランゲルハンス島
- 左卵巣
- 右副腎皮質
- 下垂体前葉
- 左副腎
- 左副腎皮質
- 右精巣
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| | トップの表現 | - 耳石器官
- 卵形嚢
- 胎児の尾
- 一次視覚野
- 上前頭回
- 太ももの筋肉
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 腹内側核
- 性器結節
- 副腎
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ホスファチジルイノシトール-4,5-ビスリン酸5-ホスファターゼ活性
- タンパク質結合
- 加水分解酵素活性
- GTPase活性化活性
- イノシトール-1,4,5-トリスリン酸5-ホスファターゼ活性
- イノシトール-1,3,4,5-テトラキスリン酸5-ホスファターゼ活性
- ホスファチジルイノシトールリン酸4-ホスファターゼ活性
- ホスファチジルイノシトール-3,5-ビスリン酸5-ホスファターゼ活性
- イノシトールリン酸ホスファターゼ活性
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- 細胞質
- エンドソーム
- 食細胞小胞膜
- ゴルジ体
- 細胞投影
- 初期エンドソーム膜
- 膜
- 細胞膜
- 繊毛
- ゴルジ体小胞
- トランスゴルジネットワーク
- 初期エンドソーム
- ゴルジ体
- クラスリン被覆ピット
- 細胞質小胞
- 核
- クラスリン被覆小胞
- 光受容体外節
| | 生物学的プロセス |
- 脂質代謝
- GTPase活性の調節
- 子宮内胎児発育
- イノシトールリン酸代謝プロセス
- 細胞投影組織
- ホスファチジルイノシトール脱リン酸化
- ホスファチジルイノシトール生合成プロセス
- 低分子量GTPaseを介したシグナル伝達の制御
- シグナル伝達
- GTPase活性の正の調節
- ホスファチジルイノシトール-3-リン酸の生合成プロセス
- 繊毛アセンブリ
- 膜組織
- イノシトールリン酸の脱リン酸化
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_000276 NM_001587 NM_001318784 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_000267 NP_001305713 NP_001578 |
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| 場所 (UCSC) | 染色体X: 129.54 – 129.59 Mb | 染色体X: 47.91 – 47.97 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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イノシトールポリリン酸5-ホスファターゼOCRL-1は、ロウ眼脳腎症候群タンパク質としても知られ、ヒトのX染色体上に位置するOCRL遺伝子によってコードされる酵素です。[5]
この遺伝子はイノシトールポリリン酸 5-ホスファターゼをコードします。原因遺伝子座は Xq26.1 にあります。このホスファターゼ酵素は膜輸送アクチン重合の調節に一部関与しており、トランスゴルジネットワークのいくつかの細胞内部分にあります。
OCRL-1の欠損は眼脳腎症候群[6]と関連しており、デント病[7] [8]とも関連していることが報告されている。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000122126 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000001173 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: Lowe の眼脳腎症候群」。
- ^ Kawano T, Indo Y, Nakazato H, Shimadzu M, Matsuda I (1998 年 6 月). 「Lowe の眼脳腎症候群:異なる表現型を持つ 3 人の患者に由来するOCRL1遺伝子の 3 つの変異」Am. J. Med. Genet . 77 (5): 348–55. doi :10.1002/(SICI)1096-8628(19980605)77:5<348::AID-AJMG2>3.0.CO;2-J. PMID 9632163.
- ^ ヒトにおけるオンラインメンデル遺伝(OMIM): 300555
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さらに読む
- Ross MT、 Grafham DV、Coffey AJ 、他 (2005)。「ヒトX染色体のDNA配列」。Nature 434 ( 7031 ): 325–37。Bibcode :2005Natur.434..325R。doi : 10.1038 /nature03440。PMC 2665286。PMID 15772651。
- Erdmann KS、Mao Y、McCrea HJ、他 (2007)。「エンドサイトーシス経路の初期段階におけるロウ症候群タンパク質 OCRL の役割」。Dev . Cell . 13 (3): 377–90. doi :10.1016/j.devcel.2007.08.004. PMC 2025683. PMID 17765681 。
- Hyvola N、Diao A、McKenzie E 他(2006)。 「rab GTPアーゼによるロー症候群タンパク質OCRL1の膜標的化と活性化」。エンボ J . 25 (16): 3750–61。土井:10.1038/sj.emboj.7601274。PMC 1553191。PMID 16902405。
- Mao Y、Balkin DM、Zoncu R、et al. (2009)。「OCRL 内の PH ドメインはクラスリン介在膜輸送とホスホイノシチド代謝を橋渡しする」。EMBO J. 28 ( 13): 1831–42. doi :10.1038/emboj.2009.155. PMC 2711190. PMID 19536138 。
- Suchy SF、Cronin JC、Nussbaum RL (2009)。「PIP(2) 5-ホスファターゼ、ocrl1が欠損した線維芽細胞における異常なブラジキニンシグナル伝達」。J . Inherit. Metab. Dis . 32 (2): 280–8. doi :10.1007/s10545-009-1058-3. PMID 19172411. S2CID 31583330.
