ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
NUP58 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 4JO7、4JO9、4JQ5、5IJN、5IJO
識別子 エイリアス NUP58 、PRO2463、NUPL1、NUP45、核ポリン58kDa、核ポリン58 外部ID オミム ：607615; MGI : 1919094; ホモロジーン : 40924; ジーンカード ：NUP58; OMA :NUP58 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 14番染色体（マウス） [2] バンド 14|14 D1 始める 60,442,731 bp [2] 終わり 60,488,956 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 生殖腺 アキレス腱 右精巣 睾丸 左精巣 神経節隆起 心室帯 単球 下垂体前葉 軟骨組織
トップの表現 積雲細胞 顆頭 原始的な線 毛包 結膜円蓋 窩 生殖腺隆起 尿管 三叉神経節 パネートセル
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能 細胞成分
核膜 核膜 膜 核 核孔 タンパク質含有複合体 宿主細胞 生物学的プロセス
mRNA輸送 タンパク質ヘテロ四量体化 タンパク質ヘテロオリゴマー化 核細胞質輸送 核へのタンパク質輸入の調節 タンパク質輸送 ウイルスプロセス タンパク質ホモオリゴマー化 核からのmRNAの輸出 核へのタンパク質の輸入 タンパク質ヘテロ三量体化 解糖系の調節 核からのtRNAの輸出 タンパク質SUMO化 ウイルス転写 miRNAによる遺伝子サイレンシングの制御 ウイルスの細胞内輸送 熱に対する細胞反応の調節 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001008564 NM_001008565 NM_014089 NM_014778
NM_170591 NM_001362439 NM_001362440
RefSeq (タンパク質) NP_733479 NP_001349368 NP_001349369
場所 (UCSC) 13章: 25.3 – 25.37 Mb 14 章: 60.44 – 60.49 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
ヌクレオポリンp58/p45 は、ヒトでは NUPL1 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
この遺伝子は、ラットの核孔 p58 と 87% の配列同一性を持つ核孔 ファミリーのメンバーをコードします 。このタンパク質は核縁に局在し、 核孔複合体 (NPC) の構成要素です。
核に出入りするすべての分子は、NPCを介して拡散するか、NPCによって能動的に輸送される。 異なる アイソフォームをコードする代替転写 スプライスバリアントが 特徴付けられている。 [6]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000139496 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000114797 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 石川 健、永瀬 剛、中島 大輔、関 直、大平 正治、宮島 直、田中 明、小谷 秀、野村 直、小原 修 (1998 年 2 月)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。VIII. 試験管内で大きなタンパク質をコードする脳由来の 78 個の新しい cDNA クローン」。DNA Res . 4 (5): 307–13. doi : 10.1093/dnares/4.5.307 . PMID 9455477。 ^ ab "Entrez Gene: NUPL1 核ポリン様 1"。
さらに読む
Buss F, Stewart M (1995). 「ラット核孔の核孔p62複合体における高分子相互作用：核孔p54のp62ロッドドメインへの結合」 J. Cell Biol . 128 (3): 251–61. doi :10.1083/jcb.128.3.251. PMC 2120351. PMID 7531196 . Bonaldo MF、Lennon G、Soares MB (1997)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする 2 つのアプローチ」。Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548。 Ben-Efraim I、Gerace L (2001)。「核輸入経路に沿った核ポリンに対するインポーチンβの親和性増加の勾配」。J . Cell Biol . 152 (2): 411–7. doi :10.1083/jcb.152.2.411. PMC 2199621. PMID 11266456 。 Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。 Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, et al. (2004). 「ヒトとマウスの遺伝子の配列比較によりプロモーター領域に相同ブロック構造が発見される」 Genome Res . 14 (9): 1711–8. doi :10.1101/gr.2435604. PMC 515316. PMID 15342556 . Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの状況、品質、および拡張: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。 Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
