ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| NFATC1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | NFATC1、NF-ATC、NFAT2、NFATc、NF-ATc1.2、活性化T細胞核因子1、活性化T細胞核因子1 |
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| 外部ID | オミム:600489; MGI : 102469;ホモロジーン: 32336;ジーンカード: NFATC1; OMA :NFATC1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 18番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 18 E3|18 53.66 cM | 始める | 80,649,420 bp [2] |
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| 終わり | 80,756,286 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 卵母細胞
- 太ももの筋肉
- 二次卵母細胞
- 腹直筋の骨格筋組織
- 上腕三頭筋
- 腓腹筋
- 上腕二頭筋の骨格筋組織
- 腓骨神経
- 臀筋
- 外側広筋
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| | トップの表現 | - 顆粒球
- 腸間膜リンパ節
- 心内膜クッション
- 上腕三頭筋
- 太ももの筋肉
- 嗅上皮
- 膝関節
- 側頭筋
- 血
- 足首
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
- DNA結合
- RNAポリメラーゼII転写調節領域配列特異的DNA結合
- DNA結合転写因子活性
- マイトジェン活性化タンパク質キナーゼp38結合
- FK506バインディング
- DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- タンパク質結合
- 転写因子活性、RNAポリメラーゼII遠位エンハンサー配列特異的結合
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- クロマチン結合
- 転写因子結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- 細胞質
- 核
- 核質
- 核体
- 転写制御因子複合体
| | 生物学的プロセス |
- 細胞内シグナル伝達
- 転写の調節、DNAテンプレート
- カルシニューリン-NFATシグナル伝達カスケード
- RNAポリメラーゼIIによる転写
- 転写、DNAテンプレート
- 転写の正の制御、DNAテンプレート
- Fc-ε受容体シグナル伝達経路
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
- Wntシグナル伝達経路、カルシウム調節経路
- Wntシグナル伝達経路の負の調節
- 血管関連平滑筋細胞分化の負の調節
- サイトカイン産生
- 大動脈弁の形態形成
- 肺弁の形態形成
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_172390 NM_001278669 NM_001278670 NM_001278672 NM_001278673
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NM_001278675 NM_006162 NM_172387 NM_172388 NM_172389 |
| NM_001164109 NM_001164110 NM_001164111 NM_001164112 NM_016791
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NM_198429 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001265598 NP_001265599 NP_001265601 NP_001265602 NP_001265604
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NP_006153 NP_765975 NP_765976 NP_765977 NP_765978 |
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| 場所 (UCSC) | 18章: 79.4 – 79.53 Mb | 18 章: 80.65 – 80.76 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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活性化T細胞核因子細胞質1は、ヒトではNFATC1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
関数
この遺伝子の産物は、活性化T細胞核因子DNA結合転写複合体の成分である。この複合体は、少なくとも2つの成分、すなわちT細胞受容体(TCR)刺激により核に転座する既存の細胞質成分と誘導性核成分から構成される。この転写因子ファミリーに属するタンパク質は、免疫応答中の誘導性遺伝子転写において中心的な役割を果たす。この遺伝子の産物は誘導性核成分である。これは、シクロスポリンなどの免疫抑制剤の主要な分子標的として機能する。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする5つの転写バリアントが同定されている。このタンパク質の異なるアイソフォームは、異なるサイトカイン遺伝子の誘導性発現を制御する可能性がある。[6]
インタラクション
NFATC1はPIM1と相互作用することが示されている。[7]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000131196 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000033016 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Northrop JP、Ho SN、Chen L、Thomas DJ、Timmerman LA、Nolan GP、Admon A、Crabtree GR (1994 年 6 月)。「NF-AT 成分は T 細胞活性化の標的となる転写因子ファミリーを定義する」。Nature。369 ( 6480 ) : 497–502。Bibcode : 1994Natur.369..497N。doi : 10.1038/369497a0。PMID 8202141。S2CID 9920546。
- ^ 「Entrez Gene: 活性化T細胞の核因子NFATC1、細胞質、カルシニューリン依存性1」。
- ^ Rainio EM、Sandholm J、Koskinen PJ (2002 年 2 月)。「最先端: NFATc1 の転写活性は Pim-1 キナーゼによって強化される」。Journal of Immunology。168 ( 4): 1524–7。doi : 10.4049 /jimmunol.168.4.1524。PMID 11823475。
さらに読む
- Rao A、Luo C 、 Hogan PG (1997)。「NFAT ファミリーの転写因子: 制御と機能」。Annual Review of Immunology。15 : 707–47。doi : 10.1146 /annurev.immunol.15.1.707。PMID 9143705 。
- Crabtree GR (1999年3月)。「一般的なシグナルと特定の結果: Ca2+、カルシニューリン、NF-ATを介したシグナル伝達」。Cell . 96 ( 5): 611–4. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80571-1 . PMID 10089876. S2CID 8817053.
