ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| NLRX1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | NLRX1、CLR11.3、DLNB26、NOD26、NOD5、NOD9、NLRファミリーメンバーX1 |
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| 外部ID | オミム:611947; MGI : 2429611;ホモロジーン: 11623;ジーンカード:NLRX1; OMA :NLRX1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 9番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 9|9 A5.2 | 始める | 44,164,014 bp [2] |
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| 終わり | 44,179,896 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 食道上皮
- 人間のペニス
- 外陰部
- 咽頭粘膜
- 心の頂点
- 歯肉上皮
- 口腔
- 太ももの筋肉
- 腕の皮膚
- 上腕三頭筋
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| | トップの表現 | - 顆粒球
- 舌の上側
- 胆嚢
- 回腸上皮
- 毛包
- 足首関節
- 結膜円蓋
- 太ももの筋肉
- 血
- 足底筋
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- ミトコンドリア外膜
- 膜
- ミトコンドリア
- 細胞膜
- 細胞接合
- 細胞質
| | 生物学的プロセス |
- インターロイキン6産生の抑制
- I型インターフェロン産生の抑制
- ウイルスプロセス
- 炎症反応の抑制
- インターフェロンβ産生の抑制
- RIG-Iシグナル伝達経路の負の調節
- I-κBキナーゼ/NF-κBシグナル伝達の負の制御
- 免疫システムのプロセス
- 自然免疫反応の抑制
- 先天性免疫反応
- 細胞内シグナル伝達
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001282143 NM_001282144 NM_001282358 NM_024618 NM_170722 |
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NM_001163742 NM_001163743 NM_178420 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001269072 NP_001269073 NP_001269287 NP_078894 |
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NP_001157214 NP_001157215 NP_848507 |
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| 場所 (UCSC) | 11 章: 119.17 – 119.18 Mb | 9 章: 44.16 – 44.18 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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NLRX1またはNLRファミリーメンバーX1は、ヌクレオチド結合オリゴマー化ドメイン、ロイシンリッチリピートを含むX1の略で、ヒトではNLRX1遺伝子によってコードされるタンパク質です。[5] [6] NOD様受容体X1、NLRファミリー、X1、NOD5、NOD9、およびCLR11.3 としても知られ、パターン認識受容体のNOD様受容体ファミリーのメンバーです。
関数
NLRX1は、免疫系で役割を果たす細胞内タンパク質です。NLRX1は、ミトコンドリア抗ウイルスシグナル伝達タンパク質(MAVS)/レチノイン酸誘導遺伝子I(RIG-I)ミトコンドリア抗ウイルス経路を阻害することで、ウイルスに対する自然免疫に影響を与えると提案されています。[7]しかし、これは最近疑問視されています。[8] [9]
NLRX1 はクラミジア・トラコマティスやヘリコバクター・ピロリなどの細菌感染時に、単核食細胞の細菌負荷と炎症を調節することで宿主免疫にも関与している。NLRX1 の調節メカニズムは十分に解明されていないが、計算モデルによる予測では、NLRX1 のレベルは感染後早期に誘導される負のフィードバック回路によって制御される可能性があることが示唆されている。[10] [11] [12]
構造
NLRX1は、ミトコンドリア局在シグナルを含むN末端エフェクタードメイン、中央のNACHTドメイン、C末端のロイシンリッチリピート(LRR)ドメインの3つのタンパク質ドメインから構成されるユニークなタンパク質構造を持っています。[13]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000160703 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000032109 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「Entrez Gene: NLRファミリーメンバーX1」。
- ^ Inohara N, Nuñez G (2003 年 5 月). 「NOD: 炎症とアポトーシスに関与する細胞内タンパク質」. Nature Reviews. 免疫学. 3 (5): 371– 82. doi :10.1038/nri1086. PMID 12766759. S2CID 8088987.
- ^ O'Neill LA (2008年4月). 「自然免疫:NLRX1による抗ウイルスシグナルの抑制」. Current Biology . 18 (7): R302-4. Bibcode :2008CBio...18.R302O. doi : 10.1016/j.cub.2008.02.021 . PMID 18397740. S2CID 18188728.