- Wu F, Reed AA, Williams SE, et al. (2009). 「デント病患者における CLC-5、コフィリン、CLC-4 の変異解析」Nephron Physiol . 112 (4): 53–62. doi :10.1159/000225944. PMID 19546591. S2CID 24946606.
- Coon BG、Mukherjee D、Hanna CB、他 (2009)。「ロウ症候群患者の線維芽細胞は、相同なInpp5bホスファターゼでは回復できないOcrl1特異的細胞移動障害を示す」。Hum . Mol. Genet . 18 (23): 4478–91. doi : 10.1093/hmg/ddp407 . PMC 7289333. PMID 19700499 。
- Tosetto E、Addis M、Caridi G、他 (2009)。「デント病の遺伝子座異質性:CLCN5 変異のない患者における OCRL1 および TMEM27 遺伝子」。 小児腎臓24 ( 10): 1967–73。doi : 10.1007 /s00467-009-1228-4。PMID 19582483。S2CID 25741167 。
- Faucherre A、Desbois P、Nagano F、他 (2005)。「ロウ症候群タンパク質 Ocrl1 は Rac GTPase 活性化により膜ラッフルに移行します: ロウ症候群の病態生理学に関する新たな視点」。Hum . Mol. Genet . 14 (11): 1441–8. doi : 10.1093/hmg/ddi153 . PMID 15829501。
- Shrimpton AE、Hoopes RR、Knohl SJ、他 (2009)。「Dent 2 患者における OCRL1 変異は表現型の変動のメカニズムを示唆する」。Nephron Physiol . 112 (2): 27–36. doi :10.1159/000213506. PMID 19390221. S2CID 21834343.
- 関根 剛、野津 健、アイアンガー 理、他 (2007)。「日本のデント病表現型患者における OCRL1 変異」。小児腎臓学会誌22 ( 7) : 975–80。doi : 10.1007 /s00467-007-0454-x。PMID 17384968。S2CID 20047399 。
- Chabaâ L、Monnier N、Dahri S、他。 (2006)。 「[眼脳腎ロウ症候群:モロッコ人患者における臨床的、生化学的、分子的研究]」。アン。バイオル。クリン。 (パリ)。64 (1): 53-9。PMID 16420990。
- Choudhury R、Diao A、Zhang F、他 (2005)。「ロウ症候群タンパク質 OCRL1 はクラスリンと相互作用し、エンドソームとトランスゴルジネットワーク間のタンパク質輸送を制御する」。Mol . Biol. Cell . 16 (8): 3467–79. doi :10.1091/mbc.E05-02-0120. PMC 1182289. PMID 15917292 。
- Sethi SK、Bagga A、Gulati A、et al. (2008)。「ロウ症候群のインド人小児におけるOCRL1遺伝子の変異」。Clin . Exp. Nephrol . 12 (5): 358–62. doi :10.1007/s10157-008-0059-0. PMID 18500547. S2CID 3458176.
- Cui S、Guerriero CJ、Szalinski CM、et al. (2010)。「腎上皮膜輸送におけるOCRL1機能」。Am . J. Physiol. Renal Physiol . 298 (2): F335-45. doi :10.1152/ajprenal.00453.2009. PMC 2822509. PMID 19940034 。
- McCrea HJ、Paradise S、Tomasini L、et al. (2008)。「OCRL の ASH-RhoGAP ドメインにおける既知のすべての患者変異は、標的化と APPL1 結合に影響します」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 369 (2): 493–9. doi :10.1016/j.bbrc.2008.02.067. PMC 2442618. PMID 18307981 。
- Hoopes RR、Shrimpton AE、Knohl SJ、et al. (2005)。「OCRL1 の変異を伴う Dent 病」。Am . J. Hum. Genet . 76 (2): 260–7. doi :10.1086/427887. PMC 1196371. PMID 15627218 。
- Levtchenko EN、Monnens LA、 Bökenkamp A、Knoers NV (2007)。「遺伝子から病気へ:CLCN5 および OCRL1 遺伝子の異常によって引き起こされるデント病」。Ned Tijdschr Geneeskd。151 ( 43): 2377–80。PMID 18019214 。
- Choudhury R、Noakes CJ、McKenzie E、et al. (2009)。「OCRL1 スプライスアイソフォームの異なるクラスリン結合と細胞内局在」。J . Biol. Chem . 284 (15): 9965–73. doi : 10.1074/jbc.M807442200 . PMC 2665120. PMID 19211563 。
- Swan LE、Tomasini L、Pirruccello M、et al. (2010)。「APPL1 と共通の OCRL 結合モチーフを共有する 2 つの密接に関連したエンドサイトーシスタンパク質」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 107 (8): 3511–6。Bibcode :2010PNAS..107.3511S。doi : 10.1073 /pnas.0914658107 . PMC 2840420 . PMID 20133602。
外部リンク
- GeneReviews/NCBI/NIH/UW のロー症候群に関するエントリー
- 米国国立医学図書館の医学件名標目表(MeSH)の OCRL+タンパク質、+ヒト
- PDBe-KBは、ヒトイノシトールポリリン酸5-ホスファターゼOCRL-1のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要を提供します。