ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| MATN2 |
|---|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | MATN2、マトリリン2 |
|---|
| 外部ID | オミム:602108; MGI : 109613;ホモロジーン: 20538;ジーンカード:MATN2; OMA :MATN2 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | クロ。 | 15番染色体(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 15|15 B3.1 | 始める | 34,306,823 bp [2] |
|---|
| 終わり | 34,436,419 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| トップの表現 | - 脛骨
- 三叉神経節
- 脊髄神経節
- 精嚢
- 子宮頸管
- アキレス腱
- 精巣上体の尾
- 甲状腺
- 右卵巣
- 甲状腺の左葉
|
| | トップの表現 | - 外頸動脈
- 輸出管
- 精管
- 坐骨神経
- 内頸動脈
- 精嚢
- 生殖腺隆起
- 大動脈外膜
- 頸部
- 脱落膜
|
| | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- カルシウムイオン結合
- タンパク質結合
- 分子機能
- 細胞外マトリックス構造成分
| | 細胞成分 |
- 細胞外領域
- 基底膜
- 細胞外マトリックス
- 細胞外空間
- コラーゲン含有細胞外マトリックス
| | 生物学的プロセス |
- グリア細胞の移動
- 樹状突起再生
- 軸索誘導
- ニューロンの移動
- 軸索損傷に対する反応
- ニューロン投射の発達
- 生物学的プロセス
- 成長板軟骨軟骨細胞の形態形成
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オルソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | | |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | |
|---|
NM_002380 NM_030583 NM_001317748 |
| |
|---|
| RefSeq (タンパク質) | |
|---|
NP_001304677 NP_002371 NP_085072 |
| |
|---|
| 場所 (UCSC) | 8 章: 97.87 – 98.04 Mb | 15章: 34.31 – 34.44 Mb |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
マトリリン-2は、ヒトではMATN2遺伝子によってコードされるマトリリン タンパク質である。[5] [6] [7]
この遺伝子は、フォン・ヴィレブランド因子Aドメイン含有タンパク質ファミリーのメンバーをコードしています。このタンパク質ファミリーは、さまざまな組織の細胞外マトリックスにおける糸状ネットワークの形成に関与していると考えられています。このタンパク質には5つのフォン・ヴィレブランド因子Aドメインが含まれています。この遺伝子の特定の機能はまだ決定されていません。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが見つかっています。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000132561 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000022324 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Deak F、Piecha D、Bachrati C、Paulsson M、Kiss I (1997 年 5 月)。「フォン ヴィレブランド因子タイプ A 様モジュール スーパーファミリー内の軟骨マトリックス タンパク質に最も近いマトリリン 2 の一次構造と発現」。J Biol Chem . 272 ( 14): 9268–74。doi : 10.1074/jbc.272.14.9268。PMID 9083061。
- ^ Mates L、Korpos E、Deak F、Liu Z、Beier DR、Aszodi A、Kiss I (2002 年 3 月)。「細胞外マトリックスに広く分布するフィラメント形成タンパク質であるマトリリン 2 のマウス遺伝子とヒト遺伝子 (Matn2 と MATN2) の比較分析」。Matrix Biol . 21 (2): 163–74. doi :10.1016/S0945-053X(01)00194-9. PMID 11852232。
- ^ ab "Entrez Gene: MATN2 マトリリン 2"。
さらに読む
- Muratoglu S、Krysan K、Balázs M、他 (2001)。「ヒトマトリリン-2の一次構造、MATN2遺伝子の染色体位置、マトリリン遺伝子におけるAT-ACイントロンの保存」。Cytogenet。Cell Genet。90 ( 3–4 ) : 323–7。doi : 10.1159/000056797。PMID 11124542。S2CID 25764416。
- Frank S、Schulthess T、Landwehr R、他 (2002)。「マトリリンのコイルドコイルドメインの特性解析により、7 つの新規アイソフォームが明らかになった」。J . Biol. Chem . 277 (21): 19071–9. doi : 10.1074/jbc.M202146200 . PMID 11896063。
- Piecha D、Hartmann K、Kobbe B、et al. (2002)。「ヒト皮膚におけるマトリリン-2の発現」。J . Invest. Dermatol . 119 (1): 38–43. doi : 10.1046/j.1523-1747.2002.01789.x . PMID 12164922。
- Piecha D、Wiberg C、Mörgelin M、et al. (2002)。「Matrilin-2 はそれ自体および他の細胞外マトリックスタンパク質と相互作用する」。Biochem . J. 367 ( Pt 3): 715–21. doi :10.1042/BJ20021069. PMC 1222949. PMID 12180907 。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Clark HF、Gurney AL、Abaya E、他 (2003)。「分泌タンパク質発見イニシアチブ (SPDI)、新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質を同定するための大規模な取り組み: バイオインフォマティクス評価」。Genome Res . 13 (10): 2265–70. doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309 。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, et al. (2007). 「オリゴキャップ cDNA ライブラリーから分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする全長ヒト cDNA を選択するためのシリコでのシグナル配列とキーワードトラップ」。DNA Res . 12 (2): 117–26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743。
- Sharma MK、Watson MA、Lyman M 、 et al. (2006)。「Matrilin-2 発現は、臨床的に関連する毛様細胞性星細胞腫のサブセットを区別します」。 神経学。66 (1): 127–30。doi :10.1212/ 01.wnl.0000188667.66646.1c。PMID 16401863。S2CID 45662351 。
- Lim J、Hao T、Shaw C、他 (2006)。「ヒト遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性症のタンパク質間相互作用ネットワーク」。Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569. S2CID 13709685。