- ^ Rebsamen M、Vazquez J、Tardivel A、 Guarda G、Curran J、Tschopp J (2011 年 8 月)。 「 NLRX1/NOD5 欠損 はMAVSシグナル伝達に影響しない」。細胞死と分化。18 (8): 1387。doi :10.1038/cdd.2011.64。PMC 3172102。PMID 21617692。
- ^ Soares F, Tattoli I, Wortzman ME, Arnoult D, Philpott DJ, Girardin SE (2013). 「NLRX1はMAVS依存性抗ウイルスシグナル伝達を阻害しない」. Innate Immunity . 19 (4): 438– 48. doi : 10.1177/1753425912467383 . PMID 23212541. S2CID 20642957.
- ^ Castaño-Rodríguez N, Kaakoush NO, Goh KL, Fock KM, Mitchell HM (2014-01-01). 「ヘリコバクターピロリ感染および関連する胃がんにおけるNOD様受容体シグナル伝達経路:症例対照研究および遺伝子発現解析」. PLOS ONE . 9 (6): e98899. Bibcode :2014PLoSO...998899C. doi : 10.1371/journal.pone.0098899 . PMC 4047072. PMID 24901306 .
- ^ Philipson CW, Bassaganya-Riera J, Viladomiu M, Kronsteiner B, Abedi V, Hoops S, Michalak P, Kang L, Girardin SE, Hontecillas R (2015-01-01). 「NLRX1 が Helicobacter pylori 感染に対する自然免疫応答を調節する制御メカニズムのモデル化」. PLOS ONE . 10 (9): e0137839. Bibcode :2015PLoSO..1037839P. doi : 10.1371/journal.pone.0137839 . PMC 4569576. PMID 26367386 .
- ^ Abdul-Sater AA、Saïd-Sadier N、Lam VM、Singh B、Pettengill MA、Soares F、Tattoli I、Lipinski S、Girardin SE、Rosenstiel P、Ojcius DM (2010 年 12 月)。「ミトコンドリア Nod 様ファミリー メンバー NLRX1 による活性酸素種の産生とクラミジア感染の促進」。The Journal of Biological Chemistry。285 ( 53 ): 41637– 45。doi : 10.1074/ jbc.M110.137885。PMC 3009891。PMID 20959452。
- ^ Meylan E, Tschopp J (2008年3月). 「NLRX1: 味方か敵か?」EMBO Reports . 9 (3): 243–5 . doi :10.1038/embor.2008.23. PMC 2267384. PMID 18311173 .
さらに読む
- Moore CB、Bergstralh DT、Duncan JA、Lei Y、Morrison TE、Zimmermann AG、Accavitti-Loper MA、Madden VJ、Sun L、Ye Z、Lich JD、Heise MT、Chen Z、Ting JP (2008 年 1 月)。「NLRX1 はミトコンドリアの抗ウイルス免疫の調節因子である」。Nature . 451 ( 7178 ) : 573– 7。Bibcode : 2008Natur.451..573M。doi : 10.1038/nature06501。PMID 18200010。
- Tattoli I、Carneiro LA、Jéhanno M、Magalhaes JG、Shu Y、Philpott DJ、Arnoult D、Girardin SE (2008 年 3 月)。「NLRX1 は、活性酸素種の生成を誘導することで NF-kappaB および JNK 経路を増幅するミトコンドリア NOD 様受容体です」。EMBOレポート。9 ( 3 ): 293– 300。doi :10.1038 / sj.embor.7401161。PMC 2267388。PMID 18219313 。
- Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」. Gene . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Arnoult D、Soares F、Tattoli I、Castanier C、Philpott DJ、Girardin SE (2009 年 9 月)。「N末端アドレス指定配列はNLRX1をミトコンドリアマトリックスに誘導する」。Journal of Cell Science。122 ( Pt 17): 3161– 8。doi :10.1242/jcs.051193。PMC 2871076。PMID 19692591。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.