- Horsley V、 Pavlath GK (2002 年 3 月)。 「NFAT : 細胞分化と適応の普遍的な調節因子」。The Journal of Cell Biology。156 ( 5): 771–4。doi :10.1083/jcb.200111073。PMC 2173310。PMID 11877454。
- Tolstrup M、Ostergaard L、Laursen AL、Pedersen SF、Duch M (2004 年 4 月)。 「HIV/SIVは免疫監視から逃れる:Nefに焦点を当てる」。現在の HIV 研究。2 (2): 141-51。土井:10.2174/1570162043484924。PMID 15078178。
- Li X、Ho SN、Luna J、Giacalone J、Thomas DJ、Timmerman LA、Crabtree GR、Francke U (1995)。「T 細胞転写因子 NFATc および NFATp のヒトおよびマウス遺伝子のクローニングと染色体局在」。細胞遺伝学および細胞遺伝学。68 (3–4 ) : 185–91。doi :10.1159/000133910。PMID 7842733。
- Jabado N、Le Deist F、Fisher A、Hivroz C (1994 年 11 月)。「HIV gp120 および抗 CD4 抗体とヒト CD4+ T 細胞上の CD4 分子との相互作用は、インターロイキン 2 遺伝子エンハンサー活性を制御する 3 つの核因子である NF-AT、NF-kappa B、および AP-1 の結合活性を阻害する」。European Journal of Immunology。24 ( 11 ): 2646–52。doi : 10.1002 /eji.1830241112。PMID 7957556。S2CID 30435577。
- Vacca A、Farina M、Maroder M、Alesse E、Screpanti I、Frati L、Gulino A (1994 年 11 月)。「ヒト免疫不全ウイルス 1 型 tat は、ホルボールエステルとの相乗作用およびカルシウム媒介による NF-AT シス調節モチーフの活性化を通じて、インターロイキン 2 プロモーター活性を増強する」。生化学および生物物理学的研究通信。205 (1): 467–74。doi :10.1006/bbrc.1994.2689。PMID 7999066 。
- Park J、Takeuchi A、Sharma S (1996 年 8 月)。「 NFAT (活性化 T 細胞核因子) 遺伝子ファミリーのメンバー NFATc の新しいアイソフォームの特性」。The Journal of Biological Chemistry。271 ( 34): 20914–21。doi : 10.1074 /jbc.271.34.20914。PMID 8702849。
- Di Somma MM、Majolini MB、Burastero SE 、 Telford JL、Baldari CT (1996 年 9 月)。「HIV-1 長末端反復配列のシクロスポリン A 感受性により、CD4 の誘発によって活性化される異なる p56lck 依存性経路が特定される」。European Journal of Immunology。26 ( 9 ) : 2181–8。doi :10.1002/eji.1830260933。PMID 8814265。S2CID 23430217。
- Beals CR、Sheridan CM、Turck CW、Gardner P、Crabtree GR (1997 年 3 月)。「グリコーゲン合成酵素キナーゼ 3 によって強化された NF-ATc の核輸出」。Science . 275 ( 5308): 1930–4. doi :10.1126/science.275.5308.1930. PMID 9072970. S2CID 22590899。
- Kinoshita S, Su L, Amano M, Timmerman LA, Kaneshima H, Nolan GP (1997年3月). 「T細胞活性化因子NF-ATcはT細胞におけるHIV-1の複製と遺伝子発現を正に制御する」.免疫. 6 (3): 235–44. doi : 10.1016/S1074-7613(00)80326-X . PMID 9075924.
- Zhou P、Sun LJ、Dötsch V、Wagner G、Verdine GL (1998 年 3 月)。「コア NFATC1/DNA 複合体の溶液構造」。Cell . 92 (5): 687–96. doi : 10.1016/S0092-8674 ( 00)81136-8 . PMID 9506523. S2CID 16009648.
- Kinoshita S, Chen BK, Kaneshima H, Nolan GP (1998年11月). 「活性化T細胞の核因子によるT細胞におけるHIV-1寄生の宿主制御」. Cell . 95 (5): 595–604. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81630-X . PMID 9845362. S2CID 17954556.
- Chuvpilo S、Zimmer M、Kerstan A、Glöckner J、Avots A、Escher C、Fischer C、Inashkina I、Jankevics E、Berberich-Siebelt F、Schmitt E、Serfling E (1999 年 2 月)。「代替ポリアデニル化イベントはエフェクター T 細胞における NF-ATc の誘導に寄与する」。免疫。10 ( 2): 261–9。doi : 10.1016 / S1074-7613 (00)80026-6。PMID 10072078。
- Chuvpilo S、Avots A、Berberich-Siebelt F、Glöckner J、Fischer C、Kerstan A、Escher C、Inashkina I、Hlubek F、Jankevics E、Brabletz T、Serfling E (1999 年 6 月)。「T リンパ球では、個別の転写特性を持つ複数の NF-ATc アイソフォームが合成される」。Journal of Immunology。162 ( 12 ): 7294–301。doi : 10.4049 / jimmunol.162.12.7294。PMID 10358178。S2CID 26133892 。
- Wang JK、Kiyokawa E、Verdin E、Trono D (2000 年 1 月)。「HIV-1 の Nef タンパク質はラフトと会合し、T 細胞を活性化に誘導する」。米国科学アカデミー紀要。97 (1): 394–9。Bibcode :2000PNAS... 97..394W。doi : 10.1073 / pnas.97.1.394。PMC 26674。PMID 10618429。
- Porter CM、 Havens MA、 Clipstone NA (2000 年 2 月)。「NFATc 細胞内局在の調節に 関与するアミノ酸残基とタンパク質キナーゼの同定」。The Journal of Biological Chemistry。275 ( 5): 3543–51。doi : 10.1074/jbc.275.5.3543。PMID 10652349。
外部リンク
- 米国国立医学図書館の医学主題標目表(MeSH)における NFATC1+タンパク質、+ヒト
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。